Gen
AP1B1
adaptor related protein complex 1 subunit beta 1
- HGNC 554↗(öppnas i en ny flik)
- Ensembl-gen ENSG00000100280↗(öppnas i en ny flik)
- NCBI Gene 162↗(öppnas i en ny flik)
Sammanfattning
- Cytogenetisk position
- 22q12.2
- Koordinater
- Kromosom 22: 29 327 680–29 388 570 (GRCh38)
- Exoner
- 23 exoner på 60,9 kb
- Protein
- 949 aminosyror
- Även känd som
- BAM22, AP105A
- Tidigare symboler
- ADTB1, CLAPB2
- MANE Select-transkript
- ENST00000357586.7NM_001127.4
- Lokustyp
- gene with protein product
- Mycket hög
- Säker
- Låg
- Mycket låg
ReferensgenomGRCh38hg38
Positioner på gen- och variantsidorna följer det här valet, i den här webbläsaren.
Läs AP1B1, och resten av ditt genom, med ett test.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor
Beställ mitt Genome TestKuraterad rapport som är relevant för denna gen
Ärftlig palmoplantar keratodermi och pachyonychia congenita
- Ärftlig palmoplantar keratodermi
Ärftlig förtjockning av handflatorna och fotsulorna, inklusive pachyonychia congenita, mal de Meleda, keratodermi av Nagashima-typ och Bothnia-typ, keratit-ichthyosis-dövhetssyndrom samt de CTSC-relaterade Papillon-Lefèvres och Haim-Munks syndrom.
- ClinGen bedömer kopplingen som definitiv
- 2 GenCC-bedömare klassar den som definitiv eller stark
Vad kunskapen förändrar
Diagnosen styr fotvård och smärtbehandling. För CTSC-relaterade former skyddar tidig tandbehandling tänderna, och GJB2-relaterade former motiverar en hörselkontroll.
Så är AP1B1 uppbyggd
- Kodande sekvens
- Otranslaterad region
- Intron
- Transkriptionsriktning
- Kända sjukdomsorsakande ställen
- Sträckor som korta läsningar har svårt för
Exoner i genens MANE Select-transkript (version v1.5), från NCBI och EMBL-EBI, på referensgenomet GRCh38.
Kromosombanden från UCSC:s GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Närliggande gener från Ensembl-version 116, på GRCh38.
Exoner utgör 4,2 kb av genens 60,9 kb, och 2 850 av dessa baser kodar för proteinet.
Så läser ett genomtest AP1B1
2
positioner i AP1B1 där ClinVar klassar en förändring som patogen eller sannolikt patogen
1 av dem (50 %) ligger i ett område som korta läsningar har svårt för.
- Low mappability (1 ställe)Regions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely.
- Segmental duplications (1 ställe)Copies of at least 1 kb sharing at least 90% identity with another part of the genome (paralogues, pseudogenes); reads may align to the wrong copy.
En helgenomsanalys täcker alla 60,9 kb av AP1B1, med introner inräknade, inte bara de 4,2 kb exoner.
Gener kopplade till samma tillstånd
- AAGABalpha and gamma adaptin binding proteinDelar 1 tillstånd
- AQP5aquaporin 5Delar 1 tillstånd
- CTSCcathepsin CDelar 1 tillstånd
- DSG1desmoglein 1Delar 1 tillstånd
- DSPdesmoplakinDelar 1 tillstånd
- GJA1gap junction protein alpha 1Delar 1 tillstånd
- GJB2gap junction protein beta 2Delar 1 tillstånd
- GJB3gap junction protein beta 3Delar 1 tillstånd
- GJB4gap junction protein beta 4Delar 1 tillstånd
- GJB6gap junction protein beta 6Delar 1 tillstånd
- GRHL2grainyhead like transcription factor 2Delar 1 tillstånd
- KDSR3-ketodihydrosphingosine reductaseDelar 1 tillstånd
Egenskaper kopplade till AP1B1
Human Phenotype Ontology listar dessa som kännetecken för de sällsynta tillstånd som AP1B1 kan orsaka. Varje egenskaps sida visar de andra gener som är kopplade till den.
Externa länkar
Genposter
Transkript
Protein
Varifrån detta kommer
- HGNC: genens symbol, namn, andra symboler och position.
- MANE Select v1.5, från NCBI och EMBL-EBI: transkriptet, dess exoner och kodande sekvens.
- GenCC och ClinGen, släppt 2026-10-16: vilka tillstånd genen är kopplad till och hur starkt kopplingen är.
- ACMG:s lista över sekundära fynd, SF v3.2.
- ClinVar och GIAB-stratifieringarna: kända sjukdomsorsakande positioner och de regioner där korta läsningar har svårt.
- Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: egenskaperna som är kopplade till genen. Läs mer på hpo.jax.org.
- Dataversion 2026.10.16-c6eea6bf.
Citera den här sidan
Dante Labs. (u.å.). AP1B1-genen: adaptor related protein complex 1 subunit beta 1. Hämtad 17 oktober 2026, från https://dantelabs.com/sv/genes/ap1b1
Dante Labs. AP1B1-genen: adaptor related protein complex 1 subunit beta 1 [Internet]. [citerad 17 oktober 2026]. Tillgänglig på: https://dantelabs.com/sv/genes/ap1b1
Ett test. Ett helt liv av svar.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor