Gen
HEATR3
HEAT repeat containing 3
- HGNC 26087↗(otwiera się w nowej karcie)
- Gen Ensembl ENSG00000155393↗(otwiera się w nowej karcie)
- NCBI Gene 55027↗(otwiera się w nowej karcie)
Podsumowanie
- Lokalizacja cytogenetyczna
- 16q12.1
- Współrzędne
- Chromosom 16: 50 065 970–50 107 272 (GRCh38)
- Eksony
- 15 eksonów na odcinku 41,3 kb
- Białko
- 680 aminokwasów
- Znany również jako
- FLJ20718
- Transkrypt MANE Select
- ENST00000299192.8NM_182922.4
- Typ locus
- Kodujące białko
- Bardzo wysoka
- Pewna
- Niska
- Bardzo niska
Ta strona jako dane
Aby odczytać ją jako JSON, dodaj .json na końcu adresu strony lub zażądaj application/json.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/heatr3.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameOdczytaj HEATR3 oraz resztę swojego genomu dzięki jednemu badaniu.
Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni
Zamawiam Genome TestWyselekcjonowany raport dotyczący tego genu
Anemia Diamonda-Blackfana
- Autosomalne dominujące
Wrodzona, aregeneratywna i często makrocytarna niedokrwistość z erytroblastopenią.
- 2 podmiotów w GenCC ocenia je jako definitywne lub silne
Budowa genu HEATR3
- Sekwencja kodująca
- Region nieulegający translacji
- Intron
- Kierunek transkrypcji
- Znane miejsca powodujące choroby
- Odcinki, z którymi krótkie odczyty mają trudność
Eksony transkryptu MANE Select genu (wydanie v1.5) z NCBI i EMBL-EBI, na referencyjnym genomie GRCh38.
Prążki chromosomowe z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Pobliskie geny z wydania Ensembl 116, na GRCh38.
Eksony stanowią 4,4 kb z 41,3 kb genu; 2043 z tych zasad kodują białko.
Sekwencjonowanie HEATR3
4Łatwo
Jak trudno zsekwencjonować HEATR3 krótkimi odczytami, w skali do 100
0 · Łatwo100 · Trudno
Niemal wszystkie eksony HEATR3 znajdują się w miejscach, które krótkie odczyty mapują bez problemu.
Co na to wpływa: udział eksonów HEATR3 w każdym rodzaju trudnego regionu
- MapowalnośćOdcinki, w których odczytów 100 lub 250 bp nie da się jednoznacznie umieścić, więc wywołanie wariantu może tam brakować lub być błędne. Gen położony w całości w tego rodzaju regionie sam w sobie otrzymałby wynik 100.0%
- HomologiaDuplikacje segmentalne: kopie w innych miejscach genomu, takie jak paralogi i pseudogeny, o zgodności 90% lub więcej. Gen położony w całości w tego rodzaju regionie sam w sobie otrzymałby wynik 60.0%
- Wspólne z chrYRegiony pseudoautosomalne i region X-transpozycji, w których chrX i chrY mają tę samą lub niemal tę samą sekwencję, dlatego odczyt z jednego może zostać przypisany do drugiego. Gen położony w całości w tego rodzaju regionie sam w sobie otrzymałby wynik 60.0%
- Pokrycie sekwencji referencyjnejLuki w pobliskim składzie sekwencji referencyjnej, w których nie ma sekwencji, do której odczyty mogłyby się dopasować. Gen położony w całości w tego rodzaju regionie sam w sobie otrzymałby wynik 50.0%
- PowtórzeniaPowtórzenia tandemowe i ciągi jednej zasady, na których odczyty się ślizgają i których mogą nie obejmować. Gen położony w całości w tego rodzaju regionie sam w sobie otrzymałby wynik 30.5,3%
- Zawartość GCOkna z poniżej 25% lub powyżej 65% G i C, które przygotowanie biblioteki pokrywa słabo. Gen położony w całości w tego rodzaju regionie sam w sobie otrzymałby wynik 20.12%
Wynik Dante Labs z naszych własnych badań, oparty na mapach trudnych do zsekwencjonowania regionów Genome in a Bottle z NIST.Jak obliczany jest wynikKażdy słupek to udział zasad eksonów HEATR3 w danym rodzaju trudnego regionu. Każdy rodzaj może sam w sobie uczynić gen trudnym, a każdy kolejny dodaje coraz mniej: 0, gdy żadna zasada nie znajduje się w żadnym z nich, 100, gdy każda zasada leży tam, gdzie odczytów nie da się jednoznacznie umieścić.
2
pozycje w HEATR3, w których ClinVar klasyfikuje zmianę jako patogenną lub prawdopodobnie patogenną
Żadne z nich nie przypada na region, z którym krótkie odczyty mają trudności.
Genom w całości obejmuje wszystkie 41,3 kb genu HEATR3, łącznie z intronami, a nie tylko 4,4 kb eksonów.
ClinVar pathogenic variants (2)
The HEATR3 variants ClinVar classifies pathogenic or likely pathogenic for any condition, reviewed by at least one submitter with criteria, and the most reviewed of them. It is ClinVar's public record of the gene, never a result.
- Prawdopodobnie patogenny 2
| Wariant | Conditions | Klasyfikacja ClinVar | Status recenzji |
|---|---|---|---|
| NM_182922.4(HEATR3):c.202C>T (p.Gln68Ter) (opens in a new tab) | Diamond-Blackfan anemia 21 | Prawdopodobnie patogenny | ★★★★1 gwiazdka z 4 podano kryteria, jeden zgłaszający |
| NM_182922.4(HEATR3):c.805C>T (p.Gln269Ter) (opens in a new tab) | Diamond-Blackfan anemia 21 | Prawdopodobnie patogenny | ★★★★1 gwiazdka z 4 podano kryteria, jeden zgłaszający |
Geny powiązane z tymi samymi schorzeniami
- GATA1GATA binding protein 1Wspólne schorzenie: 1
- RPL11ribosomal protein L11Wspólne schorzenie: 1
- RPL15ribosomal protein L15Wspólne schorzenie: 1
- RPL26ribosomal protein L26Wspólne schorzenie: 1
- RPL35Aribosomal protein L35aWspólne schorzenie: 1
- RPL5ribosomal protein L5Wspólne schorzenie: 1
- RPS10ribosomal protein S10Wspólne schorzenie: 1
- RPS17ribosomal protein S17Wspólne schorzenie: 1
- RPS19ribosomal protein S19Wspólne schorzenie: 1
- RPS24ribosomal protein S24Wspólne schorzenie: 1
- RPS26ribosomal protein S26Wspólne schorzenie: 1
- RPS29ribosomal protein S29Wspólne schorzenie: 1
Cechy powiązane z genem HEATR3
Human Phenotype Ontology wymienia te cechy jako objawy rzadkich schorzeń, które może wywoływać HEATR3. Na stronie każdej cechy znajdują się inne geny z nią powiązane.
Linki zewnętrzne
Rekordy genów
Transkrypt
Białko
Skąd to pochodzi
- HGNC: symbol genu, nazwa, inne symbole i lokalizacja.
- MANE Select v1.5, z NCBI i EMBL-EBI: transkrypt, jego eksony i sekwencja kodująca.
- GenCC i ClinGen, wydanie 2026-10-19: z jakimi schorzeniami gen jest powiązany i jak silnie.
- Lista ACMG dotycząca wtórnych wyników, SF v3.2.
- ClinVar i stratyfikacje GIAB: znane miejsca powodujące choroby oraz regiony, które krótkie odczyty trudno odczytać.
- Stratyfikacje genomu Genome in a Bottle z NIST: wynik trudności sekwencjonowania.
- Human Phenotype Ontology, wersja 2026-09-01: cechy powiązane z genem. Więcej informacji znajdą Państwo na hpo.jax.org.
- Wydanie danych 2026.10.19-9814e911.
Cytuj tę stronę
Dante Labs. (b.d.). Gen HEATR3: HEAT repeat containing 3. Pobrano 20 października 2026, z https://dantelabs.com/pl/genes/heatr3
Dante Labs. Gen HEATR3: HEAT repeat containing 3 [Internet]. [cytowano 20 października 2026]. Dostępne w: https://dantelabs.com/pl/genes/heatr3
Jeden test. Odpowiedzi na całe życie.
Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni