Gen
APOB
apolipoprotein B
- HGNC 603↗(otevře se na nové kartě)
- Gen v Ensembl ENSG00000084674↗(otevře se na nové kartě)
- NCBI Gene 338↗(otevře se na nové kartě)
Shrnutí
- Cytogenetická poloha
- 2p24.1
- Souřadnice
- Chromozom 2: 21 001 429–21 044 073 (GRCh38)
- Exony
- 29 exonů na 42,6 kb
- Protein
- 4 563 aminokyselin
- Dědičnost
- Autozomálně recesivní
- Další názvy
- ApoB-100
- Transkript MANE Select
- ENST00000233242.5NM_000384.3
- Typ lokusu
- gene with protein product
Referenční genomGRCh38hg38
Pozice na stránkách genů a variant se řídí touto volbou v tomto prohlížeči.
Přečtěte si APOB i zbytek svého genomu jediným testem.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů
Objednejte si Genome TestKurátorované reporty související s tímto genem
Familial Hypercholesterolemia
- Hodnocení ClinGen pro tuto vazbu: definitivní
- 5 zadavatelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
- V seznamu ACMG pro sekundární nálezy
Co přináší znalost
Statins, ezetimibe, PCSK9 inhibitors, bempedoic acid, inclisiran
Hereditary Hypolipoproteinemias
- HypobetalipoproteinemiaAutozomálně recesivní
Includes abetalipoproteinemia (MTTP), familial hypobetalipoproteinemia (APOB, ANGPTL3) and chylomicron retention disease (SAR1B); severe forms cause fat malabsorption and vitamin E deficiency leading to nerve and retinal damage, while mild carrier forms can simply lower LDL cholesterol and may increase liver fat.
- Hodnocení ClinGen pro tuto vazbu: definitivní
- 3 zadavatelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
Co přináší znalost
Knowing allows a low-fat diet with high-dose vitamin E and other fat-soluble vitamins in the severe forms, which can prevent or limit nerve and eye damage.
Hyperlipidemia
- Hodnocení ClinGen pro tuto vazbu: definitivní
- 5 zadavatelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
- V seznamu ACMG pro sekundární nálezy
Dědičnost
- Autozomálně recesivní
- Je potřeba změněná kopie od každého z rodičů. S jednou kopií jste nositelem a obvykle nejste postiženi; pokud jsou oba rodiče nositeli, má každé dítě pravděpodobnost jedna ku čtyřem, že zdědí dvě.
Jak je APOB uspořádán
- Kódující sekvence
- Netranslatovaná oblast
- Intron
- Směr transkripce
- Známá místa způsobující onemocnění
- Úseky, které krátká čtení obtížně zachycují
- Varianty se stránkou
Exony transkriptu MANE Select genu (verze v1.5) z databází NCBI a EMBL-EBI, na referenčním genomu GRCh38.
Pásy chromozomů z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Okolní geny z Ensembl, verze 116, na GRCh38.
Exony tvoří 14,1 kb z 42,6 kb genu; 13 692 těchto bází kódují protein.
Jak genetický test čte APOB
206
pozic v genu APOB, které ClinVar řadí mezi patogenní nebo pravděpodobně patogenní
Žádné z nich neleží v oblasti, kterou krátká čtení obtížně zachycují.
Celý genom pokrývá všech 42,6 kb genu APOB, včetně intronů, nikoli jen 14,1 kb exonů.
Varianty se stránkou (30)
Varianty genu APOB se stránkou zde, nejdříve ty s nejvyšším počtem hvězdiček hodnocení. Každá stránka popisuje veřejný záznam ClinVar o variantě, nikoli výsledek.
| Varianta | HGVS c. | Exon nebo intron | Pozice (GRCh38) | Klasifikace ClinVar | Stav hodnocení |
|---|---|---|---|---|---|
| c.78_82+5del | Intron 1 | 21 043 858 | Pravděpodobně patogenní | ★★★★2 hvězdiček z 4 Kritéria uvedena, více předkladatelů, bez konfliktů | |
| c.226_237+1del | Intron 3 | 21 042 359 | Patogenní/pravděpodobně patogenní | ★★★★2 hvězdiček z 4 Kritéria uvedena, více předkladatelů, bez konfliktů | |
| c.537+1G>T | Intron 5 | 21 037 957 | Patogenní/pravděpodobně patogenní | ★★★★2 hvězdiček z 4 Kritéria uvedena, více předkladatelů, bez konfliktů | |
| c.1830-1G>A | Intron 13 | 21 028 066 | Patogenní | ★★★★2 hvězdiček z 4 Kritéria uvedena, více předkladatelů, bez konfliktů | |
| c.2604+1G>A | Intron 17 | 21 023 524 | Pravděpodobně patogenní | ★★★★2 hvězdiček z 4 Kritéria uvedena, více předkladatelů, bez konfliktů | |
| E137X | c.409G>T | Exon 5 | 21 038 086 | Patogenní | ★★★★2 hvězdiček z 4 Kritéria uvedena, více předkladatelů, bez konfliktů |
| E3493K | c.10477G>A | Exon 26 | 21 006 391 | Pravděpodobně patogenní | ★★★★2 hvězdiček z 4 Kritéria uvedena, více předkladatelů, bez konfliktů |
| F705Lfs*30 | c.2115del | Exon 15 | 21 026 916 | Patogenní | ★★★★2 hvězdiček z 4 Kritéria uvedena, více předkladatelů, bez konfliktů |
| F3039Sfs*5 | c.9115_9119del | Exon 26 | 21 007 748 | Patogenní/pravděpodobně patogenní | ★★★★2 hvězdiček z 4 Kritéria uvedena, více předkladatelů, bez konfliktů |
| G3617Afs*6 | c.10848del | Exon 26 | 21 006 019 | Patogenní/pravděpodobně patogenní | ★★★★2 hvězdiček z 4 Kritéria uvedena, více předkladatelů, bez konfliktů |
Geny spojené se stejnými onemocněními
- LDLRlow density lipoprotein receptorSdílí 2 onemocnění
- LDLRAP1low density lipoprotein receptor adaptor protein 1Sdílí 2 onemocnění
- PCSK9proprotein convertase subtilisin/kexin type 9Sdílí 2 onemocnění
- ANGPTL3angiopoietin like 3Sdílí 1 onemocnění
- APOA5apolipoprotein A5Sdílí 1 onemocnění
- APOC2apolipoprotein C2Sdílí 1 onemocnění
- APOEapolipoprotein ESdílí 1 onemocnění
- CETPcholesteryl ester transfer proteinSdílí 1 onemocnění
- GPIHBP1glycosylphosphatidylinositol anchored high density lipoprotein binding protein 1Sdílí 1 onemocnění
- LIPClipase C, hepatic typeSdílí 1 onemocnění
- LPLlipoprotein lipaseSdílí 1 onemocnění
- MTTPmicrosomal triglyceride transfer proteinSdílí 1 onemocnění
Rysy spojené s APOB
Human Phenotype Ontology uvádí tyto rysy jako příznaky vzácných onemocnění, která může způsobit APOB. Na stránce každého rysu najdete další geny, které jsou s ním spojené.
Abnormality of the cardiovascular system
- Premature hardening of arteries
- Premature plaque build-up in arteries
- Abnormal left ventricular function
- Angina pectoris
- Aortic atherosclerotic lesion
- Heart attack
- Heart murmur
- High blood pressure
Zobrazit ještě 11 rysů
- Myocardial steatosis
- Narrowing of kidney artery
- Peripheral arterial stenosis
- Plaque build-up in arteries supplying blood to heart
- Plaque build-up in cerebral artery
- Premature coronary artery disease
- Sudden cardiac death
- Calcification of the aorta
- Mitral regurgitation
- Supravalvular aortic stenosis
- Coronary artery aneurysm
Laboratory abnormality
- Decreased circulating cholesterol level
- Decreased circulating high-density lipoprotein cholesterol
- Decreased circulating LDL-C concentration
- Elevated circulating alanine aminotransferase concentration
- Elevated circulating aspartate aminotransferase concentration
- Elevated lipids in blood
- Elevated serum cholesterol
- Increased circulating LDL level
Zobrazit ještě 3 rysů
Externí odkazy
Záznamy o genu
Transkript
Protein
Odkud údaje pocházejí
- HGNC: symbol genu, název, další symboly a umístění.
- MANE Select v1.5, z NCBI a EMBL-EBI: transkript, jeho exony a kódující sekvence.
- GenCC a ClinGen, vydání 2026-10-16: s jakými onemocněními je gen spojen a jak silná je tato souvislost.
- Seznam sekundárních nálezů ACMG, SF v3.2.
- ClinVar a stratifikace GIAB: známá místa způsobující onemocnění a oblasti, které krátká čtení obtížně zachycují.
- Human Phenotype Ontology, verze 2026-09-01: rysy spojené s tímto genem. Více informací najdete na hpo.jax.org.
- Vydání dat 2026.10.16-c6eea6bf.
Citovat tuto stránku
Dante Labs. (b.d.). Gen APOB: apolipoprotein B. Staženo 16. října 2026, z https://dantelabs.com/cs/genes/apob
Dante Labs. Gen APOB: apolipoprotein B [Internet]. [citováno 16. října 2026]. Dostupné z: https://dantelabs.com/cs/genes/apob
Jeden test. Odpovědi na celý život.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů