Gene
KIDINS220
kinase D interacting substrate 220
- HGNC 29508↗(abre num novo separador)
- Gene Ensembl ENSG00000134313↗(abre num novo separador)
- Gene NCBI 57498↗(abre num novo separador)
Resumo
- Localização citogenética
- 2p25.1
- Coordenadas
- Cromossoma 2: 8 728 858–8 837 613 (GRCh38)
- Exões
- 30 exões ao longo de 108,8 kb
- Proteína
- 1771 aminoácidos
- Também conhecido como
- ARMS
- Transcrito MANE Select
- ENST00000256707.8NM_020738.4
- Tipo de locus
- Codificantes de proteínas
- Muito elevada
- Confiável
- Baixa
- Muito baixa
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page$gene$nameAnalise KIDINS220, e o resto do seu genoma, com um único teste.
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Ventriculomegalia e Artrogripose Relacionadas com KIDINS220
- Ventriculomegalia e ArtrogriposeAutossómica recessiva
Causada por alterações em ambas as cópias do KIDINS220, uma proteína transmembranar nas vias de sinalização neuronal que ajuda a regular o líquido cefalorraquidiano. Uma única nova alteração no KIDINS220 causa uma condição diferente, com paraplegia espástica, deficiência intelectual, nistagmo e obesidade (síndrome SINO).
- O ClinGen classifica a associação como definitiva
- 4 submissores da GenCC classificam-na como definitiva ou forte
▶Acionabilidade
Cuidados especializados de medicina fetal e aconselhamento quando detetada na gravidez. Os progenitores são geralmente portadores, pelo que estão disponíveis o rastreio de portador para familiares, o aconselhamento genético e as opções para futuras gravidezes.
Agrupamentos mais amplos
Paraplegia Espástica Hereditária
- Paraplegia Espástica Hereditária (Todos os Tipos)
Um de 66 genes ligados a este
Termo geral que abrange todas as paraplegias espásticas hereditárias, incluindo a SPG4 (SPAST), a forma dominante mais comum, bem como a SPG5A, a SPG6, a SPG10, a SPG18, a SPG30 e a SPG31.
- O ClinGen classifica a associação como definitiva
- 4 submissores da GenCC classificam-na como definitiva ou forte
Doenças Neurodegenerativas Hereditárias
- Doença Neurodegenerativa Associada a KIF5AAutossómica dominante
Um de 372 genes ligados a este
Causada por alterações numa cópia do gene KIF5A, que codifica uma proteína motora com uma cauda de ligação a carga. Diferentes tipos de alteração originam diferentes doenças: paraplegia espástica hereditária tipo 10, uma forma axonal da doença de Charcot-Marie-Tooth e esclerose lateral amiotrófica (ELA).
- O ClinGen classifica a associação como definitiva
- 4 submissores da GenCC classificam-na como definitiva ou forte
▶Acionabilidade
O tratamento é sintomático e depende da apresentação clínica, incluindo fisioterapia, medicamentos antiespásticos e cuidados multidisciplinares para a ELA. Cada filho de uma pessoa afetada tem uma probabilidade de 1 em 2 de herdar a alteração; o aconselhamento genético ajuda as famílias a compreender este risco.
Como KIDINS220 está organizado
- Sequência codificante
- Região não traduzida
- Intrão
- Sentido da transcrição
- Locais conhecidos associados a doença
- Regiões onde as leituras curtas têm dificuldade
Exões do transcrito MANE Select do gene (versão v1.5), da NCBI e da EMBL-EBI, na montagem de referência GRCh38.
Bandas cromossómicas do ideograma GRCh38 da UCSC (2022-10-29).
Genes próximos da versão 116 do Ensembl, em GRCh38.
Os exões representam 7,3 kb dos 108,8 kb do gene; 5316 dessas bases codificam a proteína.
Sequenciação de KIDINS220
19Moderado
Grau de dificuldade de sequenciar KIDINS220 com leituras curtas, numa escala de 0 a 100
0 · Fácil100 · Difícil
Alguns dos exões de KIDINS220 se situam em zonas onde as leituras curtas podem falhar ou posicionar mal uma alteração.
O que acresce: a proporção dos exões de KIDINS220 em cada tipo de região difícil
- MapeabilidadeTroços onde leituras de 100 ou 250 pb não podem ser posicionadas de forma única, pelo que uma chamada nessa zona pode estar em falta ou ser incorreta. Por si só, um gene inteiramente neste tipo de região obteria a pontuação 100.4,3%
- HomologiaDuplicações segmentares: cópias noutros pontos do genoma, como parálogos e pseudogenes, com 90% de identidade ou mais. Por si só, um gene inteiramente neste tipo de região obteria a pontuação 60.22%
- Partilhado com o chrYAs regiões pseudoautossómicas e a região transposta do X, onde o chrX e o chrY têm a mesma sequência ou uma quase idêntica, pelo que uma leitura de um pode ser posicionada no outro. Por si só, um gene inteiramente neste tipo de região obteria a pontuação 60.0%
- Cobertura da referênciaLacunas na montagem de referência nas proximidades, onde não existe sequência à qual as leituras se possam alinhar. Por si só, um gene inteiramente neste tipo de região obteria a pontuação 50.0%
- RepetiçõesRepetições em tandem e sequências de uma só base, em que as leituras escorregam e podem não as abranger. Por si só, um gene inteiramente neste tipo de região obteria a pontuação 30.1,5%
- Conteúdo em GCJanelas com menos de 25% ou mais de 65% de G e C, que a preparação da biblioteca cobre de forma deficiente. Por si só, um gene inteiramente neste tipo de região obteria a pontuação 20.9,7%
Uma pontuação da Dante Labs baseada na nossa própria investigação, construída a partir dos mapas de regiões difíceis de sequenciar Genome in a Bottle do NIST.Como é calculada a pontuaçãoCada barra representa a proporção das bases dos exões de KIDINS220 que se encontram nesse tipo de região difícil. Qualquer tipo pode, por si só, tornar um gene difícil, e cada tipo adicional acrescenta menos: 0 quando nenhuma base está em nenhuma, 100 quando todas as bases estão em zonas onde as leituras não podem ser posicionadas de forma única.
20
posições em KIDINS220 onde a ClinVar classifica uma alteração como patogénica ou provavelmente patogénica
Nenhuma delas se situa numa região que as leituras curtas têm dificuldade em analisar.
Um genoma completo cobre todos os 108,8 kb de KIDINS220, incluindo os intrões, e não apenas os 7,3 kb de exões.
ClinVar pathogenic variants (21)
The KIDINS220 variants ClinVar classifies pathogenic or likely pathogenic for any condition, reviewed by at least one submitter with criteria, and the most reviewed of them. It is ClinVar's public record of the gene, never a result.
- Patogénica 8
- Provavelmente patogénica 13
| Variante | Conditions | Classificação na ClinVar | Estado de revisão |
|---|---|---|---|
| NM_020738.4(KIDINS220):c.4499C>G (p.Ser1500Ter) (opens in a new tab) | hereditary spastic paraplegia | Patogénica | ★★★★1 estrela em 4 critérios fornecidos, um único submissor |
| NM_020738.4(KIDINS220):c.4412delinsAAG (p.Ser1471Ter) (opens in a new tab) | spastic paraplegia, intellectual disability, nystagmus, and obesity | Patogénica | ★★★★1 estrela em 4 critérios fornecidos, um único submissor |
| NM_020738.4(KIDINS220):c.4177C>T (p.Gln1393Ter) (opens in a new tab) | spastic paraplegia, intellectual disability, nystagmus, and obesity | Patogénica | ★★★★1 estrela em 4 critérios fornecidos, um único submissor |
| NM_020738.4(KIDINS220):c.3991delinsAGCCCTACACACTCAAC (p.Glu1331fs) (opens in a new tab) | spastic paraplegia, intellectual disability, nystagmus, and obesity | Patogénica | ★★★★1 estrela em 4 critérios fornecidos, um único submissor |
| NM_020738.4(KIDINS220):c.3504dup (p.Pro1169fs) (opens in a new tab) | ventriculomegaly and arthrogryposis | Patogénica | ★★★★1 estrela em 4 critérios fornecidos, um único submissor |
| NM_020738.4(KIDINS220):c.3415-4A>G (opens in a new tab) | spastic paraplegia, intellectual disability, nystagmus, and obesity | Patogénica | ★★★★1 estrela em 4 critérios fornecidos, um único submissor |
| NM_020738.4(KIDINS220):c.3395dup (p.His1133fs) (opens in a new tab) | spastic paraplegia, intellectual disability, nystagmus, and obesity | Patogénica | ★★★★1 estrela em 4 critérios fornecidos, um único submissor |
| NM_020738.4(KIDINS220):c.535C>T (p.Arg179Ter) (opens in a new tab) | spastic paraplegia, intellectual disability, nystagmus, and obesity | Patogénica | ★★★★1 estrela em 4 critérios fornecidos, um único submissor |
| NM_020738.4(KIDINS220):c.4448C>G (p.Ser1483Ter) (opens in a new tab) | spastic paraplegia, intellectual disability, nystagmus, and obesity | Provavelmente patogénica | ★★★★1 estrela em 4 critérios fornecidos, um único submissor |
| NM_020738.4(KIDINS220):c.4417dup (p.Leu1473fs) (opens in a new tab) | spastic paraplegia, intellectual disability, nystagmus, and obesity | Provavelmente patogénica | ★★★★1 estrela em 4 critérios fornecidos, um único submissor |
| NM_020738.4(KIDINS220):c.4388C>A (p.Ser1463Ter) (opens in a new tab) | spastic paraplegia, intellectual disability, nystagmus, and obesity | Provavelmente patogénica | ★★★★1 estrela em 4 critérios fornecidos, um único submissor |
| NM_020738.4(KIDINS220):c.4269del (p.Gly1425fs) (opens in a new tab) | spastic paraplegia, intellectual disability, nystagmus, and obesity | Provavelmente patogénica | ★★★★1 estrela em 4 critérios fornecidos, um único submissor |
| NM_020738.4(KIDINS220):c.4213_4216dup (p.Ile1406fs) (opens in a new tab) | spastic paraplegia, intellectual disability, nystagmus, and obesity | Provavelmente patogénica | ★★★★1 estrela em 4 critérios fornecidos, um único submissor |
| NM_020738.4(KIDINS220):c.4138C>T (p.Gln1380Ter) (opens in a new tab) | spastic paraplegia, intellectual disability, nystagmus, and obesity | Provavelmente patogénica | ★★★★1 estrela em 4 critérios fornecidos, um único submissor |
| NM_020738.4(KIDINS220):c.4013dup (p.Asp1339fs) (opens in a new tab) | spastic paraplegia, intellectual disability, nystagmus, and obesity | Provavelmente patogénica | ★★★★1 estrela em 4 critérios fornecidos, um único submissor |
| NM_020738.4(KIDINS220):c.3991G>T (p.Glu1331Ter) (opens in a new tab) | spastic paraplegia, intellectual disability, nystagmus, and obesity | Provavelmente patogénica | ★★★★1 estrela em 4 critérios fornecidos, um único submissor |
| NM_020738.4(KIDINS220):c.3960_3963del (p.Ser1320fs) (opens in a new tab) | spastic paraplegia, intellectual disability, nystagmus, and obesity | Provavelmente patogénica | ★★★★1 estrela em 4 critérios fornecidos, um único submissor |
| NM_020738.4(KIDINS220):c.2855T>A (p.Leu952Ter) (opens in a new tab) | spastic paraplegia, intellectual disability, nystagmus, and obesity | Provavelmente patogénica | ★★★★1 estrela em 4 critérios fornecidos, um único submissor |
| NM_020738.4(KIDINS220):c.2270_2328dup (p.Asp777delinsLysProLeuThrAlaSerLeuArgIleArgGlnGlyTrpTrpSerSerSerMetAspTer) (opens in a new tab) | spastic paraplegia, intellectual disability, nystagmus, and obesity and 1 other | Provavelmente patogénica | ★★★★1 estrela em 4 critérios fornecidos, um único submissor |
| NM_020738.4(KIDINS220):c.876T>G (p.Tyr292Ter) (opens in a new tab) | spastic paraplegia, intellectual disability, nystagmus, and obesity | Provavelmente patogénica | ★★★★1 estrela em 4 critérios fornecidos, um único submissor |
| NM_020738.4(KIDINS220):c.856C>T (p.Arg286Ter) (opens in a new tab) | spastic paraplegia, intellectual disability, nystagmus, and obesity | Provavelmente patogénica | ★★★★1 estrela em 4 critérios fornecidos, um único submissor |
Genes associados às mesmas condições
- ABCD1ATP binding cassette subfamily D member 1Partilha 2 condições
- ABHD16Aabhydrolase domain containing 16A, phospholipasePartilha 2 condições
- ALDH18A1aldehyde dehydrogenase 18 family member A1Partilha 2 condições
- AMFRautocrine motility factor receptorPartilha 2 condições
- AP4B1adaptor related protein complex 4 subunit beta 1Partilha 2 condições
- AP4E1adaptor related protein complex 4 subunit epsilon 1Partilha 2 condições
- AP4M1adaptor related protein complex 4 subunit mu 1Partilha 2 condições
- AP4S1adaptor related protein complex 4 subunit sigma 1Partilha 2 condições
- AP5Z1adaptor related protein complex 5 subunit zeta 1Partilha 2 condições
- ARL6IP1ARL6 interacting reticulophagy regulator 1Partilha 2 condições
- ATL1atlastin GTPase 1Partilha 2 condições
- ATP13A2ATPase cation transporting 13A2Partilha 2 condições
Características associadas a KIDINS220
A Human Phenotype Ontology indica estas características como sinais das doenças raras que KIDINS220 pode causar. A página de cada característica lista os outros genes a ela associados.
Abnormality of the eye
- Farsightedness
- Involuntary, rapid, rhythmic eye movements
- Optic nerve dysplasia
- Astigmatism
- Cross-eyed
- Decreased clarity of vision
- Deeply set eye
- Esophoria
Mostrar mais 1 característica
Ligações externas
Registos do gene
Transcrito
Proteína
De onde vem isto
- HGNC: o símbolo do gene, o nome, outros símbolos e a localização.
- MANE Select v1.5, da NCBI e da EMBL-EBI: o transcrito, os seus exões e a sequência codificante.
- GenCC e ClinGen, publicados em 2026-10-19: as condições a que o gene está associado e a força dessa associação.
- A lista de achados secundários do ACMG, SF v3.2.
- ClinVar e as estratificações GIAB: locais conhecidos que causam doença e as regiões que as leituras curtas têm dificuldade em analisar.
- As estratificações do genoma Genome in a Bottle, do NIST: a pontuação de dificuldade de sequenciação.
- Human Phenotype Ontology, versão 2026-09-01: as características associadas ao gene. Saiba mais em hpo.jax.org.
- Versão de dados 2026.10.19-9814e911.
Citar esta página
Dante Labs. (s.d.). Gene KIDINS220: kinase D interacting substrate 220. Consultado em 19 de outubro de 2026, em https://dantelabs.com/pt/genes/kidins220
Dante Labs. Gene KIDINS220: kinase D interacting substrate 220 [Internet]. [consultado em 19 de outubro de 2026]. Disponível em: https://dantelabs.com/pt/genes/kidins220
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