Gen
CLDN16
claudin 16
- HGNC 2037↗(opent in een nieuw tabblad)
- Ensembl-gen ENSG00000113946↗(opent in een nieuw tabblad)
- NCBI Gene 10686↗(opent in een nieuw tabblad)
Samenvatting
- Cytogenetische locatie
- 3q28
- Coördinaten
- Chromosoom 3: 190.388.163–190.412.138 (GRCh38)
- Exons
- 5 exons over 24 kb
- Eiwit
- 235 aminozuren
- Ook bekend als
- PCLN1, HOMG3
- MANE Select-transcript
- ENST00000264734.3NM_006580.4
- Type locus
- Protein-coding
- Zeer hoog
- Betrouwbaar
- Laag
- Zeer laag
Deze pagina als gegevens
Voeg .json toe aan het adres van de pagina, of vraag application/json aan, om haar als JSON te lezen.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/cldn16.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLees CLDN16 en de rest van uw genoom met één test.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken
Mijn Genome Test bestellenGecureerd rapport over dit gen
Familiaire hypomagnesiëmie
- Familiaire primaire hypomagnesiëmie
Een groep erfelijke aandoeningen waarbij magnesium via de urine verloren gaat, veroorzaakt door varianten in genen zoals CLDN16, CLDN19, TRPM6, CNNM2 en FXYD2. De vormen door CLDN16- en CLDN19-varianten kunnen zich ontwikkelen tot chronische nierziekte.
- ClinGen beoordeelt het verband als definitief
- 2 GenCC-indieners beoordelen het als definitief of sterk
▶Actionability
Magnesiumsuppletie kan de klachten onder controle houden. Bij sommige vormen is controle van de nierfunctie en van de ogen nodig.
Opbouw van CLDN16
- Coderende sequentie
- Niet-vertaald gebied
- Intron
- Richting van transcriptie
- Bekende ziekteveroorzakende posities
- Gebieden die korte reads moeilijk vinden
Exonen van het MANE Select-transcript van het gen (release v1.5), afkomstig van NCBI en EMBL-EBI, op het GRCh38-referentiegenoom.
Chromosoombanden uit het ideogram van UCSC's GRCh38 (2022-10-29).
Genen in de buurt uit Ensembl-release 116, op GRCh38.
Exonen vormen 3 kb van de 24 kb van het gen; 708 van die basen coderen voor het eiwit.
Sequencing van CLDN16
32
posities in CLDN16 waar ClinVar een wijziging als pathogeen of waarschijnlijk pathogeen indeelt
Geen daarvan valt in een gebied waar korte reads moeilijk zijn.
Een whole genome dekt alle 24 kb van CLDN16, inclusief intronen, en niet alleen de 3 kb aan exonen.
Genen die aan dezelfde aandoeningen zijn gekoppeld
- ATP1A1ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 1Deelt 1 aandoening
- CLDN19claudin 19Deelt 1 aandoening
- CNNM2cyclin and CBS domain divalent metal cation transport mediator 2Deelt 1 aandoening
- FXYD2FXYD domain containing ion transport regulator 2Deelt 1 aandoening
- RRAGDRas related GTP binding DDeelt 1 aandoening
- TRPM6transient receptor potential cation channel subfamily M member 6Deelt 1 aandoening
- TRPM7transient receptor potential cation channel subfamily M member 7Deelt 1 aandoening
- TRPV6transient receptor potential cation channel subfamily V member 6Deelt 1 aandoening
Kenmerken gekoppeld aan CLDN16
De Human Phenotype Ontology vermeldt deze als kenmerken van de zeldzame aandoeningen die CLDN16 kan veroorzaken. Op de pagina van elk kenmerk staan de andere genen die ermee verband houden.
Laboratory abnormality
- Decreased circulating calcitriol concentration
- Elevated circulating beta-CTX concentration
- Elevated creatinine
- High blood uric acid level
- High urine protein levels
- Hypercitraturia
- Hyposthenuria
- Kidney Ca wasting
Toon 16 kenmerken meer
- Renal magnesium wasting
- Bloody urine
- Distal renal tubular acidosis
- Elevated circulating parathyroid hormone level
- Elevated urine calcium levels
- Hypermagnesiuria
- Low blood magnesium levels
- Acidosis
- Elevated alkaline phosphatase
- High blood phosphate levels
- High urine uric acid level
- Hypocitraturia
- Low blood calcium levels
- Sterile pyuria
- Small amount of blood in urine
- Blood in urine
Externe links
Genrecords
Transcript
Eiwit
Waar dit vandaan komt
- HGNC: het symbool van het gen, de naam, andere symbolen en de locatie.
- MANE Select v1.5, van NCBI en EMBL-EBI: het transcript, de exonen en de coderende sequentie.
- GenCC en ClinGen, uitgebracht 2026-10-17: aan welke aandoeningen het gen is gekoppeld, en hoe sterk dat verband is.
- De ACMG-lijst met secundaire bevindingen, SF v3.2.
- ClinVar en de GIAB-stratificaties: bekende ziekteveroorzakende plaatsen en de regio's waar korte reads moeite mee hebben.
- De Human Phenotype Ontology, versie 2026-09-01: de kenmerken die aan het gen zijn gekoppeld. Meer informatie vindt u op hpo.jax.org.
- Gegevensrelease 2026.10.17-8666dff2.
Deze pagina citeren
Dante Labs. (z.d.). CLDN16-gen: claudin 16. Geraadpleegd op 17 oktober 2026, van https://dantelabs.com/nl/genes/cldn16
Dante Labs. CLDN16-gen: claudin 16 [Internet]. [geraadpleegd 17 oktober 2026]. Beschikbaar op: https://dantelabs.com/nl/genes/cldn16
Eén test. Een leven lang antwoorden.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken