Gen
SEC61A1
SEC61 translocon subunit alpha 1
- HGNC 18276↗(åpnes i ny fane)
- Ensembl-gen ENSG00000058262↗(åpnes i ny fane)
- NCBI Gene 29927↗(åpnes i ny fane)
Sammendrag
- Cytogenetisk plassering
- 3q21.3
- Koordinater
- Kromosom 3: 128 052 437–128 071 683 (GRCh38)
- Eksoner
- 12 eksoner over 19,2 kb
- Protein
- 476 aminosyrer
- MANE Select-transkripsjon
- ENST00000243253.8NM_013336.4
- Lokustype
- Protein-coding
- Svært høy
- Sikker
- Lav
- Svært lav
Denne siden som data
Legg til .json etter adressen til siden, eller be om application/json, for å lese den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/sec61a1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLes SEC61A1 og resten av genomet ditt med én test.
Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker
Få mitt Genome TestKuraterte rapporter som er relevante for dette genet
Autosomal dominant tubulointerstitiell nyresykdom
- Familiær juvenil hyperurikemisk nefropatiAutosomal dominant
En autosomalt dominant tubulointerstitiell nyresykdom, oftest forårsaket av varianter i UMOD (og også REN eller SEC61A1), med høyt urinsyrenivå, tidlig gikt og gradvis tap av nyrefunksjon.
- 2 GenCC-innsendere vurderer den som definitiv eller sterk
▶Handlingsnytte
Kunnskap om dette støtter oppfølging av nyrefunksjonen, behandling av gikt og grundig vurdering av nærstående levende nyredonorer. REN-formen kan respondere på fludrokortison.
Common Variable Immunodeficiency (monogen CVID)
- Common variable immunodeficiency
Lav IgG med lav IgA og/eller IgM og dårlig respons på vaksiner. Former med ett enkelt gen omfatter NFKB1, NFKB2, ICOS, CD19, CD81, CR2, IKZF1, IRF2BP2, SEC61A1 og TNFRSF13B (TACI).
- 1 GenCC-innsender vurderer den som definitiv eller sterk
▶Handlingsnytte
Immunglobulinbehandling og tidlig behandling av infeksjoner er standard. En genetisk årsak kan veilede oppfølgingen for autoimmunitet, lymfom og lungesykdom, og enkelte former (for eksempel LRBA-mangel) responderer på målrettet behandling.
Bredere grupperinger
Andre medfødte immunsviktsykdommer
- Medfødt immunsviktsykdom
Ett av 114 gener knyttet til den
Arvelige sykdommer i immunsystemet forårsaket av endringer i enkeltgener, som påvirker hvordan kroppen bekjemper infeksjoner eller regulerer betennelse.
- 1 GenCC-innsender vurderer den som definitiv eller sterk
- Immunsviktsykdom
Ett av 170 gener knyttet til den
Sykdom der det finnes en mangel eller defekt i immunforsvarsmekanismene, enten cellulære eller humorale.
- 1 GenCC-innsender vurderer den som definitiv eller sterk
▶Handlingsnytte
HSCT ved SCID og alvorlige PID; immunglobulinerstatning (IVIG/SCIG) ved antistoffmangel; leniolisib (Joenja, FDA 2023) ved APDS; genterapi ved ADA-SCID; abatacept ved CTLA4- og LRBA-mangel; profylaktiske antibiotika; G-CSF ved CGD
Slik er SEC61A1 bygget opp
- Kodende sekvens
- Utranslatert region
- Intron
- Transkripsjonsretning
- Kjente sykdomsfremkallende posisjoner
- Områder som korte avlesninger sliter med
Eksoner i genets MANE Select-transkripsjon (utgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referansegenomet GRCh38.
Kromosombånd fra UCSCs GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Gener i nærheten fra Ensembl-utgave 116, på GRCh38.
Eksonene utgjør 3,6 kb av genets 19,2 kb, og 1 431 av disse basene koder for proteinet.
Sekvensering av SEC61A1
3
posisjoner i SEC61A1 der ClinVar klassifiserer en endring som patogen eller sannsynligvis patogen
Ingen av dem ligger i en region som korte leseavlesninger har vanskelig for å dekke.
En helgenomsekvensering dekker alle 19,2 kb av SEC61A1, inkludert introner, ikke bare de 3,6 kb med eksoner.
Gener knyttet til de samme tilstandene
- CD19CD19 moleculeDeler 3 tilstander
- CR2complement C3d receptor 2Deler 3 tilstander
- ICOSinducible T cell costimulatorDeler 3 tilstander
- IKZF1IKAROS family zinc finger 1Deler 3 tilstander
- IRF2BP2interferon regulatory factor 2 binding protein 2Deler 3 tilstander
- LRBALPS responsive beige-like anchor proteinDeler 3 tilstander
- NFKB1nuclear factor kappa B subunit 1Deler 3 tilstander
- NFKB2nuclear factor kappa B subunit 2Deler 3 tilstander
- TNFRSF13BTNF receptor superfamily member 13BDeler 3 tilstander
- AICDAactivation induced cytidine deaminaseDeler 2 tilstander
- ATP6AP1ATPase H+ transporting accessory protein 1Deler 2 tilstander
- BCL10BCL10 immune signaling adaptorDeler 2 tilstander
Egenskaper knyttet til SEC61A1
The Human Phenotype Ontology lister disse som kjennetegn ved de sjeldne tilstandene SEC61A1 kan forårsake. Hver egenskaps side viser de andre genene som er knyttet til den.
Abnormality of the immune system
- Decreased specific antibody response to unconjugated polysaccharide vaccine
- Infection in blood stream
- Pneumonia
- Recurrent chest infections
- Recurrent cutaneous abscess formation
- Decreased specific antibody response to protein-conjugated polysaccharide vaccine
- Partial absence of specific antibody response to tetanus vaccine
- Recurrent infections
Eksterne lenker
Genposter
Transkripsjon
Protein
Hvor dette kommer fra
- HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og plassering.
- MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, dets eksoner og kodingssekvens.
- GenCC og ClinGen, utgitt 2026-10-17: hvilke tilstander genet er knyttet til, og hvor sterkt.
- ACMGs liste over sekundære funn, SF v3.2.
- ClinVar og GIAB-stratifiseringene: kjente sykdomsfremkallende posisjoner, og regionene som korte avlesninger har vanskelig for å dekke.
- The Human Phenotype Ontology, versjon 2026-09-01: egenskapene knyttet til genet. Les mer på hpo.jax.org.
- Datautgave 2026.10.17-8666dff2.
Siter denne siden
Dante Labs. (u.d.). SEC61A1-genet: SEC61 translocon subunit alpha 1. Hentet 17. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/no/genes/sec61a1
Dante Labs. SEC61A1-genet: SEC61 translocon subunit alpha 1 [Internett]. [sitert 17. oktober 2026]. Tilgjengelig fra: https://dantelabs.com/no/genes/sec61a1
Én test. En livstid med svar.
Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker