Gen
CLRN1
clarin 1
- HGNC 12605↗(öppnas i en ny flik)
- Ensembl-gen ENSG00000163646↗(öppnas i en ny flik)
- NCBI Gene 7401↗(öppnas i en ny flik)
Sammanfattning
- Cytogenetisk position
- 3q25.1
- Koordinater
- Kromosom 3: 150 926 567–150 972 727 (GRCh38)
- Exoner
- 3 exoner på 46,2 kb
- Protein
- 232 aminosyror
- Arvsgång
- Autosomalt recessiv
- Tidigare symboler
- USH3, USH3A, RP61
- MANE Select-transkript
- ENST00000327047.6NM_174878.3
- Lokustyp
- gene with protein product
- Mycket hög
- Säker
- Låg
- Mycket låg
ReferensgenomGRCh38hg38
Positioner på gen- och variantsidorna följer det här valet, i den här webbläsaren.
Läs CLRN1, och resten av ditt genom, med ett test.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor
Beställ mitt Genome TestKuraterade rapporter som är relevanta för denna gen
Ushers syndrom
- Autosomalt recessiv
En grupp recessiva sjukdomar (typ 1 till 4) som orsakar sensorineural hörselnedsättning, progressiv retinitis pigmentosa och, hos vissa typer, balansproblem. Sjukdomarna är kopplade till gener som USH2A, MYO7A, CDH23, PCDH15, USH1C, USH1G, ADGRV1, WHRN, CLRN1 och ARSG.
- ClinGen bedömer kopplingen som definitiv
- 4 GenCC-bedömare klassar den som definitiv eller stark
Vad kunskapen förändrar
En tidig diagnos hjälper till vid beslut om tidpunkten för cochleaimplantat, ögonkontroller och behörighet för försök med retinal terapi, och är relevant vid bärarscreening.
Bredare grupperingar
Retinitis pigmentosa
En av 77 gener kopplade till den
En grupp ärftliga retinala dystrofier med progressiv förlust av först stavar och sedan tappar (fotoreceptorer), vilket orsakar nattblindhet och gradvis förlust av perifer syn.
- 2 GenCC-bedömare klassar den som definitiv eller stark
Nedärvning
- Autosomalt recessiv
- Det krävs en förändrad kopia från vardera föräldern. Med en är du bärare och oftast opåverkad. När båda föräldrarna är bärare har varje barn en chans på en av fyra att ärva två.
Så är CLRN1 uppbyggd
- Kodande sekvens
- Otranslaterad region
- Intron
- Transkriptionsriktning
- Kända sjukdomsorsakande ställen
- Sträckor som korta läsningar har svårt för
Exoner i genens MANE Select-transkript (version v1.5), från NCBI och EMBL-EBI, på referensgenomet GRCh38.
Kromosombanden från UCSC:s GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Närliggande gener från Ensembl-version 116, på GRCh38.
Exoner utgör 2,1 kb av genens 46,2 kb, och 699 av dessa baser kodar för proteinet.
Så läser ett genomtest CLRN1
58
positioner i CLRN1 där ClinVar klassar en förändring som patogen eller sannolikt patogen
Inget av dem ligger i ett område som korta läsningar har svårt för.
En helgenomsanalys täcker alla 46,2 kb av CLRN1, med introner inräknade, inte bara de 2,1 kb exoner.
Gener kopplade till samma tillstånd
- USH2AusherinDelar 2 tillstånd
- ABCA4ATP binding cassette subfamily A member 4Delar 1 tillstånd
- ADGRV1adhesion G protein-coupled receptor V1Delar 1 tillstånd
- AGBL5AGBL carboxypeptidase 5Delar 1 tillstånd
- AHRaryl hydrocarbon receptorDelar 1 tillstånd
- ARHGEF18Rho/Rac guanine nucleotide exchange factor 18Delar 1 tillstånd
- ARL2BPARF like GTPase 2 binding proteinDelar 1 tillstånd
- ARL3ARF like GTPase 3Delar 1 tillstånd
- ARL6ARF like GTPase 6Delar 1 tillstånd
- ARSGarylsulfatase GDelar 1 tillstånd
- BBS2Bardet-Biedl syndrome 2Delar 1 tillstånd
- BEST1bestrophin 1Delar 1 tillstånd
Egenskaper kopplade till CLRN1
Human Phenotype Ontology listar dessa som kännetecken för de sällsynta tillstånd som CLRN1 kan orsaka. Varje egenskaps sida visar de andra gener som är kopplade till den.
Abnormality of the eye
- Decreased clarity of vision
- Rod-cone dystrophy
- Abnormal electroretinogram
- Abnormal retinal pigmentation
- Blind spot
- Blindness
- Difficulties with night vision
- Extreme sensitivity of the eyes to light
Visa ytterligare 26 egenskaper
- Involuntary, rapid, rhythmic eye movements
- Light eye color
- Optic atrophy
- Progressive night blindness
- Retina degeneration
- Spicular pigmentation of the retina
- Visual impairment
- Visual loss
- Abnormal central response of multifocal electroretinogram
- Abnormal full-field electroretinogram
- Bulging cornea
- Cystoid macular edema
- Eye muscle paralysis
- Glaucoma
- Loss of peripheral vision
- Optic disc drusen
- Optic disc pallor
- Partial loss of field of vision
- Photoreceptor outer segment loss on macular OCT
- Posterior subcapsular cataract
- Retinal atrophy
- Abnormal color vision
- Photopsia
- Abnormal fundus pigmentation
- Limited peripheral vision
- Undetectable light- and dark-adapted electroretinogram
Externa länkar
Genposter
Transkript
Protein
Varifrån detta kommer
- HGNC: genens symbol, namn, andra symboler och position.
- MANE Select v1.5, från NCBI och EMBL-EBI: transkriptet, dess exoner och kodande sekvens.
- GenCC och ClinGen, släppt 2026-10-16: vilka tillstånd genen är kopplad till och hur starkt kopplingen är.
- ACMG:s lista över sekundära fynd, SF v3.2.
- ClinVar och GIAB-stratifieringarna: kända sjukdomsorsakande positioner och de regioner där korta läsningar har svårt.
- Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: egenskaperna som är kopplade till genen. Läs mer på hpo.jax.org.
- Dataversion 2026.10.16-c6eea6bf.
Citera den här sidan
Dante Labs. (u.å.). CLRN1-genen: clarin 1. Hämtad 16 oktober 2026, från https://dantelabs.com/sv/genes/clrn1
Dante Labs. CLRN1-genen: clarin 1 [Internet]. [citerad 16 oktober 2026]. Tillgänglig på: https://dantelabs.com/sv/genes/clrn1
Ett test. Ett helt liv av svar.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor