Geeni
XPA
XPA, DNA damage recognition and repair factor
- HGNC 12814↗(avautuu uuteen välilehteen)
- Ensembl-geeni ENSG00000136936↗(avautuu uuteen välilehteen)
- NCBI Gene 7507↗(avautuu uuteen välilehteen)
Yhteenveto
- Sytogeneettinen sijainti
- 9q22.33
- Koordinaatit
- Kromosomi 9: 97 674 909–97 697 340 (GRCh38)
- Eksonit
- 6 eksonia 22,4 kb:n alueella
- Proteiini
- 273 aminohappoa
- Periytyminen
- Autosomaalinen resessiivinen
- Tunnetaan myös nimellä
- XPAC, XP1
- MANE Select -transkripti
- ENST00000375128.5NM_000380.4
- Lokustyyppi
- gene with protein product
- Erittäin korkea
- Varma
- Matala
- Erittäin matala
ViitegenomiGRCh38hg38
Geenien ja varianttien sivujen sijainnit noudattavat tätä valintaa tässä selaimessa.
Lue XPA ja muu genomisi yhdellä testillä.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa
Tilaa Genome TestTähän geeniin liittyvä kuratoitu raportti
DNA-korjausmekanismin häiriöön liittyvä sairaus
- Autosomaalinen resessiivinen
Sairaus, jonka taustalla on DNA:n korjausmekanismien häiriö.
- ClinGen luokittelee yhteyden: varma
- 6 GenCC-arvioijaa arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
Periytyminen
- Autosomaalinen resessiivinen
- Tarvitaan muuttunut kopio kummaltakin vanhemmalta. Yhdellä olet kantaja ja yleensä oireeton. Kun molemmat vanhemmat ovat kantajia, kullakin lapsella on yksi neljästä mahdollisuudesta periä kaksi muuttunutta kopiota.
XPA-geenin rakenne
- Koodaava jakso
- Translatoimaton alue
- Intron
- Transkription suunta
- Tunnetut tautia aiheuttavat kohdat
- Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.
Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).
Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.
Eksonit muodostavat 1,4 kb geenin 22,4 kb:stä; 822 näistä emäksistä koodaa proteiinia.
Miten genomitesti lukee geeniä XPA
64
XPA-geenin kohtaa, joissa ClinVar luokittelee muutoksen patogeeniseksi tai todennäköisesti patogeeniseksi
Mikään niistä ei osu alueelle, jota lyhyet lukemat löytävät vaikeasti.
Kokogenomi kattaa kaikki 22,4 kb geenistä XPA, intronit mukaan lukien, ei pelkästään 1,4 kb eksoneja.
Samoihin sairauksiin liittyvät geenit
- APTXaprataxinYhteinen sairaus: 1
- BRCA1BRCA1 DNA repair associatedYhteinen sairaus: 1
- BRCA2BRCA2 DNA repair associatedYhteinen sairaus: 1
- BRIP1BRCA1 interacting DNA helicase 1Yhteinen sairaus: 1
- COA7cytochrome c oxidase assembly factor 7Yhteinen sairaus: 1
- DCLRE1CDNA cross-link repair 1CYhteinen sairaus: 1
- DDB2damage specific DNA binding protein 2Yhteinen sairaus: 1
- ERCC1ERCC excision repair 1, endonuclease non-catalytic subunitYhteinen sairaus: 1
- ERCC2ERCC excision repair 2, TFIIH core complex helicase subunitYhteinen sairaus: 1
- ERCC3ERCC excision repair 3, TFIIH core complex helicase subunitYhteinen sairaus: 1
- ERCC4ERCC excision repair 4, endonuclease catalytic subunitYhteinen sairaus: 1
- ERCC5ERCC excision repair 5, endonucleaseYhteinen sairaus: 1
Geeniin XPA liittyvät piirteet
Human Phenotype Ontology luettelee nämä piirteinä harvinaisista sairauksista, joita XPA voi aiheuttaa. Kunkin piirteen sivulla luetellaan muut siihen liittyvät geenit.
Abnormality of head or neck
- Abnormal dentition
- Small dilated blood vessels near membrane covering front of eye and eyelids
- Abnormally small head
- Adhesion of eyelids
- Enlargement of craniofacial bones
- Everted eyelid
- Eyelid folded in
- Flat nasal alae
Näytä 2 piirrettä lisää
Ulkoiset linkit
Geenitietueet
Transkripti
Proteiini
Mistä tieto on peräisin
- HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
- MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkripti, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
- GenCC ja ClinGen, julkaisu 2026-10-16: mihin sairauksiin geeni liittyy ja kuinka vahvasti.
- ACMG:n toissijaisten löydösten luettelo, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-stratifikaatiot: tunnetut tautia aiheuttavat kohdat sekä alueet, joiden lukeminen lyhyillä luennoilla on vaikeaa.
- Human Phenotype Ontology, versio 2026-09-01: geeniin liittyvät piirteet. Lue lisää osoitteesta hpo.jax.org.
- Datajulkaisu 2026.10.16-c6eea6bf.
Viittaa tähän sivuun
Dante Labs. (n.d.). XPA-geeni: XPA, DNA damage recognition and repair factor. Haettu 16. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/xpa
Dante Labs. XPA-geeni: XPA, DNA damage recognition and repair factor [Internet]. [viitattu 16. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/xpa
Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa