Genas
ABCA4
ATP binding cassette subfamily A member 4
- HGNC 34↗(atsidaro naujame skirtuke)
- Ensembl genas ENSG00000198691↗(atsidaro naujame skirtuke)
- NCBI Gene 24↗(atsidaro naujame skirtuke)
Santrauka
- Citogenetinė vieta
- 1p22.1
- Koordinatės
- Chromosoma 1: 93 992 834–94 121 148 (GRCh38)
- Eksonai
- 50 eksonų per 128,3 kb
- Baltymas
- 2 273 aminorūgščių
- Paveldėjimas
- Autosominis recesyvinis
- Taip pat žinomas kaip
- FFM, ARMD2, CORD3
- Ankstesni simboliai
- STGD1, ABCR, RP19, STGD
- MANE Select transkriptas
- ENST00000370225.4NM_000350.3
- Lokuso tipas
- gene with protein product
- Labai aukštas
- Patikimas
- Žemas
- Labai žemas
Atskaitos genomasGRCh38hg38
Pozicijos genų ir variantų puslapiuose rodomos pagal šį pasirinkimą šioje naršyklėje.
Perskaitykite ABCA4 ir likusį savo genomą su vienu tyrimu.
Nuo 449 $Nemokamas pristatymas · Rezultatai per 6–8 savaites
Įsigyti savo Genome TestKuruotos ataskaitos, susijusios su šiuo genu
Štargardto liga
- Su ABCA4 susijusi retinopatijaAutosominis recesyvinis
Tinklainės distrofija, kurią sukelia abiejų ABCA4 kopijų pokyčiai. ABCA4 yra dažniausia Stargardto ligos priežastis; ši distrofija taip pat sukelia kūgelių-lazdelių distrofiją.
- ClinGen šį ryšį įvertina kaip apibrėžtas
- 6 GenCC vertintojų įvertina jį kaip apibrėžtą arba stiprų
Paveldima geltonosios dėmės distrofija, dažniausiai susijusi su ABCA4, kuriai būdingas lipofuscino kaupimasis ir progresuojantis centrinio regėjimo praradimas.
- 3 GenCC vertintojų įvertina jį kaip apibrėžtą arba stiprų
Platesnės grupės
Retinitis pigmentosa
Vienas iš 77 su juo susijusių genų
Paveldimų tinklainės distrofijų grupė, kuriai būdingas progresuojantis lazdelių, o vėliau kolbelių fotoreceptorių netekimas, sukeliantis naktinį aklumą ir palaipsnį periferinio regėjimo praradimą.
- 1 GenCC vertintojas įvertina jį kaip apibrėžtą arba stiprų
Paveldėjimas
- Autosominis recesyvinis
- Reikia pakitusio egzemplioriaus iš kiekvieno iš tėvų. Turint vieną, esate nešiotojas ir paprastai neturite požymių; kai abu tėvai yra nešiotojai, kiekvienas vaikas su vienos iš keturių tikimybe paveldės du.
Kaip išdėstytas ABCA4
- Koduojanti seka
- Netransliuojama sritis
- Intronas
- Transkripcijos kryptis
- Žinomos su liga susijusios vietos
- Ruožai, kuriuos trumpi skaitiniai sunkiai aptinka
- Variantai su puslapiu
Geno MANE Select transkripto eksonai (išleidimas v1.5), pagal NCBI ir EMBL-EBI, GRCh38 atskaitos genome.
Chromosomų juostos pagal UCSC GRCh38 ideogramą (2022-10-29).
Netoliese esantys genai iš Ensembl leidimo 116, GRCh38.
Eksonai sudaro 7,3 kb iš 128,3 kb geno; 6 822 šių bazių koduoja baltymą.
Kaip genomo tyrimas nuskaito ABCA4
664
ABCA4 geno pozicijų, kuriose ClinVar pakitimą klasifikuoja kaip patogeninį arba tikriausiai patogeninį
Nė viena iš jų nepatenka į sritį, kurią trumpi skaitiniai sunkiai aptinka.
Viso genomo sekvenavimas apima visus 128,3 kb ABCA4 geno, įskaitant intronus, o ne tik 7,3 kb eksonų.
Variantų su puslapiais (107)
Čia pateikiami ABCA4 variantai su puslapiais, pirma – su daugiausia apžvalgos žvaigždučių. Kiekviename puslapyje aprašomas viešas ClinVar įrašas apie variantą, niekada ne rezultatas.
| Variantas | HGVS c. | Eksonas ar intronas | Pozicija (GRCh38) | ClinVar klasifikacija | Apžvalgos būsena |
|---|---|---|---|---|---|
| A960Dfs*17 | c.2879del | Eksonas 19 | 94 046 957 | Patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė |
| A967V | c.2900C>T | Eksonas 19 | 94 046 937 | Tikriausiai patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė |
| A1773V | c.5318C>T | Eksonas 38 | 94 014 685 | Patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė |
| A1791Gfs*9 | c.5371dup | Eksonas 38 | 94 014 631 | Patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė |
| c.1A>G | Eksonas 1 | 94 121 045 | Patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė | |
| c.3G>T | Eksonas 1 | 94 121 043 | Patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė | |
| c.1937+1G>A | Intronas 13 | 94 062 576 | Patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė | |
| c.3328+2T>A | Intronas 22 | 94 042 759 | Patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė | |
| c.3523-1G>A | Intronas 23 | 94 040 128 | Patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė | |
| c.4253+43G>A | Intronas 28 | 94 030 953 | Patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė |
Genai, susieti su tomis pačiomis būklėmis
- AGBL5AGBL carboxypeptidase 5Turi 1 bendrą būklę
- AHRaryl hydrocarbon receptorTuri 1 bendrą būklę
- ARHGEF18Rho/Rac guanine nucleotide exchange factor 18Turi 1 bendrą būklę
- ARL2BPARF like GTPase 2 binding proteinTuri 1 bendrą būklę
- ARL3ARF like GTPase 3Turi 1 bendrą būklę
- ARL6ARF like GTPase 6Turi 1 bendrą būklę
- BBS2Bardet-Biedl syndrome 2Turi 1 bendrą būklę
- BEST1bestrophin 1Turi 1 bendrą būklę
- CA4carbonic anhydrase 4Turi 1 bendrą būklę
- CC2D2Acoiled-coil and C2 domain containing 2ATuri 1 bendrą būklę
- CDHR1cadherin related family member 1Turi 1 bendrą būklę
- CERKLCERK like autophagy regulatorTuri 1 bendrą būklę
Savybės, susijusios su ABCA4
Žmogaus fenotipų ontologija šias savybes nurodo kaip retų ligų, kurias gali sukelti ABCA4, požymius. Kiekvienos savybės puslapyje nurodyti kiti su ja susiję genai.
Abnormality of the eye
- Abnormal color vision
- Cross-eyed
- Decreased clarity of vision
- Abnormal choroid morphology
- Abnormal electroretinogram
- Abnormal foveal morphology
- Abnormal macular pigmentation
- Abnormal retinal pigmentation
Rodyti dar 46 savybių
- Abnormality of visual evoked potentials
- Blind spot located at fixation point
- Blindness
- Difficulties with night vision
- Extreme sensitivity of the eyes to light
- Involuntary, rapid, rhythmic eye movements
- Macular degeneration
- Optic atrophy
- Paroxysmal involuntary eye movements
- Progressive night blindness
- Retina degeneration
- Retinal pigment epithelial atrophy
- Retinal pigment epithelial mottling
- Retinal thinning
- Spicular pigmentation of the retina
- Visual impairment
- Abnormal amplitude of light-adapted flicker electroretinogram
- Abnormal central response of multifocal electroretinogram
- Abnormal full-field electroretinogram
- Aplasia/Hypoplasia of the macula
- Bulging cornea
- Bull's eye maculopathy
- Color blindness
- Cystoid macular edema
- Dark choroid
- Eye muscle paralysis
- Glaucoma
- Loss of peripheral vision
- Optic disc drusen
- Optic disc pallor
- Photopsia
- Photoreceptor outer segment loss on macular OCT
- Posterior subcapsular cataract
- Progressive loss of vision
- Retinal atrophy
- Undetectable electroretinogram
- Yellow/white macular lesion
- Abnormal amplitude of light-adapted single flash electroretinogram
- Metamorphopsia
- Cone/cone-rod dystrophy
- ERG: Reduced dark-adapted b-wave amplitude
- Limited peripheral vision
- Pigmentary retinopathy
- Retinal flecks
- Rod-cone dystrophy
- Visual loss
Išorinės nuorodos
Geno įrašai
Transkriptas
Baltymas
Iš kur tai
- HGNC: geno simbolis, pavadinimas, kiti simboliai ir vieta.
- MANE Select v1.5, iš NCBI ir EMBL-EBI: transkriptas, jo eksonai ir koduojanti seka.
- GenCC ir ClinGen, išleista 2026-10-16: kokioms būklėms genas susijęs ir kaip stipriai.
- ACMG antrinių radinių sąrašas, SF v3.2.
- ClinVar ir GIAB stratifikacijos: žinomos ligas sukeliančios vietos ir sritys, kurias trumpieji skaitiniai sunkiai nustato.
- Žmogaus fenotipų ontologija, versija 2026-09-01: su genu susijusios savybės. Daugiau informacijos rasite hpo.jax.org.
- Duomenų išleidimas 2026.10.16-c6eea6bf.
Cituoti šį puslapį
Dante Labs. (be datos). ABCA4 genas: ATP binding cassette subfamily A member 4. Pasiekta 2026 m. spalio 17 d., iš https://dantelabs.com/lt/genes/abca4
Dante Labs. ABCA4 genas: ATP binding cassette subfamily A member 4 [Internetas]. [cituota 2026 m. spalio 17 d.]. Prieinama: https://dantelabs.com/lt/genes/abca4
Vienas testas. Atsakymai visam gyvenimui.
Nuo 449 $Nemokamas pristatymas · Rezultatai per 6–8 savaites