Gen
CLRN1
clarin 1
- HGNC 12605↗(åpnes i ny fane)
- Ensembl-gen ENSG00000163646↗(åpnes i ny fane)
- NCBI Gene 7401↗(åpnes i ny fane)
Sammendrag
- Cytogenetisk plassering
- 3q25.1
- Koordinater
- Kromosom 3: 150 926 567–150 972 727 (GRCh38)
- Eksoner
- 3 eksoner over 46,2 kb
- Protein
- 232 aminosyrer
- Arvelighet
- Autosomal recessiv
- Tidligere symboler
- USH3, USH3A, RP61
- MANE Select-transkripsjon
- ENST00000327047.6NM_174878.3
- Lokustype
- gene with protein product
- Svært høy
- Sikker
- Lav
- Svært lav
ReferansegenomGRCh38hg38
Posisjoner på gen- og variantsidene følger dette valget i denne nettleseren.
Les CLRN1 og resten av genomet ditt med én test.
Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker
Få mitt Genome TestKuraterte rapporter som er relevante for dette genet
Usher-syndrom
- Autosomal recessiv
En gruppe recessive tilstander (type 1 til 4) som gir sensorineuralt hørselstap, progressiv retinitis pigmentosa og, hos noen typer, balanseproblemer. De er knyttet til gener som USH2A, MYO7A, CDH23, PCDH15, USH1C, USH1G, ADGRV1, WHRN, CLRN1 og ARSG.
- ClinGen vurderer koblingen som definitiv
- 4 GenCC-innsendere vurderer den som definitiv eller sterk
Hva kunnskapen endrer
En tidlig diagnose hjelper med beslutninger om tidspunkt for cochleaimplantat, øyekontroller og kvalifisering til studier med retinal behandling, og er relevant for bærerscreening.
Bredere grupperinger
Retinitis pigmentosa
Ett av 77 gener knyttet til den
En gruppe arvelige netthinnedystrofier med progressivt tap av stavceller og deretter tappceller, som gir nattblindhet og gradvis tap av perifert syn.
- 2 GenCC-innsendere vurderer den som definitiv eller sterk
Arv
- Autosomal recessiv
- Det kreves en endret kopi fra hver forelder. Med én er du bærer og vanligvis uten sykdom. Når begge foreldrene er bærere, har hvert barn en sjanse på én av fire til å arve to.
Slik er CLRN1 bygget opp
- Kodende sekvens
- Utranslatert region
- Intron
- Transkripsjonsretning
- Kjente sykdomsfremkallende posisjoner
- Områder som korte avlesninger sliter med
Eksoner i genets MANE Select-transkripsjon (utgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referansegenomet GRCh38.
Kromosombånd fra UCSCs GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Gener i nærheten fra Ensembl-utgave 116, på GRCh38.
Eksonene utgjør 2,1 kb av genets 46,2 kb, og 699 av disse basene koder for proteinet.
Slik leser en genetisk test CLRN1
58
posisjoner i CLRN1 der ClinVar klassifiserer en endring som patogen eller sannsynligvis patogen
Ingen av dem faller i et område som korte avlesninger sliter med.
En helgenomsekvensering dekker alle 46,2 kb av CLRN1, inkludert introner, og ikke bare de 2,1 kb med eksoner.
Gener knyttet til de samme tilstandene
- USH2AusherinDeler 2 tilstander
- ABCA4ATP binding cassette subfamily A member 4Deler 1 tilstand
- ADGRV1adhesion G protein-coupled receptor V1Deler 1 tilstand
- AGBL5AGBL carboxypeptidase 5Deler 1 tilstand
- AHRaryl hydrocarbon receptorDeler 1 tilstand
- ARHGEF18Rho/Rac guanine nucleotide exchange factor 18Deler 1 tilstand
- ARL2BPARF like GTPase 2 binding proteinDeler 1 tilstand
- ARL3ARF like GTPase 3Deler 1 tilstand
- ARL6ARF like GTPase 6Deler 1 tilstand
- ARSGarylsulfatase GDeler 1 tilstand
- BBS2Bardet-Biedl syndrome 2Deler 1 tilstand
- BEST1bestrophin 1Deler 1 tilstand
Egenskaper knyttet til CLRN1
The Human Phenotype Ontology lister disse som kjennetegn ved de sjeldne tilstandene CLRN1 kan forårsake. Hver egenskaps side viser de andre genene som er knyttet til den.
Abnormality of the eye
- Decreased clarity of vision
- Rod-cone dystrophy
- Abnormal electroretinogram
- Abnormal retinal pigmentation
- Blind spot
- Blindness
- Difficulties with night vision
- Extreme sensitivity of the eyes to light
Vis 26 egenskaper til
- Involuntary, rapid, rhythmic eye movements
- Light eye color
- Optic atrophy
- Progressive night blindness
- Retina degeneration
- Spicular pigmentation of the retina
- Visual impairment
- Visual loss
- Abnormal central response of multifocal electroretinogram
- Abnormal full-field electroretinogram
- Bulging cornea
- Cystoid macular edema
- Eye muscle paralysis
- Glaucoma
- Loss of peripheral vision
- Optic disc drusen
- Optic disc pallor
- Partial loss of field of vision
- Photoreceptor outer segment loss on macular OCT
- Posterior subcapsular cataract
- Retinal atrophy
- Abnormal color vision
- Photopsia
- Abnormal fundus pigmentation
- Limited peripheral vision
- Undetectable light- and dark-adapted electroretinogram
Eksterne lenker
Genposter
Transkripsjon
Protein
Hvor dette kommer fra
- HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og plassering.
- MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, dets eksoner og kodingssekvens.
- GenCC og ClinGen, utgitt 2026-10-16: hvilke tilstander genet er knyttet til, og hvor sterkt.
- ACMGs liste over sekundære funn, SF v3.2.
- ClinVar og GIAB-stratifiseringene: kjente sykdomsfremkallende posisjoner, og regionene som korte avlesninger har vanskelig for å dekke.
- The Human Phenotype Ontology, versjon 2026-09-01: egenskapene knyttet til genet. Les mer på hpo.jax.org.
- Datautgave 2026.10.16-c6eea6bf.
Siter denne siden
Dante Labs. (u.d.). CLRN1-genet: clarin 1. Hentet 16. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/no/genes/clrn1
Dante Labs. CLRN1-genet: clarin 1 [Internett]. [sitert 16. oktober 2026]. Tilgjengelig fra: https://dantelabs.com/no/genes/clrn1
Én test. En livstid med svar.
Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker