Gen
PCSK9
proprotein convertase subtilisin/kexin type 9
- HGNC 20001↗(otevře se na nové kartě)
- Gen v Ensembl ENSG00000169174↗(otevře se na nové kartě)
- NCBI Gene 255738↗(otevře se na nové kartě)
Shrnutí
- Cytogenetická poloha
- 1p32.3
- Souřadnice
- Chromozom 1: 55 039 548–55 064 852 (GRCh38)
- Exony
- 12 exonů na 25,3 kb
- Protein
- 692 aminokyselin
- Další názvy
- NARC-1, FH3
- Předchozí symboly
- HCHOLA3
- Transkript MANE Select
- ENST00000302118.5NM_174936.4
- Typ lokusu
- gene with protein product
- Velmi vysoká
- Jistá
- Nízká
- Velmi nízká
Referenční genomGRCh38hg38
Pozice na stránkách genů a variant se řídí touto volbou v tomto prohlížeči.
Přečtěte si PCSK9 i zbytek svého genomu jediným testem.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů
Objednejte si Genome TestKurátorované reporty související s tímto genem
Familial Hypercholesterolemia
- Hodnocení ClinGen pro tuto vazbu: definitivní
- 4 zadavatelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
- V seznamu ACMG pro sekundární nálezy
Co přináší znalost
Statins, ezetimibe, PCSK9 inhibitors, bempedoic acid, inclisiran
Hyperlipidemia
- Hodnocení ClinGen pro tuto vazbu: definitivní
- 4 zadavatelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
- V seznamu ACMG pro sekundární nálezy
Jak je PCSK9 uspořádán
- Kódující sekvence
- Netranslatovaná oblast
- Intron
- Směr transkripce
- Známá místa způsobující onemocnění
- Úseky, které krátká čtení obtížně zachycují
- Varianty se stránkou
Exony transkriptu MANE Select genu (verze v1.5) z databází NCBI a EMBL-EBI, na referenčním genomu GRCh38.
Pásy chromozomů z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Okolní geny z Ensembl, verze 116, na GRCh38.
Exony tvoří 3,6 kb z 25,3 kb genu; 2 079 těchto bází kódují protein.
Jak genetický test čte PCSK9
18
pozic v genu PCSK9, které ClinVar řadí mezi patogenní nebo pravděpodobně patogenní
Žádné z nich neleží v oblasti, kterou krátká čtení obtížně zachycují.
Celý genom pokrývá všech 25,3 kb genu PCSK9, včetně intronů, nikoli jen 3,6 kb exonů.
Varianty se stránkou (6)
Varianty genu PCSK9 se stránkou zde, nejdříve ty s nejvyšším počtem hvězdiček hodnocení. Každá stránka popisuje veřejný záznam ClinVar o variantě, nikoli výsledek.
| Varianta | HGVS c. | Exon nebo intron | Pozice (GRCh38) | Klasifikace ClinVar | Stav hodnocení |
|---|---|---|---|---|---|
| D129G | c.386A>G | Exon 2 | 55 044 021 | Patogenní/pravděpodobně patogenní | ★★★★2 hvězdiček z 4 Kritéria uvedena, více předkladatelů, bez konfliktů |
| D374Y | c.1120G>T | Exon 7 | 55 057 454 | Patogenní | ★★★★2 hvězdiček z 4 Kritéria uvedena, více předkladatelů, bez konfliktů |
| E32K | c.94G>A | Exon 1 | 55 039 931 | Patogenní/pravděpodobně patogenní | ★★★★2 hvězdiček z 4 Kritéria uvedena, více předkladatelů, bez konfliktů |
| L108R | c.323T>G | Exon 2 | 55 043 958 | Patogenní/pravděpodobně patogenní | ★★★★2 hvězdiček z 4 Kritéria uvedena, více předkladatelů, bez konfliktů |
| R215H | c.644G>A | Exon 4 | 55 052 398 | Patogenní/pravděpodobně patogenní | ★★★★2 hvězdiček z 4 Kritéria uvedena, více předkladatelů, bez konfliktů |
| S127R | c.381T>A | Exon 2 | 55 044 016 | Patogenní | ★★★★2 hvězdiček z 4 Kritéria uvedena, více předkladatelů, bez konfliktů |
Geny spojené se stejnými onemocněními
- APOBapolipoprotein BSdílí 2 onemocnění
- LDLRlow density lipoprotein receptorSdílí 2 onemocnění
- LDLRAP1low density lipoprotein receptor adaptor protein 1Sdílí 2 onemocnění
- APOA5apolipoprotein A5Sdílí 1 onemocnění
- APOC2apolipoprotein C2Sdílí 1 onemocnění
- APOEapolipoprotein ESdílí 1 onemocnění
- CETPcholesteryl ester transfer proteinSdílí 1 onemocnění
- GPIHBP1glycosylphosphatidylinositol anchored high density lipoprotein binding protein 1Sdílí 1 onemocnění
- LIPClipase C, hepatic typeSdílí 1 onemocnění
- LPLlipoprotein lipaseSdílí 1 onemocnění
Rysy spojené s PCSK9
Human Phenotype Ontology uvádí tyto rysy jako příznaky vzácných onemocnění, která může způsobit PCSK9. Na stránce každého rysu najdete další geny, které jsou s ním spojené.
Abnormality of the cardiovascular system
- Premature hardening of arteries
- Premature plaque build-up in arteries
- Abnormal left ventricular function
- Angina pectoris
- Aortic atherosclerotic lesion
- Heart attack
- Heart murmur
- High blood pressure
Zobrazit ještě 11 rysů
- Myocardial steatosis
- Narrowing of kidney artery
- Peripheral arterial stenosis
- Plaque build-up in arteries supplying blood to heart
- Plaque build-up in cerebral artery
- Premature coronary artery disease
- Sudden cardiac death
- Calcification of the aorta
- Mitral regurgitation
- Supravalvular aortic stenosis
- Coronary artery aneurysm
Externí odkazy
Záznamy o genu
Transkript
Protein
Odkud údaje pocházejí
- HGNC: symbol genu, název, další symboly a umístění.
- MANE Select v1.5, z NCBI a EMBL-EBI: transkript, jeho exony a kódující sekvence.
- GenCC a ClinGen, vydání 2026-10-16: s jakými onemocněními je gen spojen a jak silná je tato souvislost.
- Seznam sekundárních nálezů ACMG, SF v3.2.
- ClinVar a stratifikace GIAB: známá místa způsobující onemocnění a oblasti, které krátká čtení obtížně zachycují.
- Human Phenotype Ontology, verze 2026-09-01: rysy spojené s tímto genem. Více informací najdete na hpo.jax.org.
- Vydání dat 2026.10.16-c6eea6bf.
Citovat tuto stránku
Dante Labs. (b.d.). Gen PCSK9: proprotein convertase subtilisin/kexin type 9. Staženo 16. října 2026, z https://dantelabs.com/cs/genes/pcsk9
Dante Labs. Gen PCSK9: proprotein convertase subtilisin/kexin type 9 [Internet]. [citováno 16. října 2026]. Dostupné z: https://dantelabs.com/cs/genes/pcsk9
Jeden test. Odpovědi na celý život.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů