Gène
CLDN16
claudin 16
- HGNC 2037↗(s'ouvre dans un nouvel onglet)
- Gène Ensembl ENSG00000113946↗(s'ouvre dans un nouvel onglet)
- Gène NCBI 10686↗(s'ouvre dans un nouvel onglet)
Résumé
- Localisation cytogénétique
- 3q28
- Coordonnées
- Chromosome 3 : 190 388 163–190 412 138 (GRCh38)
- Exons
- 5 exons sur 24 kb
- Protéine
- 235 acides aminés
- Aussi appelé
- PCLN1, HOMG3
- Transcrit MANE Select
- ENST00000264734.3NM_006580.4
- Type de locus
- gene with protein product
- Très élevé
- Fiable
- Faible
- Très faible
Génome de référenceGRCh38hg38
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Hypomagnésémie familiale
- Hypomagnésémie primaire familiale
Groupe de maladies héréditaires de perte de magnésium causées par des variants de gènes tels que CLDN16, CLDN19, TRPM6, CNNM2 et FXYD2 ; les formes liées à CLDN16 et CLDN19 peuvent évoluer vers une maladie rénale chronique.
- ClinGen classe ce lien comme définitif
- 2 soumetteurs GenCC le classent comme définitif ou fort
Ce que la connaissance change
La supplémentation en magnésium permet de contrôler les symptômes, et certaines formes nécessitent une surveillance de la fonction rénale et oculaire.
Structure de CLDN16
- Séquence codante
- Région non traduite
- Intron
- Sens de la transcription
- Sites connus associés à une maladie
- Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.
Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.
Les exons représentent 3 kb sur les 24 kb du gène ; 708 de ces bases codent pour la protéine.
Comment un test génomique lit CLDN16
32
positions dans CLDN16 où ClinVar classe une modification comme pathogène ou probablement pathogène
Aucune d'entre elles ne se situe dans une région que les lectures courtes peinent à analyser.
Un génome entier couvre les 24 kb de CLDN16, introns compris, et pas seulement les 3 kb d'exons.
Gènes liés aux mêmes affections
- ATP1A1ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 1Partage 1 affection
- CLDN19claudin 19Partage 1 affection
- CNNM2cyclin and CBS domain divalent metal cation transport mediator 2Partage 1 affection
- FXYD2FXYD domain containing ion transport regulator 2Partage 1 affection
- RRAGDRas related GTP binding DPartage 1 affection
- TRPM6transient receptor potential cation channel subfamily M member 6Partage 1 affection
- TRPM7transient receptor potential cation channel subfamily M member 7Partage 1 affection
- TRPV6transient receptor potential cation channel subfamily V member 6Partage 1 affection
Traits associés à CLDN16
L'Human Phenotype Ontology répertorie ces traits comme caractéristiques des maladies rares que CLDN16 peut provoquer. La page de chaque trait indique les autres gènes qui lui sont associés.
Laboratory abnormality
- Decreased circulating calcitriol concentration
- Elevated circulating beta-CTX concentration
- Elevated creatinine
- High blood uric acid level
- High urine protein levels
- Hypercitraturia
- Hyposthenuria
- Kidney Ca wasting
Afficher 16 traits supplémentaires
- Renal magnesium wasting
- Bloody urine
- Distal renal tubular acidosis
- Elevated circulating parathyroid hormone level
- Elevated urine calcium levels
- Hypermagnesiuria
- Low blood magnesium levels
- Acidosis
- Elevated alkaline phosphatase
- High blood phosphate levels
- High urine uric acid level
- Hypocitraturia
- Low blood calcium levels
- Sterile pyuria
- Small amount of blood in urine
- Blood in urine
Liens externes
Fiches de gènes
Transcrit
Protéine
D'où viennent ces informations
- HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
- MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
- GenCC et ClinGen, publiés le 2026-10-16 : les affections auxquelles le gène est associé, et le niveau de solidité de ce lien.
- La liste ACMG des résultats secondaires, SF v3.2.
- ClinVar et les stratifications GIAB : les sites connus responsables de maladies, et les régions que les lectures courtes peinent à analyser.
- L'Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01 : les traits associés au gène. Pour en savoir plus, rendez-vous sur hpo.jax.org.
- Version des données 2026.10.16-c6eea6bf.
Citer cette page
Dante Labs. (s.d.). Gène CLDN16 : claudin 16. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/cldn16
Dante Labs. Gène CLDN16 : claudin 16 [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/cldn16
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