Geen
SEC61A1
SEC61 translocon subunit alpha 1
- HGNC 18276↗(avaneb uuel vahelehel)
- Ensembli geen ENSG00000058262↗(avaneb uuel vahelehel)
- NCBI Gene 29927↗(avaneb uuel vahelehel)
Kokkuvõte
- Tsütogeneetiline asukoht
- 3q21.3
- Koordinaadid
- Kromosoom 3: 128 052 437–128 071 683 (GRCh38)
- Eksonid
- 12 eksonit, ulatus 19,2 kb
- Valk
- 476 aminohapet
- Pärilikkus
- Autosoomne dominantne
- MANE Select transkript
- ENST00000243253.8NM_013336.4
- Lookuse tüüp
- gene with protein product
- Väga kõrge
- Kindel
- Madal
- Väga madal
VõrdlusgenoomGRCh38hg38
Geeni- ja variandilehtede positsioonid järgivad seda valikut selles brauseris.
Loe SEC61A1 ja kogu oma genoom ühe testiga.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast
Telli oma Genome TestSelle geeniga seotud kureeritud aruanded
Autosomaalne dominantne tubulointerstitsiaalne neerohaigus
- Perekondlik juveniilne hüperurikeemiline nefropaatiaAutosoomne dominantne
Dominantselt pärandunud tubulointerstitsiaalne neerohaigus, mis on kõige sagedamini põhjustatud UMOD variantidest (samuti REN või SEC61A1), millega kaasnevad kõrge kusihappe sisaldus, varajane podagra ning neerufunktsiooni järkjärguline langus.
- 2 GenCC-i esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
Mida teadmine muudab
Teadmine toetab neerufunktsiooni jälgimist, podagra ravi ja sellega seotud elusdoonorite hoolikat hindamist; REN-vormi puhul võib ravi fludrokortisooniga olla efektiivne.
Tavapärane muutlik immuunpuudulikkus (monogeenne CVID)
- Tavapärane muutlik immuunpuudulikkus
Madal IgG koos madala IgA ja/või IgM-iga ning nõrk vastus vaktsineerimisele; üksikgeensed vormid hõlmavad geene NFKB1, NFKB2, ICOS, CD19, CD81, CR2, IKZF1, IRF2BP2, SEC61A1 ja TNFRSF13B (TACI).
- 1 GenCC-i esitaja hindab seda kindlaks või tugevaks
Mida teadmine muudab
Standardne ravi hõlmab immunoglobuliini asendusravi ja infektsioonide varajast ravi; geneetiline põhjus võib aidata suunata jälgimist autoimmuunsuse, lümfoomi ja kopahaiguste suhtes ning mõned vormid (näiteks LRBA-puudulikkus) reageerivad sihtravile.
Laiemad rühmad
Ostali pärilikud immuunpuudulikkused
- Pärilik immuunpuudulikkus
Üks 114 sellega seotud geenist
Pärilikud immuunsüsteemi häired, mis on põhjustatud üksikute geenide muutustest ning mõjutavad seda, kuidas organism infektsioonidega võitleb või põletikku reguleerib.
- 1 GenCC-i esitaja hindab seda kindlaks või tugevaks
- Immuunpuudulikkushaigus
Üks 170 sellega seotud geenist
Haigus, mille korral on rakulise või humoraalse immuunsuse mehhanismid puudulikud või defektsed.
- 1 GenCC-i esitaja hindab seda kindlaks või tugevaks
Mida teadmine muudab
HSCT raske kombineeritud immuunpuudulikkuse (SCID) ja muude raskete PID-ide korral; immunoglobuliini asendusravi (IVIG/SCIG) antikehade puudulikkuse korral; leniolisib (Joenja, FDA 2023) APDS-i korral; geenravi ADA-SCID-i korral; abatatsept CTLA4/LRBA puudulikkuse korral; profülaktilised antibiootikumid; G-CSF CGD korral
Pärandumine
- Autosoomne dominantne
- Üks muudetud koopia kumbast vanemast tahes on piisav. Vanem, kellel see on, annab selle edasi igale lapsele kahe võimalusest ühe tõenäosusega.
Kuidas SEC61A1 on üles ehitatud
- Kodeeriv järjestus
- Transleerimata piirkond
- Intron
- Transkriptsiooni suund
- Teadaolevad haigust põhjustavad kohad
- Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.
Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).
Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.
Eksonid moodustavad geenist 3,6 kb kogupikkusega 19,2 kb; neist 1431 alust kodeerivad valku.
Kuidas genoomitest loetakse SEC61A1
3
kohad geenis SEC61A1, kus ClinVar liigitab muutuse patogeenseks või tõenäoliselt patogeenseks
Neist ükski ei asu lõigul, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab.
Täisgenoomi analüüs hõlmab kogu geeni SEC61A1 19,2 kb, sealhulgas introne, mitte ainult eksoneid (3,6 kb).
Samade haigustega seotud geenid
- CD19CD19 moleculeJagab 3 haigust
- CR2complement C3d receptor 2Jagab 3 haigust
- ICOSinducible T cell costimulatorJagab 3 haigust
- IKZF1IKAROS family zinc finger 1Jagab 3 haigust
- IRF2BP2interferon regulatory factor 2 binding protein 2Jagab 3 haigust
- LRBALPS responsive beige-like anchor proteinJagab 3 haigust
- NFKB1nuclear factor kappa B subunit 1Jagab 3 haigust
- NFKB2nuclear factor kappa B subunit 2Jagab 3 haigust
- TNFRSF13BTNF receptor superfamily member 13BJagab 3 haigust
- AICDAactivation induced cytidine deaminaseJagab 2 haigust
- ATP6AP1ATPase H+ transporting accessory protein 1Jagab 2 haigust
- BCL10BCL10 immune signaling adaptorJagab 2 haigust
Geeniga SEC61A1 seotud tunnused
Human Phenotype Ontology loetleb need tunnustena harvaesinevatele haigustele, mida SEC61A1 võib põhjustada. Iga tunnuse lehel on loetletud teised selle tunnusega seotud geenid.
Abnormality of the immune system
- Decreased specific antibody response to unconjugated polysaccharide vaccine
- Infection in blood stream
- Pneumonia
- Recurrent chest infections
- Recurrent cutaneous abscess formation
- Decreased specific antibody response to protein-conjugated polysaccharide vaccine
- Partial absence of specific antibody response to tetanus vaccine
- Recurrent infections
Välised lingid
Geenikirjed
Transkript
Valk
Kust see pärineb
- HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
- MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI andmetel: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
- GenCC ja ClinGen, väljaanne 2026-10-16: milliste haigustega geen on seotud ja kui tugevalt.
- ACMG sekundaarsete leidude loend, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-i stratifikatsioonid: teadaolevad haigusi põhjustavad kohad ning piirkonnad, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.
- Human Phenotype Ontology, väljaanne 2026-09-01: geeniga seotud tunnused. Lisateavet leiate aadressilt hpo.jax.org.
- Andmeväljaanne 2026.10.16-c6eea6bf.
Viita sellele lehele
Dante Labs. (n.d.). SEC61A1 geen: SEC61 translocon subunit alpha 1. Vaadatud 17. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/sec61a1
Dante Labs. SEC61A1 geen: SEC61 translocon subunit alpha 1 [Internet]. [viidatud 17. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/sec61a1
Üks test. Vastused kogu eluks.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast