Geeni
HCCS
holocytochrome c synthase
- HGNC 4837↗(avautuu uuteen välilehteen)
- Ensembl-geeni ENSG00000004961↗(avautuu uuteen välilehteen)
- NCBI Gene 3052↗(avautuu uuteen välilehteen)
Yhteenveto
- Sytogeneettinen sijainti
- Xp22.2
- Koordinaatit
- Kromosomi X: 11 111 332–11 123 086 (GRCh38)
- Eksonit
- 7 eksonia 11,8 kb:n alueella
- Proteiini
- 268 aminohappoa
- Tunnetaan myös nimellä
- CCHL
- Aiemmat symbolit
- MLS
- MANE Select -transkripti
- ENST00000380762.5NM_005333.5
- Lokustyyppi
- gene with protein product
- Erittäin korkea
- Varma
- Matala
- Erittäin matala
ViitegenomiGRCh38hg38
Geenien ja varianttien sivujen sijainnit noudattavat tätä valintaa tässä selaimessa.
Lue HCCS ja muu genomisi yhdellä testillä.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa
Tilaa Genome TestTähän geeniin liittyvä kuratoitu raportti
Mikrophthalmia, anophthalmia ja koloboma
- Oireyhtymään liittyvä mikrophthalmia
Mikrophthalmia, johon liittyy silmän ulkopuolisia piirteitä. Sen aiheuttavat muutokset geeneissä, kuten SOX2, OTX2, BCOR, STRA6 ja BMP4.
- 2 GenCC-arvioijaa arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
Mitä tieto muuttaa
Geneettinen diagnoosi ohjaa niiden liitännäisoireiden tarkastuksia, kuten aivolisäkkeen hormonihäiriöiden seurantaa SOX2- tai OTX2-muutosten yhteydessä, ja auttaa arvioimaan uusiutumisriskiä.
HCCS-geenin rakenne
- Koodaava jakso
- Translatoimaton alue
- Intron
- Transkription suunta
- Tunnetut tautia aiheuttavat kohdat
Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.
Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).
Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.
Eksonit muodostavat 2,3 kb geenin 11,8 kb:stä; 807 näistä emäksistä koodaa proteiinia.
Miten genomitesti lukee geeniä HCCS
7
HCCS-geenin kohtaa, joissa ClinVar luokittelee muutoksen patogeeniseksi tai todennäköisesti patogeeniseksi
Mikään niistä ei osu alueelle, jota lyhyet lukemat löytävät vaikeasti.
Kokogenomi kattaa kaikki 11,8 kb geenistä HCCS, intronit mukaan lukien, ei pelkästään 2,3 kb eksoneja.
Samoihin sairauksiin liittyvät geenit
- BCORBCL6 corepressorYhteinen sairaus: 1
- BMP4bone morphogenetic protein 4Yhteinen sairaus: 1
- COX7Bcytochrome c oxidase subunit 7BYhteinen sairaus: 1
- ERCC1ERCC excision repair 1, endonuclease non-catalytic subunitYhteinen sairaus: 1
- ERCC2ERCC excision repair 2, TFIIH core complex helicase subunitYhteinen sairaus: 1
- ERCC5ERCC excision repair 5, endonucleaseYhteinen sairaus: 1
- FAT1FAT atypical cadherin 1Yhteinen sairaus: 1
- HMX1H6 family homeobox 1Yhteinen sairaus: 1
- MAB21L2mab-21 like 2Yhteinen sairaus: 1
- NDUFB11NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit B11Yhteinen sairaus: 1
- OTX2orthodenticle homeobox 2Yhteinen sairaus: 1
- RAB18RAB18, member RAS oncogene familyYhteinen sairaus: 1
Geeniin HCCS liittyvät piirteet
Human Phenotype Ontology luettelee nämä piirteinä harvinaisista sairauksista, joita HCCS voi aiheuttaa. Kunkin piirteen sivulla luetellaan muut siihen liittyvät geenit.
Abnormality of head or neck
- Midface retrusion
- Abnormal eyelashes
- Abnormal facial shape
- Abnormal nasolacrimal system morphology
- Abnormality of the eyelid
- Absence of lower jaw bones
- Little lower jaw
- Receding chin
Näytä 5 piirrettä lisää
Abnormality of the genitourinary system
- Abnormal fallopian tube morphology
- Abnormality of the penis
- Abnormality of the testis
- Ambiguous external genitalia
- Enlarged clitoris
- Epispadias
- Hypospadias
- Male pseudohermaphroditism
Näytä 4 piirrettä lisää
Ulkoiset linkit
Geenitietueet
Transkripti
Proteiini
Mistä tieto on peräisin
- HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
- MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkripti, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
- GenCC ja ClinGen, julkaisu 2026-10-16: mihin sairauksiin geeni liittyy ja kuinka vahvasti.
- ACMG:n toissijaisten löydösten luettelo, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-stratifikaatiot: tunnetut tautia aiheuttavat kohdat sekä alueet, joiden lukeminen lyhyillä luennoilla on vaikeaa.
- Human Phenotype Ontology, versio 2026-09-01: geeniin liittyvät piirteet. Lue lisää osoitteesta hpo.jax.org.
- Datajulkaisu 2026.10.16-c6eea6bf.
Viittaa tähän sivuun
Dante Labs. (n.d.). HCCS-geeni: holocytochrome c synthase. Haettu 17. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/hccs
Dante Labs. HCCS-geeni: holocytochrome c synthase [Internet]. [viitattu 17. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/hccs
Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa