Hoppa till innehållet
Använd dina HSA- eller FSA-medel
Sekvensera ditt genom (öppnas i en ny flik)

Gen

VARS1

valyl-tRNA synthetase 1

Sammanfattning

Cytogenetisk position
6p21.33
Koordinater
Kromosom 6: 31 777 518–31 795 752 (GRCh38)
Exoner
30 exoner på 18,2 kb
Protein
1 264 aminosyror
Tidigare symboler
VARS2, VARS
MANE Select-transkript
ENST00000375663.8NM_006295.3
Lokustyp
gene with protein product
  • Mycket hög
  • Säker
  • Låg
  • Mycket låg

Kuraterade rapporter som är relevanta för denna gen

Ingen Genome Test-rapport läser VARS1 ännu. Testet sekvenserar hela ditt genom, så dina data innehåller den ändå.

Så är VARS1 uppbyggd

  • Kodande sekvens
  • Otranslaterad region
  • Intron
  • Transkriptionsriktning
  • Kända sjukdomsorsakande ställen
  • Sträckor som korta läsningar har svårt för
Kromosom 6, med en parentes där VARS1 finns. VARS1 och 69 gener i närheten på kromosom 6, från 31 286 635 till 32 286 634.Kromosom 66p21.33p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23p22.3p22.2p22.1p21.33p21.32p21.31p21.2p21.1p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12q13q14.1q14.2q14.3q15q16.1q16.2q16.3q21q22.1q22.2q22.31q22.32q22.33q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q26q2731,4 Mb31,6 Mb31,8 Mb32 Mb32,2 MbHLA-B: 31 353 195–31 367 067, bakåt-strängHLA-BMICA: 31 399 784–31 415 315, framåt-strängMICAMICB: 31 494 881–31 511 124, framåt-strängMICBMCCD1: 31 528 962–31 530 232, framåt-strängMCCD1DDX39B: 31 530 217–31 542 451, bakåt-strängDDX39BATP6V1G2-DDX39B: 31 530 219–31 546 608, bakåt-strängATP6V1G2: 31 544 444–31 548 427, bakåt-strängNFKBIL1: 31 546 870–31 558 829, framåt-strängLTA: 31 572 054–31 574 324, framåt-strängTNF: 31 575 558–31 578 336, framåt-strängTNFLTB: 31 580 525–31 582 522, bakåt-strängLST1: 31 581 065–31 588 911, framåt-strängLST1NCR3: 31 588 895–31 593 217, bakåt-strängNCR3AIF1: 31 615 214–31 617 025, framåt-strängAIF1PRRC2A: 31 620 675–31 637 771, framåt-strängPRRC2A: 31 622 774–31 622 860, framåt-sträng: 31 623 874–31 625 499, framåt-strängBAG6: 31 638 543–31 652 747, bakåt-strängAPOM: 31 652 416–31 658 214, framåt-strängC6orf47: 31 658 298–31 660 778, bakåt-strängGPANK1: 31 661 228–31 666 283, bakåt-strängCSNK2B: 31 665 227–31 670 343, framåt-sträng: 31 666 102–31 673 546, framåt-strängLY6G5B: 31 669 976–31 673 776, framåt-strängLY6G5C: 31 676 684–31 684 040, bakåt-strängLY6G5CABHD16A: 31 686 954–31 703 391, bakåt-strängABHD16ALY6G6F: 31 706 863–31 710 801, framåt-strängLY6G6F-LY6G6D: 31 706 904–31 717 918, framåt-strängLY6G6D: 31 715 285–31 717 919, framåt-strängMPIG6B: 31 718 594–31 726 714, framåt-strängLY6G6C: 31 718 648–31 721 746, bakåt-strängDDAH2: 31 726 586–31 730 617, bakåt-strängCLIC1: 31 730 579–31 740 558, bakåt-strängMSH5: 31 739 677–31 762 678, framåt-strängMSH5MSH5-SAPCD1: 31 740 020–31 764 851, framåt-strängSAPCD1: 31 762 656–31 764 851, framåt-strängSAPCD1VWA7: 31 765 590–31 777 328, bakåt-strängVWA7VARS1: 31 777 518–31 795 752, bakåt-strängVARS1LSM2: 31 797 019–31 806 992, bakåt-strängLSM2HSPA1L: 31 809 619–31 815 788, bakåt-strängHSPA1A: 31 815 543–31 817 994, framåt-strängHSPA1B: 31 827 738–31 830 254, framåt-strängHSPA1BNEU1: 31 857 063–31 862 905, bakåt-strängNEU1SLC44A4: 31 863 173–31 879 198, bakåt-strängSLC44A4EHMT2: 31 879 758–31 897 723, bakåt-strängEHMT2C2: 31 897 785–31 945 677, framåt-strängC2ZBTB12: 31 899 065–31 902 103, bakåt-strängZBTB12: 31 927 698–31 952 048, framåt-strängCFB: 31 945 650–31 952 086, framåt-strängCFBNELFE: 31 952 087–31 959 079, bakåt-strängSKIC2: 31 959 025–31 969 852, framåt-strängSKIC2DXO: 31 969 810–31 972 517, bakåt-strängWHR1: 31 971 091–31 982 821, framåt-strängC4A: 31 981 991–32 005 247, framåt-strängC4AC4B: 32 014 725–32 035 975, framåt-strängC4BCYP21A2: 32 038 297–32 042 321, framåt-strängCYP21A2TNXB: 32 041 153–32 115 334, bakåt-strängTNXBATF6B: 32 115 264–32 128 255, bakåt-strängATF6BFKBPL: 32 128 697–32 131 070, bakåt-strängFKBPLPPT2: 32 146 580–32 163 679, framåt-strängPRRT1: 32 147 292–32 153 083, bakåt-strängPRRT1: 32 150 495–32 154 373, bakåt-strängPPT2-EGFL8: 32 153 845–32 171 978, framåt-strängEGFL8: 32 163 918–32 171 980, framåt-strängAGPAT1: 32 167 118–32 178 112, bakåt-strängRNF5: 32 178 391–32 184 769, framåt-strängAGER: 32 180 963–32 184 365, bakåt-strängPBX2: 32 184 733–32 190 278, bakåt-strängGPSM3: 32 190 766–32 195 523, bakåt-strängNOTCH4: 32 194 843–32 224 111, bakåt-strängNOTCH4Diagram över VARS1: 30 exoner på bakåt-strängen av kromosom 6Exon 29: 3 kända sjukdomsorsakande ställenExon 28: 3 kända sjukdomsorsakande ställenExon 27: 6 kända sjukdomsorsakande ställenExon 25: 3 kända sjukdomsorsakande ställenExon 20: 1 känt sjukdomsorsakande ställeExon 15: 1 känt sjukdomsorsakande ställeExon 13: 1 känt sjukdomsorsakande ställeExon 9: 2 kända sjukdomsorsakande ställenExon 5: 1 känt sjukdomsorsakande ställeExon 4: 1 känt sjukdomsorsakande ställeExon 2: 1 känt sjukdomsorsakande ställeExon 30: 31 777 518–31 777 662, 145 baserExon 29: 31 778 967–31 779 292, 326 baserExon 28: 31 779 425–31 779 536, 112 baserExon 27: 31 779 608–31 779 814, 207 baserExon 26: 31 779 998–31 780 153, 156 baserExon 25: 31 780 441–31 780 568, 128 baserExon 24: 31 780 705–31 780 783, 79 baserExon 23: 31 780 870–31 780 938, 69 baserExon 22: 31 781 019–31 781 123, 105 baserExon 21: 31 781 481–31 781 606, 126 baserExon 20: 31 781 691–31 781 761, 71 baserExon 19: 31 781 847–31 781 952, 106 baserExon 18: 31 782 087–31 782 177, 91 baserExon 17: 31 782 285–31 782 443, 159 baserExon 16: 31 782 530–31 782 633, 104 baserExon 15: 31 782 721–31 782 845, 125 baserExon 14: 31 783 096–31 783 186, 91 baserExon 13: 31 784 214–31 784 308, 95 baserExon 12: 31 784 394–31 784 502, 109 baserExon 11: 31 784 595–31 784 714, 120 baserExon 10: 31 785 246–31 785 327, 82 baserExon 9: 31 785 569–31 785 733, 165 baserExon 8: 31 791 610–31 791 737, 128 baserExon 7: 31 791 871–31 791 971, 101 baserExon 6: 31 792 217–31 792 301, 85 baserExon 5: 31 792 392–31 792 516, 125 baserExon 4: 31 792 757–31 792 895, 139 baserExon 3: 31 792 986–31 793 120, 135 baserExon 2: 31 794 831–31 795 250, 420 baserExon 1: 31 795 546–31 795 752, 207 baser3025201510515′3′

Exoner i genens MANE Select-transkript (version v1.5), från NCBI och EMBL-EBI, på referensgenomet GRCh38.

Kromosombanden från UCSC:s GRCh38-ideogram (2022-10-29).

Närliggande gener från Ensembl-version 116, på GRCh38.

Exoner utgör 4,1 kb av genens 18,2 kb, och 3 795 av dessa baser kodar för proteinet.

Så läser ett genomtest VARS1

25

positioner i VARS1 där ClinVar klassar en förändring som patogen eller sannolikt patogen

25 av dem (100 %) ligger i områden som korta läsningar har svårt för.

  • MHC (25 ställen)The major histocompatibility complex (HLA genes), highly polymorphic and poorly represented by a single reference.

En helgenomsanalys täcker alla 18,2 kb av VARS1, med introner inräknade, inte bara de 4,1 kb exoner.

Egenskaper kopplade till VARS1

Human Phenotype Ontology listar dessa som kännetecken för de sällsynta tillstånd som VARS1 kan orsaka. Varje egenskaps sida visar de andra gener som är kopplade till den.

Externa länkar

Varifrån detta kommer

  • HGNC: genens symbol, namn, andra symboler och position.
  • MANE Select v1.5, från NCBI och EMBL-EBI: transkriptet, dess exoner och kodande sekvens.
  • ClinVar och GIAB-stratifieringarna: kända sjukdomsorsakande positioner och de regioner där korta läsningar har svårt.
  • Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: egenskaperna som är kopplade till genen. Läs mer på hpo.jax.org.
  • Dataversion 2026.10.16-c6eea6bf.

Citera den här sidan

APA

Dante Labs. (u.å.). VARS1-genen: valyl-tRNA synthetase 1. Hämtad 17 oktober 2026, från https://dantelabs.com/sv/genes/vars1

Vancouver

Dante Labs. VARS1-genen: valyl-tRNA synthetase 1 [Internet]. [citerad 17 oktober 2026]. Tillgänglig på: https://dantelabs.com/sv/genes/vars1

Ett test. Ett helt liv av svar.

Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor

Beställ mitt Genome Test