Gen
TSC2
TSC complex subunit 2
- HGNC 12363↗(åpnes i ny fane)
- Ensembl-gen ENSG00000103197↗(åpnes i ny fane)
- NCBI Gene 7249↗(åpnes i ny fane)
Sammendrag
- Cytogenetisk plassering
- 16p13.3
- Koordinater
- Kromosom 16: 2 047 985–2 089 491 (GRCh38)
- Eksoner
- 42 eksoner over 41,5 kb
- Protein
- 1 807 aminosyrer
- Arvelighet
- Autosomal dominant
- Også kjent som
- tuberin, LAM, PPP1R160
- Tidligere symboler
- TSC4
- MANE Select-transkripsjon
- ENST00000219476.9NM_000548.5
- Lokustype
- gene with protein product
- Svært høy
- Sikker
- Lav
- Svært lav
ReferansegenomGRCh38hg38
Posisjoner på gen- og variantsidene følger dette valget i denne nettleseren.
Les TSC2 og resten av genomet ditt med én test.
Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker
Få mitt Genome TestKuratert rapport som er relevant for dette genet
Tuberøs sklerose
- Autosomal dominant
Arvelig sykdom preget av epileptiske anfall, intellektuell funksjonsnedsettelse, forsinket utvikling og hud- og øyeforandringer. Første tegn oppstår vanligvis i spedbarns- eller barnealder, men i sjeldne tilfeller først i 2.- eller 3.-tiåret.
- 5 GenCC-innsendere vurderer den som definitiv eller sterk
- På ACMGs liste over sekundære funn
Hva kunnskapen endrer
mTOR-hemmere, antiepileptiske legemidler, overvåkingsundersøkelser med bildediagnostikk, kirurgisk behandling av komplikasjoner
Arv
- Autosomal dominant
- Én endret kopi, fra enten forelder, er nok. En forelder som har én, gir den videre til hvert barn med en sjanse på én av to.
Slik er TSC2 bygget opp
- Kodende sekvens
- Utranslatert region
- Intron
- Transkripsjonsretning
- Kjente sykdomsfremkallende posisjoner
- Områder som korte avlesninger sliter med
- Varianter med egen side
Eksoner i genets MANE Select-transkripsjon (utgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referansegenomet GRCh38.
Kromosombånd fra UCSCs GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Gener i nærheten fra Ensembl-utgave 116, på GRCh38.
Eksonene utgjør 6,4 kb av genets 41,5 kb, og 5 424 av disse basene koder for proteinet.
Slik leser en genetisk test TSC2
1 047
posisjoner i TSC2 der ClinVar klassifiserer en endring som patogen eller sannsynligvis patogen
Ingen av dem faller i et område som korte avlesninger sliter med.
En helgenomsekvensering dekker alle 41,5 kb av TSC2, inkludert introner, og ikke bare de 6,4 kb med eksoner.
Varianter med egen side (209)
De TSC2-variantene med egen side her, med flest stjerner for vurdering først. Hver side beskriver ClinVars offentlige opplysninger om varianten, aldri et resultat.
| Variant | HGVS c. | Ekson eller intron | Posisjon (GRCh38) | ClinVar-klassifisering | Vurderingsstatus |
|---|---|---|---|---|---|
| A889V | c.2666C>T | Ekson 24 | 2 076 094 | Patogen/sannsynligvis patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter |
| c.138+5G>A | Intron 2 | 2 048 758 | Patogen/sannsynligvis patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter | |
| c.139-1G>A | Intron 2 | 2 050 399 | Patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter | |
| c.139-2A>G | Intron 2 | 2 050 398 | Patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter | |
| c.225+1G>A | Intron 3 | 2 050 487 | Patogen/sannsynligvis patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter | |
| c.336+1G>T | Intron 4 | 2 053 453 | Patogen/sannsynligvis patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter | |
| c.336+5G>C | Intron 4 | 2 053 457 | Patogen/sannsynligvis patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter | |
| c.337-1G>A | Intron 4 | 2 054 295 | Patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter | |
| c.481+1G>A | Intron 5 | 2 054 441 | Patogen/sannsynligvis patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter | |
| c.599+1G>A | Intron 6 | 2 055 520 | Patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter |
Gener knyttet til de samme tilstandene
Egenskaper knyttet til TSC2
The Human Phenotype Ontology lister disse som kjennetegn ved de sjeldne tilstandene TSC2 kan forårsake. Hver egenskaps side viser de andre genene som er knyttet til den.
Abnormality of the nervous system
- Behavioral abnormality
- Cortical dysplasia
- Cortical tubers
- Epilepsy
- Subependymal nodules
- Abnormal social behavior
- Aggressive behavior
- Autism
Vis 30 egenskaper til
- Autism spectrum disorder
- Depression
- Difficulty sleeping
- Epileptic spasm
- Impulsivity
- Infantile spasms
- Intellectual disability
- More active than typical
- Neurodevelopmental delay
- Repeated seizures without recovery between them
- Repetitive compulsive behavior
- Seizure affecting one half of brain
- Self-injurious behavior
- Specific learning disability
- Anxiety
- Attention deficit
- Cognitive impairment
- Noncommunicating hydrocephalus
- Poor speech
- Subependymal giant-cell astrocytoma
- Too much cerebrospinal fluid in the brain
- Astrocytoma
- Astrocytosis
- Ependymoma
- Focal cortical dysplasia type II
- Focal impaired awareness seizure
- Focal white matter lesions
- Hemimegalencephaly
- Optic nerve glioma
- Weakness of one side of body
Abnormality of the integument
- Generalized abnormality of skin
- Hypomelanotic macule
- Confetti-like hypopigmented macules
- Shagreen patch
- Skin plaque
- Ungual fibroma
- Abnormal skin pigmentation
- Epidermoid cyst
Vis 4 egenskaper til
Abnormality of the respiratory system
- Breathing difficulty
- Cough
- Lung infiltrates
- Stiff lung or chest wall causing decreased lung volume
- Collapsed lung
- Emphysema
- Partial or complete collapse of part or entire lung
- Breathing difficulties
Vis 3 egenskaper til
Abnormality of the cardiovascular system
- Abnormality of the lymphatic system
- Cardiac rhabdomyoma
- Pulmonary lymphangiomyomatosis
- Slow heartbeats
- Swollen lymph nodes
- Chylopericardium
- High blood pressure
- Bulge in wall of large artery that carries blood away from heart
Vis 1 egenskap til
Eksterne lenker
Genposter
Transkripsjon
Protein
Hvor dette kommer fra
- HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og plassering.
- MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, dets eksoner og kodingssekvens.
- GenCC og ClinGen, utgitt 2026-10-16: hvilke tilstander genet er knyttet til, og hvor sterkt.
- ACMGs liste over sekundære funn, SF v3.2.
- ClinVar og GIAB-stratifiseringene: kjente sykdomsfremkallende posisjoner, og regionene som korte avlesninger har vanskelig for å dekke.
- The Human Phenotype Ontology, versjon 2026-09-01: egenskapene knyttet til genet. Les mer på hpo.jax.org.
- Datautgave 2026.10.16-c6eea6bf.
Siter denne siden
Dante Labs. (u.d.). TSC2-genet: TSC complex subunit 2. Hentet 17. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/no/genes/tsc2
Dante Labs. TSC2-genet: TSC complex subunit 2 [Internett]. [sitert 17. oktober 2026]. Tilgjengelig fra: https://dantelabs.com/no/genes/tsc2
Én test. En livstid med svar.
Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker