Gen
NEFH
neurofilament heavy chain
- HGNC 7737↗(öppnas i en ny flik)
- Ensembl-gen ENSG00000100285↗(öppnas i en ny flik)
- NCBI Gene 4744↗(öppnas i en ny flik)
Sammanfattning
- Cytogenetisk position
- 22q12.2
- Koordinater
- Kromosom 22: 29 480 218–29 491 390 (GRCh38)
- Exoner
- 4 exoner på 11,2 kb
- Protein
- 1 020 aminosyror
- Även känd som
- NF-H, NFH
- MANE Select-transkript
- ENST00000310624.7NM_021076.4
- Lokustyp
- Proteinkodande
- Mycket hög
- Säker
- Låg
- Mycket låg
Den här sidan som data
Lägg till .json i sidans adress, eller begär application/json, för att läsa den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/nefh.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLäs NEFH, och resten av ditt genom, med ett test.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor
Beställ mitt Genome TestKuraterad rapport som är relevant för denna gen
Charcot-Marie-Tooth-sjukdom
En av 62 gener kopplade till den
En grupp ärftliga perifera neuropatier som orsakar progressiv svaghet och muskelnedbrytning i de distala musklerna samt känselbortfall, främst i fötter och händer.
- ClinGen bedömer kopplingen som definitiv
- 3 GenCC-bedömare bedömer den som definitiv eller stark
▶Åtgärdbarhet
Genetisk rådgivning, undertypsspecifik uppföljning, sjukgymnastik, ortoser, undvikande av neurotoxiska läkemedel, genspecifika kliniska prövningar, bevakning av associerade kännetecken
Så är NEFH uppbyggd
- Kodande sekvens
- Otranslaterad region
- Intron
- Transkriptionsriktning
- Kända sjukdomsorsakande ställen
- Sträckor som korta läsningar har svårt för
Exoner i genens MANE Select-transkript (version v1.5), från NCBI och EMBL-EBI, på referensgenomet GRCh38.
Kromosombanden från UCSC:s GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Närliggande gener från Ensembl-version 116, på GRCh38.
Exoner utgör 3,8 kb av genens 11,2 kb, och 3 063 av dessa baser kodar för proteinet.
Sekvensering av NEFH
27Måttlig
Hur svår NEFH är att sekvensera med korta läsningar, av 100Varje stapel visar andelen av NEFHs exonbaser i den typen av svårt område. Poängen väger dem efter hur mycket var och en försvårar ett kortläsanrop: 0 när ingen bas finns i något, 100 när varje bas finns i alla.
- MappbarhetSträckor där läsningar på 100 eller 250 bp inte kan placeras entydigt, så ett anrop där kan saknas eller vara fel. Vikt 35 %.4,9 %
- HomologiSegmentella duplikationer: kopior på andra ställen i genomet, till exempel paraloger och pseudogener, med 90 % identitet eller mer. Vikt 30 %.64 %
- UpprepningarTandemupprepningar och serier av en och samma bas, där läsningar glider och kanske inte täcker dem. Vikt 15 %.26 %
- GC-innehållFönster med under 25 % eller över 65 % G och C, som biblioteksförberedelsen täcker glest. Vikt 10 %.24 %
- ReferenstäckningLuckor i den närliggande referensassembleringen, där det inte finns någon sekvens som kortläsningarna kan anpassas mot. Vikt 10 %.0 %
5
positioner i NEFH där ClinVar klassar en förändring som patogen eller sannolikt patogen
4 av dem (80 %) ligger i områden som korta läsningar har svårt för.
- Segmental duplicationsCopies of at least 1 kb sharing at least 90% identity with another part of the genome (paralogues, pseudogenes); reads may align to the wrong copy. (4 ställen)
Ett helgenomsekvensering täcker alla 11,2 kb av NEFH, inklusive introner, inte bara de 3,8 kb exoner.
Gener kopplade till samma tillstånd
- AARS1alanyl-tRNA synthetase 1Delar 1 tillstånd
- AIFM1apoptosis inducing factor mitochondria associated 1Delar 1 tillstånd
- ATP1A1ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 1Delar 1 tillstånd
- CADM3cell adhesion molecule 3Delar 1 tillstånd
- COX6A1cytochrome c oxidase subunit 6A1Delar 1 tillstånd
- DHTKD1dehydrogenase E1 and transketolase domain containing 1Delar 1 tillstånd
- DHX9DExH-box helicase 9Delar 1 tillstånd
- DNM2dynamin 2Delar 1 tillstånd
- DRP2dystrophin related protein 2Delar 1 tillstånd
- DYNC1H1dynein cytoplasmic 1 heavy chain 1Delar 1 tillstånd
- EGR2early growth response 2Delar 1 tillstånd
- FBLN5fibulin 5Delar 1 tillstånd
Egenskaper kopplade till NEFH
Human Phenotype Ontology listar dessa som kännetecken för de sällsynta tillstånd som NEFH kan orsaka. Varje egenskaps sida visar de andra gener som är kopplade till den.
Abnormality of the nervous system
- Babinski sign
- Lou Gehrig's disease
- Motor neuron atrophy
- Ongoing loss of nerve cells
- Anxiety
- Behavioral abnormality
- Can't control feelings
- Cognitive impairment
Visa ytterligare 21 egenskaper
- Depression
- Difficulty articulating speech
- Hoffmann sign
- Impaired vibratory sensation
- Increased reflexes
- Muscle twitch
- Paralysis
- Difficulty sleeping
- Frontotemporal dementia
- High stepping
- Jaw hyperreflexia
- Language impairment
- Decreased reflex response
- Decreased sensation in extremities
- Degeneration of anterior horn cells
- Degeneration of the lateral corticospinal tracts
- Nerve damage causing decreased feeling and movement
- Pauses in breathing while sleeping
- Sensory axonal neuropathy
- Somatic sensory dysfunction
- Waddling gait
Abnormality of the musculoskeletal system
- EMG: neuropathic changes
- Lower limb amyotrophy
- Generalized muscle weakness
- Distal muscle wasting
- Fatigable weakness of bulbar muscles
- Fatigable weakness of respiratory muscles
- Fatigable weakness of swallowing muscles
- Involuntary muscle stiffness, contraction, or spasm
Visa ytterligare 12 egenskaper
Externa länkar
Genposter
Transkript
Protein
Varifrån detta kommer
- HGNC: genens symbol, namn, andra symboler och position.
- MANE Select v1.5, från NCBI och EMBL-EBI: transkriptet, dess exoner och kodande sekvens.
- GenCC och ClinGen, släppta 2026-10-17: vilka tillstånd genen är kopplad till och hur starkt.
- ACMG:s lista över sekundära fynd, SF v3.2.
- ClinVar och GIAB-stratifieringarna: kända sjukdomsframkallande positioner och de områden som kortläsningar har svårt för.
- Genome in a Bottle-stratifieringarna från NIST: poängen för sekvenseringssvårighet.
- Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: egenskaperna som är kopplade till genen. Läs mer på hpo.jax.org.
- Dataversion 2026.10.17-8666dff2.
Citera den här sidan
Dante Labs. (u.å.). NEFH-genen: neurofilament heavy chain. Hämtad 18 oktober 2026, från https://dantelabs.com/sv/genes/nefh
Dante Labs. NEFH-genen: neurofilament heavy chain [Internet]. [citerad 18 oktober 2026]. Tillgänglig på: https://dantelabs.com/sv/genes/nefh
Ett test. Ett helt liv av svar.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor