Geeni
CDHR1
cadherin related family member 1
- HGNC 14550↗(avautuu uuteen välilehteen)
- Ensembl-geeni ENSG00000148600↗(avautuu uuteen välilehteen)
- NCBI Gene 92211↗(avautuu uuteen välilehteen)
Yhteenveto
- Sytogeneettinen sijainti
- 10q23.1
- Koordinaatit
- Kromosomi 10: 84 194 537–84 218 694 (GRCh38)
- Eksonit
- 17 eksonia 24,2 kb:n alueella
- Proteiini
- 859 aminohappoa
- Tunnetaan myös nimellä
- KIAA1775, CORD15, RP65
- Aiemmat symbolit
- PCDH21
- MANE Select -transkripti
- ENST00000623527.4NM_033100.4
- Lokustyyppi
- gene with protein product
- Erittäin korkea
- Varma
- Matala
- Erittäin matala
ViitegenomiGRCh38hg38
Geenien ja varianttien sivujen sijainnit noudattavat tätä valintaa tässä selaimessa.
Lue CDHR1 ja muu genomisi yhdellä testillä.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa
Tilaa Genome TestTähän geeniin liittyvä kuratoitu raportti
Retinitis pigmentosa
Yksi 77 siihen liittyvästä geenistä
Perinnöllisten verkkokalvon dystrofioiden ryhmä, jossa sauvasolut ja sitten tappisolut menettävät asteittain toimintakykynsä. Tästä seuraa yösokeutta ja hitaasti etenevä reunanäön heikkeneminen.
- ClinGen luokittelee yhteyden: varma
- 4 GenCC-arvioijaa arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
CDHR1-geenin rakenne
- Koodaava jakso
- Translatoimaton alue
- Intron
- Transkription suunta
- Tunnetut tautia aiheuttavat kohdat
Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.
Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).
Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.
Eksonit muodostavat 6,9 kb geenin 24,2 kb:stä; 2 580 näistä emäksistä koodaa proteiinia.
Miten genomitesti lukee geeniä CDHR1
25
CDHR1-geenin kohtaa, joissa ClinVar luokittelee muutoksen patogeeniseksi tai todennäköisesti patogeeniseksi
Mikään niistä ei osu alueelle, jota lyhyet lukemat löytävät vaikeasti.
Kokogenomi kattaa kaikki 24,2 kb geenistä CDHR1, intronit mukaan lukien, ei pelkästään 6,9 kb eksoneja.
Samoihin sairauksiin liittyvät geenit
- ABCA4ATP binding cassette subfamily A member 4Yhteinen sairaus: 1
- AGBL5AGBL carboxypeptidase 5Yhteinen sairaus: 1
- AHRaryl hydrocarbon receptorYhteinen sairaus: 1
- ARHGEF18Rho/Rac guanine nucleotide exchange factor 18Yhteinen sairaus: 1
- ARL2BPARF like GTPase 2 binding proteinYhteinen sairaus: 1
- ARL3ARF like GTPase 3Yhteinen sairaus: 1
- ARL6ARF like GTPase 6Yhteinen sairaus: 1
- BBS2Bardet-Biedl syndrome 2Yhteinen sairaus: 1
- BEST1bestrophin 1Yhteinen sairaus: 1
- CA4carbonic anhydrase 4Yhteinen sairaus: 1
- CC2D2Acoiled-coil and C2 domain containing 2AYhteinen sairaus: 1
- CERKLCERK like autophagy regulatorYhteinen sairaus: 1
Geeniin CDHR1 liittyvät piirteet
Human Phenotype Ontology luettelee nämä piirteinä harvinaisista sairauksista, joita CDHR1 voi aiheuttaa. Kunkin piirteen sivulla luetellaan muut siihen liittyvät geenit.
Abnormality of the eye
- Progressive loss of vision
- Abnormal electroretinogram
- Abnormal retinal pigmentation
- Blindness
- Difficulties with night vision
- Extreme sensitivity of the eyes to light
- Involuntary, rapid, rhythmic eye movements
- Optic atrophy
Näytä 25 piirrettä lisää
- Progressive night blindness
- Retina degeneration
- Spicular pigmentation of the retina
- Visual impairment
- Abnormal central response of multifocal electroretinogram
- Abnormal color vision
- Abnormal full-field electroretinogram
- Blind spot located at fixation point
- Bulging cornea
- Color blindness
- Cystoid macular edema
- Eye muscle paralysis
- Glaucoma
- Loss of peripheral vision
- Optic disc drusen
- Optic disc pallor
- Photoreceptor outer segment loss on macular OCT
- Posterior subcapsular cataract
- Retinal atrophy
- Decreased clarity of vision
- Metamorphopsia
- Photopsia
- Limited peripheral vision
- Retinal pigment epithelial atrophy
- Rod-cone dystrophy
Ulkoiset linkit
Geenitietueet
Transkripti
Proteiini
Mistä tieto on peräisin
- HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
- MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkripti, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
- GenCC ja ClinGen, julkaisu 2026-10-16: mihin sairauksiin geeni liittyy ja kuinka vahvasti.
- ACMG:n toissijaisten löydösten luettelo, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-stratifikaatiot: tunnetut tautia aiheuttavat kohdat sekä alueet, joiden lukeminen lyhyillä luennoilla on vaikeaa.
- Human Phenotype Ontology, versio 2026-09-01: geeniin liittyvät piirteet. Lue lisää osoitteesta hpo.jax.org.
- Datajulkaisu 2026.10.16-c6eea6bf.
Viittaa tähän sivuun
Dante Labs. (n.d.). CDHR1-geeni: cadherin related family member 1. Haettu 17. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/cdhr1
Dante Labs. CDHR1-geeni: cadherin related family member 1 [Internet]. [viitattu 17. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/cdhr1
Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa