Siirry sisältöön
Käytä HSA- tai FSA-varojasi

Geeni

VARS1

valyl-tRNA synthetase 1

Yhteenveto

Sytogeneettinen sijainti
6p21.33
Koordinaatit
Kromosomi 6: 31 777 518–31 795 752 (GRCh38)
Eksonit
30 eksonia 18,2 kb:n alueella
Proteiini
1 264 aminohappoa
Aiemmat symbolit
VARS2, VARS
MANE Select -transkripti
ENST00000375663.8NM_006295.3
Lokustyyppi
gene with protein product
  • Erittäin korkea
  • Varma
  • Matala
  • Erittäin matala

ViitegenomiGRCh38

Geenien ja varianttien sivujen sijainnit noudattavat tätä valintaa tässä selaimessa.

Tähän geeniin liittyviä kuratoituja raportteja

Mikään Genome Test -raportti ei vielä lue geeniä VARS1. Testi sekvensoi koko genomisi, joten tiedoissasi on se silti.

VARS1-geenin rakenne

  • Koodaava jakso
  • Translatoimaton alue
  • Intron
  • Transkription suunta
  • Tunnetut tautia aiheuttavat kohdat
  • Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
Kromosomi 6, jossa hakasulke osoittaa VARS1-geenin sijainnin. VARS1 ja 69 geeniä sen läheisyydessä kromosomissa 6, välillä 31 286 635–32 286 634.Kromosomi 66p21.33p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23p22.3p22.2p22.1p21.33p21.32p21.31p21.2p21.1p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12q13q14.1q14.2q14.3q15q16.1q16.2q16.3q21q22.1q22.2q22.31q22.32q22.33q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q26q2731,4 Mb31,6 Mb31,8 Mb32 Mb32,2 MbHLA-B: 31 353 195–31 367 067, juoste taaksepäinHLA-BMICA: 31 399 784–31 415 315, juoste eteenpäinMICAMICB: 31 494 881–31 511 124, juoste eteenpäinMICBMCCD1: 31 528 962–31 530 232, juoste eteenpäinMCCD1DDX39B: 31 530 217–31 542 451, juoste taaksepäinDDX39BATP6V1G2-DDX39B: 31 530 219–31 546 608, juoste taaksepäinATP6V1G2: 31 544 444–31 548 427, juoste taaksepäinNFKBIL1: 31 546 870–31 558 829, juoste eteenpäinLTA: 31 572 054–31 574 324, juoste eteenpäinTNF: 31 575 558–31 578 336, juoste eteenpäinTNFLTB: 31 580 525–31 582 522, juoste taaksepäinLST1: 31 581 065–31 588 911, juoste eteenpäinLST1NCR3: 31 588 895–31 593 217, juoste taaksepäinNCR3AIF1: 31 615 214–31 617 025, juoste eteenpäinAIF1PRRC2A: 31 620 675–31 637 771, juoste eteenpäinPRRC2A: 31 622 774–31 622 860, juoste eteenpäin: 31 623 874–31 625 499, juoste eteenpäinBAG6: 31 638 543–31 652 747, juoste taaksepäinAPOM: 31 652 416–31 658 214, juoste eteenpäinC6orf47: 31 658 298–31 660 778, juoste taaksepäinGPANK1: 31 661 228–31 666 283, juoste taaksepäinCSNK2B: 31 665 227–31 670 343, juoste eteenpäin: 31 666 102–31 673 546, juoste eteenpäinLY6G5B: 31 669 976–31 673 776, juoste eteenpäinLY6G5C: 31 676 684–31 684 040, juoste taaksepäinLY6G5CABHD16A: 31 686 954–31 703 391, juoste taaksepäinABHD16ALY6G6F: 31 706 863–31 710 801, juoste eteenpäinLY6G6F-LY6G6D: 31 706 904–31 717 918, juoste eteenpäinLY6G6D: 31 715 285–31 717 919, juoste eteenpäinMPIG6B: 31 718 594–31 726 714, juoste eteenpäinLY6G6C: 31 718 648–31 721 746, juoste taaksepäinDDAH2: 31 726 586–31 730 617, juoste taaksepäinCLIC1: 31 730 579–31 740 558, juoste taaksepäinMSH5: 31 739 677–31 762 678, juoste eteenpäinMSH5MSH5-SAPCD1: 31 740 020–31 764 851, juoste eteenpäinSAPCD1: 31 762 656–31 764 851, juoste eteenpäinSAPCD1VWA7: 31 765 590–31 777 328, juoste taaksepäinVWA7VARS1: 31 777 518–31 795 752, juoste taaksepäinVARS1LSM2: 31 797 019–31 806 992, juoste taaksepäinLSM2HSPA1L: 31 809 619–31 815 788, juoste taaksepäinHSPA1A: 31 815 543–31 817 994, juoste eteenpäinHSPA1B: 31 827 738–31 830 254, juoste eteenpäinHSPA1BNEU1: 31 857 063–31 862 905, juoste taaksepäinNEU1SLC44A4: 31 863 173–31 879 198, juoste taaksepäinSLC44A4EHMT2: 31 879 758–31 897 723, juoste taaksepäinEHMT2C2: 31 897 785–31 945 677, juoste eteenpäinC2ZBTB12: 31 899 065–31 902 103, juoste taaksepäinZBTB12: 31 927 698–31 952 048, juoste eteenpäinCFB: 31 945 650–31 952 086, juoste eteenpäinCFBNELFE: 31 952 087–31 959 079, juoste taaksepäinSKIC2: 31 959 025–31 969 852, juoste eteenpäinSKIC2DXO: 31 969 810–31 972 517, juoste taaksepäinWHR1: 31 971 091–31 982 821, juoste eteenpäinC4A: 31 981 991–32 005 247, juoste eteenpäinC4AC4B: 32 014 725–32 035 975, juoste eteenpäinC4BCYP21A2: 32 038 297–32 042 321, juoste eteenpäinCYP21A2TNXB: 32 041 153–32 115 334, juoste taaksepäinTNXBATF6B: 32 115 264–32 128 255, juoste taaksepäinATF6BFKBPL: 32 128 697–32 131 070, juoste taaksepäinFKBPLPPT2: 32 146 580–32 163 679, juoste eteenpäinPRRT1: 32 147 292–32 153 083, juoste taaksepäinPRRT1: 32 150 495–32 154 373, juoste taaksepäinPPT2-EGFL8: 32 153 845–32 171 978, juoste eteenpäinEGFL8: 32 163 918–32 171 980, juoste eteenpäinAGPAT1: 32 167 118–32 178 112, juoste taaksepäinRNF5: 32 178 391–32 184 769, juoste eteenpäinAGER: 32 180 963–32 184 365, juoste taaksepäinPBX2: 32 184 733–32 190 278, juoste taaksepäinGPSM3: 32 190 766–32 195 523, juoste taaksepäinNOTCH4: 32 194 843–32 224 111, juoste taaksepäinNOTCH4VARS1-kaavio: 30 eksonia kromosomin 6 juosteella, taaksepäinEksoni 29: 3 tunnettua tautia aiheuttavaa kohtaaEksoni 28: 3 tunnettua tautia aiheuttavaa kohtaaEksoni 27: 6 tunnettua tautia aiheuttavaa kohtaaEksoni 25: 3 tunnettua tautia aiheuttavaa kohtaaEksoni 20: 1 tunnettu tautia aiheuttava kohtaEksoni 15: 1 tunnettu tautia aiheuttava kohtaEksoni 13: 1 tunnettu tautia aiheuttava kohtaEksoni 9: 2 tunnettua tautia aiheuttavaa kohtaaEksoni 5: 1 tunnettu tautia aiheuttava kohtaEksoni 4: 1 tunnettu tautia aiheuttava kohtaEksoni 2: 1 tunnettu tautia aiheuttava kohtaEkson 30: 31 777 518–31 777 662, 145 emästäEkson 29: 31 778 967–31 779 292, 326 emästäEkson 28: 31 779 425–31 779 536, 112 emästäEkson 27: 31 779 608–31 779 814, 207 emästäEkson 26: 31 779 998–31 780 153, 156 emästäEkson 25: 31 780 441–31 780 568, 128 emästäEkson 24: 31 780 705–31 780 783, 79 emästäEkson 23: 31 780 870–31 780 938, 69 emästäEkson 22: 31 781 019–31 781 123, 105 emästäEkson 21: 31 781 481–31 781 606, 126 emästäEkson 20: 31 781 691–31 781 761, 71 emästäEkson 19: 31 781 847–31 781 952, 106 emästäEkson 18: 31 782 087–31 782 177, 91 emästäEkson 17: 31 782 285–31 782 443, 159 emästäEkson 16: 31 782 530–31 782 633, 104 emästäEkson 15: 31 782 721–31 782 845, 125 emästäEkson 14: 31 783 096–31 783 186, 91 emästäEkson 13: 31 784 214–31 784 308, 95 emästäEkson 12: 31 784 394–31 784 502, 109 emästäEkson 11: 31 784 595–31 784 714, 120 emästäEkson 10: 31 785 246–31 785 327, 82 emästäEkson 9: 31 785 569–31 785 733, 165 emästäEkson 8: 31 791 610–31 791 737, 128 emästäEkson 7: 31 791 871–31 791 971, 101 emästäEkson 6: 31 792 217–31 792 301, 85 emästäEkson 5: 31 792 392–31 792 516, 125 emästäEkson 4: 31 792 757–31 792 895, 139 emästäEkson 3: 31 792 986–31 793 120, 135 emästäEkson 2: 31 794 831–31 795 250, 420 emästäEkson 1: 31 795 546–31 795 752, 207 emästä3025201510515′3′

Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.

Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).

Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.

Eksonit muodostavat 4,1 kb geenin 18,2 kb:stä; 3 795 näistä emäksistä koodaa proteiinia.

Miten genomitesti lukee geeniä VARS1

25

VARS1-geenin kohtaa, joissa ClinVar luokittelee muutoksen patogeeniseksi tai todennäköisesti patogeeniseksi

Niistä 25 (100 %) osuu alueille, joita lyhyet lukemat löytävät vaikeasti.

  • MHC (25 kohtaa)The major histocompatibility complex (HLA genes), highly polymorphic and poorly represented by a single reference.

Kokogenomi kattaa kaikki 18,2 kb geenistä VARS1, intronit mukaan lukien, ei pelkästään 4,1 kb eksoneja.

Mistä tieto on peräisin

  • HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
  • MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkripti, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
  • ClinVar ja GIAB-stratifikaatiot: tunnetut tautia aiheuttavat kohdat sekä alueet, joiden lukeminen lyhyillä luennoilla on vaikeaa.
  • Human Phenotype Ontology, versio 2026-09-01: geeniin liittyvät piirteet. Lue lisää osoitteesta hpo.jax.org.
  • Datajulkaisu 2026.10.16-c6eea6bf.

Viittaa tähän sivuun

APA

Dante Labs. (n.d.). VARS1-geeni: valyl-tRNA synthetase 1. Haettu 16. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/vars1

Vancouver

Dante Labs. VARS1-geeni: valyl-tRNA synthetase 1 [Internet]. [viitattu 16. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/vars1

Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.

Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa

Tilaa Genome Test