Gen
ADGRV1
adhesion G protein-coupled receptor V1
- HGNC 17416↗(öppnas i en ny flik)
- Ensembl-gen ENSG00000164199↗(öppnas i en ny flik)
- NCBI Gene 84059↗(öppnas i en ny flik)
Sammanfattning
- Cytogenetisk position
- 5q14.3
- Koordinater
- Kromosom 5: 90 558 797–91 164 437 (GRCh38)
- Exoner
- 90 exoner på 605,6 kb
- Protein
- 6 306 aminosyror
- Även känd som
- DKFZp761P0710, KIAA0686, FEB4, VLGR1
- Tidigare symboler
- USH2C, MASS1, GPR98
- MANE Select-transkript
- ENST00000405460.9NM_032119.4
- Lokustyp
- Proteinkodande
Den här sidan som data
Lägg till .json i sidans adress, eller begär application/json, för att läsa den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/adgrv1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLäs ADGRV1, och resten av ditt genom, med ett test.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor
Beställ mitt Genome TestKuraterad rapport som är relevant för denna gen
Ushers syndrom
- Autosomalt recessiv
En grupp recessiva sjukdomar (typ 1 till 4) som orsakar sensorineural hörselnedsättning, progressiv retinitis pigmentosa och, hos vissa typer, balansproblem. Sjukdomarna är kopplade till gener som USH2A, MYO7A, CDH23, PCDH15, USH1C, USH1G, ADGRV1, WHRN, CLRN1 och ARSG.
- ClinGen bedömer kopplingen som definitiv
- 4 GenCC-bedömare bedömer den som definitiv eller stark
▶Åtgärdbarhet
En tidig diagnos hjälper till vid beslut om tidpunkten för cochleaimplantat, ögonkontroller och behörighet för försök med retinal terapi, och är relevant vid bärarscreening.
Så är ADGRV1 uppbyggd
- Kodande sekvens
- Otranslaterad region
- Intron
- Transkriptionsriktning
- Kända sjukdomsorsakande ställen
- Sträckor som korta läsningar har svårt för
Exoner i genens MANE Select-transkript (version v1.5), från NCBI och EMBL-EBI, på referensgenomet GRCh38.
Kromosombanden från UCSC:s GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Närliggande gener från Ensembl-version 116, på GRCh38.
Exoner utgör 19,6 kb av genens 605,6 kb, och 18 921 av dessa baser kodar för proteinet.
Sekvensering av ADGRV1
1Lätt
Hur svår ADGRV1 är att sekvensera med korta läsningar, av 100
0 · Lätt100 · Svår
Nästan alla exoner i ADGRV1 ligger där korta läsningar kartläggs tydligt.
Det som tillkommer: andelen av ADGRV1s exoner i varje typ av svår region
- KartläggbarhetSträckor där 100 eller 250 bp långa läsningar inte kan placeras entydigt, så ett anrop där kan saknas eller vara fel. Ensam skulle en gen som helt ligger i denna typ av region få 100.0 %
- HomologiSegmentella duplikationer: kopior på andra ställen i genomet, till exempel paraloger och pseudogener, med 90 % identitet eller mer. Ensam skulle en gen som helt ligger i denna typ av region få 60.0 %
- Delas med chrYDe pseudoautosomala regionerna och den X-transponerade regionen, där chrX och chrY bär samma eller nästan samma sekvens, så en läsning från den ena kan placeras på den andra. Ensam skulle en gen som helt ligger i denna typ av region få 60.0 %
- ReferenstäckningLuckor i den närliggande referensassemblyn, där det inte finns någon sekvens för läsningarna att anpassas mot. Ensam skulle en gen som helt ligger i denna typ av region få 50.0 %
- RepetitionerTandemrepetitioner och serier av en och samma bas, där läsningar glider och som kanske inte spänns över. Ensam skulle en gen som helt ligger i denna typ av region få 30.0,6 %
- GC-innehållFönster med under 25 % eller över 65 % G och C, som biblioteksberedningen täcker glest. Ensam skulle en gen som helt ligger i denna typ av region få 20.5,1 %
Ett Dante Labs-poäng från egen forskning, baserat på NIST:s Genome in a Bottle-kartor över svårsekvenserade regioner.Så poängsätts detVarje stapel är andelen av ADGRV1s exonbaser i den typen av svår region. Varje enskild typ kan göra en gen svår på egen hand, och varje ytterligare typ lägger till mindre: 0 när ingen bas ligger i någon, 100 när varje bas ligger där läsningar inte kan placeras entydigt.
160
positioner i ADGRV1 där ClinVar klassar en förändring som patogen eller sannolikt patogen
Ingen av dem ligger i ett område som korta läsningar har svårt för.
Ett helgenomsprov täcker alla 605,6 kb av ADGRV1, inklusive introner, och inte bara de 19,6 kb exoner.
ClinVar pathogenic variants (161)
The ADGRV1 variants ClinVar classifies pathogenic or likely pathogenic for any condition, reviewed by at least one submitter with criteria, and the most reviewed of them. It is ClinVar's public record of the gene, never a result.
- Patogen 65
- Patogen/sannolikt patogen 4
- Sannolikt patogen 92
| Variant | Conditions | ClinVar-klassificering | Granskningsstatus |
|---|---|---|---|
| NM_032119.4(ADGRV1):c.956dup (p.Asn319fs) (opens in a new tab) | Usher syndrome type 2C and 1 other | Patogen | ★★★★2 stjärnor av 4 kriterier angivna, flera inlämnare, inga konflikter |
| NM_032119.4(ADGRV1):c.12631C>T (p.Arg4211Ter) (opens in a new tab) | Usher syndrome type 2C and 1 other | Patogen | ★★★★2 stjärnor av 4 kriterier angivna, flera inlämnare, inga konflikter |
| NM_032119.4(ADGRV1):c.17668_17669del (p.Met5890fs) (opens in a new tab) | Usher syndrome type 2C and 1 other | Patogen | ★★★★2 stjärnor av 4 kriterier angivna, flera inlämnare, inga konflikter |
| NM_032119.4(ADGRV1):c.2612del (p.Gly871fs) (opens in a new tab) | Usher syndrome type 2C and 1 other | Patogen/sannolikt patogen | ★★★★2 stjärnor av 4 kriterier angivna, flera inlämnare, inga konflikter |
| NM_032119.4(ADGRV1):c.6901C>T (p.Gln2301Ter) (opens in a new tab) | Usher syndrome and 2 others | Patogen/sannolikt patogen | ★★★★2 stjärnor av 4 kriterier angivna, flera inlämnare, inga konflikter |
| NM_032119.4(ADGRV1):c.13232-1G>A (opens in a new tab) | Usher syndrome type 2C and 1 other | Patogen/sannolikt patogen | ★★★★2 stjärnor av 4 kriterier angivna, flera inlämnare, inga konflikter |
| NM_032119.4(ADGRV1):c.14973-2A>G (opens in a new tab) | Usher syndrome and 2 others | Patogen/sannolikt patogen | ★★★★2 stjärnor av 4 kriterier angivna, flera inlämnare, inga konflikter |
| NM_032119.4(ADGRV1):c.1055C>T (p.Pro352Leu) (opens in a new tab) | Usher syndrome and 2 others | Sannolikt patogen | ★★★★2 stjärnor av 4 kriterier angivna, flera inlämnare, inga konflikter |
| NM_032119.4(ADGRV1):c.2898G>A (p.Glu966=) (opens in a new tab) | Usher syndrome and 1 other | Sannolikt patogen | ★★★★2 stjärnor av 4 kriterier angivna, flera inlämnare, inga konflikter |
| NC_000005.10:g.90118339_90119245del (opens in a new tab) | Usher syndrome type 2C | Patogen | ★★★★1 stjärna av 4 kriterier angivna, en inlämnare |
| NM_032119.4(ADGRV1):c.227del (p.Gly76fs) (opens in a new tab) | Usher syndrome | Patogen | ★★★★1 stjärna av 4 kriterier angivna, en inlämnare |
| NM_032119.4(ADGRV1):c.2241-2A>G (opens in a new tab) | Usher syndrome type 2 | Patogen | ★★★★1 stjärna av 4 kriterier angivna, en inlämnare |
| NM_032119.4(ADGRV1):c.2277T>A (p.Tyr759Ter) (opens in a new tab) | Usher syndrome type 2C and 1 other | Patogen | ★★★★1 stjärna av 4 kriterier angivna, en inlämnare |
| NM_032119.4(ADGRV1):c.2398C>T (p.Arg800Ter) (opens in a new tab) | Usher syndrome type 2C and 1 other | Patogen | ★★★★1 stjärna av 4 kriterier angivna, en inlämnare |
| NM_032119.4(ADGRV1):c.2437C>T (p.Arg813Ter) (opens in a new tab) | Usher syndrome type 2C | Patogen | ★★★★1 stjärna av 4 kriterier angivna, en inlämnare |
| NM_032119.4(ADGRV1):c.2758C>T (p.Arg920Ter) (opens in a new tab) | Usher syndrome type 2C | Patogen | ★★★★1 stjärna av 4 kriterier angivna, en inlämnare |
| NM_032119.4(ADGRV1):c.2812C>T (p.Gln938Ter) (opens in a new tab) | Usher syndrome | Patogen | ★★★★1 stjärna av 4 kriterier angivna, en inlämnare |
| NM_032119.4(ADGRV1):c.2864C>A (p.Ser955Ter) (opens in a new tab) | Usher syndrome | Patogen | ★★★★1 stjärna av 4 kriterier angivna, en inlämnare |
| NM_032119.4(ADGRV1):c.2871del (p.Asn957fs) (opens in a new tab) | febrile seizures, familial, 4 | Patogen | ★★★★1 stjärna av 4 kriterier angivna, en inlämnare |
| NM_032119.4(ADGRV1):c.3133del (p.Ala1045fs) (opens in a new tab) | Usher syndrome type 2C | Patogen | ★★★★1 stjärna av 4 kriterier angivna, en inlämnare |
| NM_032119.4(ADGRV1):c.3195dup (p.Gly1066fs) (opens in a new tab) | Usher syndrome type 2 | Patogen | ★★★★1 stjärna av 4 kriterier angivna, en inlämnare |
| NM_032119.4(ADGRV1):c.3364dup (p.Ser1122fs) (opens in a new tab) | Usher syndrome and 2 others | Patogen | ★★★★1 stjärna av 4 kriterier angivna, en inlämnare |
| NM_032119.4(ADGRV1):c.3438C>G (p.Tyr1146Ter) (opens in a new tab) | Usher syndrome | Patogen | ★★★★1 stjärna av 4 kriterier angivna, en inlämnare |
| NM_032119.4(ADGRV1):c.3827del (p.Gly1276fs) (opens in a new tab) | Usher syndrome type 2C | Patogen | ★★★★1 stjärna av 4 kriterier angivna, en inlämnare |
| NM_032119.4(ADGRV1):c.3855G>A (p.Trp1285Ter) (opens in a new tab) | Usher syndrome type 2C | Patogen | ★★★★1 stjärna av 4 kriterier angivna, en inlämnare |
See all 161 with every other ADGRV1 variant in ClinVar → (opens in a new tab)
Gener kopplade till samma tillstånd
- ARSGarylsulfatase GDelar 1 tillstånd
- CDH23cadherin related 23Delar 1 tillstånd
- CLRN1clarin 1Delar 1 tillstånd
- HARS1histidyl-tRNA synthetase 1Delar 1 tillstånd
- MYO7Amyosin VIIADelar 1 tillstånd
- PCDH15protocadherin related 15Delar 1 tillstånd
- USH1CUSH1 protein network component harmoninDelar 1 tillstånd
- USH1GUSH1 protein network component sansDelar 1 tillstånd
- USH2AusherinDelar 1 tillstånd
- WHRNwhirlinDelar 1 tillstånd
Egenskaper kopplade till ADGRV1
Human Phenotype Ontology listar dessa som kännetecken för de sällsynta tillstånd som ADGRV1 kan orsaka. Varje egenskaps sida visar de andra gener som är kopplade till den.
Abnormality of the nervous system
- Generalized-onset seizure
- Brief seizures with staring spells
- Difficulty sleeping
- Febrile seizure (within the age range of 3 months to 6 years)
- Abnormality of balance
- Anxiety
- Ataxia
- Atypical absence status epilepticus
Visa ytterligare 19 egenskaper
- Cognitive impairment
- Cortical dysplasia
- Depression
- EEG with spike-wave complexes
- Generalized cerebral degeneration/underdevelopment
- Generalized myoclonic seizure
- Grand mal seizures
- Incoordination
- Loss of developmental milestones
- Poor fine motor coordination
- Sudden loss of muscle tone
- Autism spectrum disorder
- Focal impaired awareness seizure
- Obsessive-compulsive trait
- Repeated seizures without recovery between them
- Seizure affecting one half of brain
- Slow movements
- Tremor
- Generalized tonic seizure
Externa länkar
Genposter
Transkript
Protein
Varifrån detta kommer
- HGNC: genens symbol, namn, andra symboler och position.
- MANE Select v1.5, från NCBI och EMBL-EBI: transkriptet, dess exoner och kodande sekvens.
- GenCC och ClinGen, släppta 2026-10-19: vilka tillstånd genen är kopplad till och hur starkt.
- ACMG:s lista över sekundära fynd, SF v3.2.
- ClinVar och GIAB-stratifieringarna: kända sjukdomsframkallande positioner och de områden som kortläsningar har svårt för.
- Genome in a Bottle-stratifieringarna från NIST: poängen för sekvenseringssvårighet.
- Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: egenskaperna som är kopplade till genen. Läs mer på hpo.jax.org.
- Dataversion 2026.10.19-9814e911.
Citera den här sidan
Dante Labs. (u.å.). ADGRV1-genen: adhesion G protein-coupled receptor V1. Hämtad 19 oktober 2026, från https://dantelabs.com/sv/genes/adgrv1
Dante Labs. ADGRV1-genen: adhesion G protein-coupled receptor V1 [Internet]. [citerad 19 oktober 2026]. Tillgänglig på: https://dantelabs.com/sv/genes/adgrv1
Ett test. Ett helt liv av svar.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor