Gen
AGXT
alanine--glyoxylate aminotransferase
- HGNC 341↗(se abre en una pestaña nueva)
- Gen de Ensembl ENSG00000172482↗(se abre en una pestaña nueva)
- Gen de NCBI 189↗(se abre en una pestaña nueva)
Resumen
- Localización citogenética
- 2q37.3
- Coordenadas
- Cromosoma 2: 240.868.824–240.880.500 (GRCh38)
- Exones
- 11 exones en 11,7 kb
- Proteína
- 392 aminoácidos
- Herencia
- Autosómica recesiva
- También conocido como
- AGXT1, PH1, AGT, SPT, AGT1, TLH6, Ser-PyrAT
- Símbolos anteriores
- SPAT
- Transcrito MANE Select
- ENST00000307503.4NM_000030.3
- Tipo de locus
- gene with protein product
- Muy alta
- Alta
- Baja
- Muy baja
Genoma de referenciaGRCh38hg38
Las posiciones en las páginas de genes y variantes siguen esta elección, en este navegador.
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Hiperoxaluria primaria
- Deficiencia de alanina-glioxilato aminotransferasa
Cualquier trastorno de la biosíntesis de plasmalógenos en el que la causa de la enfermedad sea una mutación en el gen AGXT.
- ClinGen califica la relación como definitiva
- 7 remitentes de GenCC la califican como definitiva o fuerte
- Autosómica recesiva
Trastorno hereditario caracterizado por una producción excesiva de oxalato, lo que da lugar a una hiperoxaluria.
- 6 remitentes de GenCC la califican como definitiva o fuerte
Herencia
- Autosómica recesiva
- Se necesita una copia alterada de cada progenitor. Con una sola, es portador y normalmente no presenta la afección; cuando ambos progenitores son portadores, cada hijo tiene una probabilidad de uno entre cuatro de heredar dos.
Estructura de AGXT
- Secuencia codificante
- Región no traducida
- Intrón
- Sentido de la transcripción
- Sitios conocidos que causan enfermedad
Exones del transcrito MANE Select del gen (versión v1.5), de NCBI y EMBL-EBI, sobre el genoma de referencia GRCh38.
Bandas cromosómicas del ideograma GRCh38 de UCSC (2022-10-29).
Genes cercanos de Ensembl, versión 116, en GRCh38.
Los exones suman 2,9 kb de los 11,7 kb del gen; 1179 de esas bases codifican la proteína.
Cómo lee una prueba genómica el gen AGXT
201
posiciones en AGXT donde ClinVar clasifica un cambio como patogénico o probablemente patogénico
Ninguna de ellas cae en una región que las lecturas cortas tienen dificultad para leer.
Un genoma completo cubre los 11,7 kb de AGXT, incluidos los intrones, y no solo los 2,9 kb de exones.
Genes vinculados a las mismas afecciones
Rasgos asociados a AGXT
La Human Phenotype Ontology recoge estos rasgos como características de las enfermedades raras que AGXT puede causar. La página de cada rasgo enumera los demás genes asociados a él.
Abnormality of the genitourinary system
- Increased calcium level in kidney
- Renal failure
- Kidney stone
- Decreased glomerular filtration rate
- Dull burning sensation with urination
- Enuresis
- Frequent urinary tract infections
- Stage 5 chronic kidney disease
Mostrar 1 rasgo más
Laboratory abnormality
- Dehydration
- Elevated urinary glycolic acid level
- Elevated urinary glyoxylic acid level
- High urine oxalate levels
- Abnormal circulating enzyme concentration
- Metabolic acidosis
- Blood in urine
- Laboratory abnormality
Mostrar 1 rasgo más
Enlaces externos
Registros del gen
Transcrito
Proteína
Origen de estos datos
- HGNC: el símbolo del gen, su nombre, otros símbolos y su ubicación.
- MANE Select v1.5, de NCBI y EMBL-EBI: el transcrito, sus exones y la secuencia codificante.
- GenCC y ClinGen, publicados en 2026-10-16: a qué afecciones está vinculado el gen y con qué grado de solidez.
- La lista ACMG de hallazgos secundarios, SF v3.2.
- ClinVar y las estratificaciones de GIAB: sitios conocidos que causan enfermedad, y las regiones que las lecturas cortas encuentran difíciles.
- Human Phenotype Ontology, versión 2026-09-01: los rasgos asociados al gen. Más información en hpo.jax.org.
- Versión de datos 2026.10.16-c6eea6bf.
Citar esta página
Dante Labs. (s. f.). Gen AGXT: alanine--glyoxylate aminotransferase. Consultado el 17 de octubre de 2026, en https://dantelabs.com/es/genes/agxt
Dante Labs. Gen AGXT: alanine--glyoxylate aminotransferase [Internet]. [citado 17 de octubre de 2026]. Disponible en: https://dantelabs.com/es/genes/agxt
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