Gen
SEC61A1
SEC61 translocon subunit alpha 1
- HGNC 18276↗(öppnas i en ny flik)
- Ensembl-gen ENSG00000058262↗(öppnas i en ny flik)
- NCBI Gene 29927↗(öppnas i en ny flik)
Sammanfattning
- Cytogenetisk position
- 3q21.3
- Koordinater
- Kromosom 3: 128 052 437–128 071 683 (GRCh38)
- Exoner
- 12 exoner på 19,2 kb
- Protein
- 476 aminosyror
- MANE Select-transkript
- ENST00000243253.8NM_013336.4
- Lokustyp
- Protein-coding
- Mycket hög
- Säker
- Låg
- Mycket låg
Den här sidan som data
Lägg till .json i sidans adress, eller begär application/json, för att läsa den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/sec61a1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLäs SEC61A1, och resten av ditt genom, med ett test.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor
Beställ mitt Genome TestKuraterade rapporter som är relevanta för denna gen
Autosomal dominant tubulointerstitiell njursjukdom
- Familjär juvenil hyperurikemisk nefropatiAutosomalt dominant
En dominant nedärvd tubulointerstitiell njursjukdom, oftast orsakad av varianter i UMOD (och även REN eller SEC61A1), med hög urinsyra, tidig gikt och gradvis försämrad njurfunktion.
- 2 GenCC-bedömare bedömer den som definitiv eller stark
▶Åtgärdbarhet
Kunskap om detta stöder uppföljning av njurfunktionen, behandling av gikt och noggrann utredning av närstående levande njurdonatorer; REN-formen kan svara på fludrokortison.
Common Variable Immunodeficiency (monogen CVID)
- Common variable immunodeficiency
Låg IgG med låg IgA och/eller IgM och dålig vaccinrespons; monogena former omfattar NFKB1, NFKB2, ICOS, CD19, CD81, CR2, IKZF1, IRF2BP2, SEC61A1 och TNFRSF13B (TACI).
- 1 GenCC-bedömare bedömer den som definitiv eller stark
▶Åtgärdbarhet
Immunglobulinersättning och tidig behandling av infektioner är standard; en genetisk orsak kan vägleda uppföljningen för autoimmunitet, lymfom och lungsjukdom, och vissa former (till exempel LRBA-brist) svarar på riktad behandling.
Bredare grupperingar
Andra medfödda immunbristsjukdomar
- Medfödd immunbrist
En av 114 gener kopplade till den
Ärftliga sjukdomar i immunsystemet orsakade av förändringar i enskilda gener, som påverkar hur kroppen bekämpar infektioner eller reglerar inflammation.
- 1 GenCC-bedömare bedömer den som definitiv eller stark
- Immunbristsjukdom
En av 170 gener kopplade till den
Sjukdom där det finns en brist eller defekt i immunförsvarets mekanismer, antingen cellulära eller humorala.
- 1 GenCC-bedömare bedömer den som definitiv eller stark
▶Åtgärdbarhet
HSCT vid SCID och allvarliga PID; immunglobulinersättning (IVIG/SCIG) vid antikroppsbrist; leniolisib (Joenja, FDA 2023) vid APDS; genterapi vid ADA-SCID; abatacept vid CTLA4- och LRBA-brist; profylaktiska antibiotika; G-CSF vid CGD
Så är SEC61A1 uppbyggd
- Kodande sekvens
- Otranslaterad region
- Intron
- Transkriptionsriktning
- Kända sjukdomsorsakande ställen
- Sträckor som korta läsningar har svårt för
Exoner i genens MANE Select-transkript (version v1.5), från NCBI och EMBL-EBI, på referensgenomet GRCh38.
Kromosombanden från UCSC:s GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Närliggande gener från Ensembl-version 116, på GRCh38.
Exoner utgör 3,6 kb av genens 19,2 kb, och 1 431 av dessa baser kodar för proteinet.
Sekvensering av SEC61A1
3
positioner i SEC61A1 där ClinVar klassificerar en förändring som patogen eller sannolikt patogen
Ingen av dem ligger i en region som korta läsningar har svårt att täcka.
En helgenomsekvensering täcker alla 19,2 kb av SEC61A1, inklusive introner, och inte bara de 3,6 kb exoner.
Gener kopplade till samma tillstånd
- CD19CD19 moleculeDelar 3 tillstånd
- CR2complement C3d receptor 2Delar 3 tillstånd
- ICOSinducible T cell costimulatorDelar 3 tillstånd
- IKZF1IKAROS family zinc finger 1Delar 3 tillstånd
- IRF2BP2interferon regulatory factor 2 binding protein 2Delar 3 tillstånd
- LRBALPS responsive beige-like anchor proteinDelar 3 tillstånd
- NFKB1nuclear factor kappa B subunit 1Delar 3 tillstånd
- NFKB2nuclear factor kappa B subunit 2Delar 3 tillstånd
- TNFRSF13BTNF receptor superfamily member 13BDelar 3 tillstånd
- AICDAactivation induced cytidine deaminaseDelar 2 tillstånd
- ATP6AP1ATPase H+ transporting accessory protein 1Delar 2 tillstånd
- BCL10BCL10 immune signaling adaptorDelar 2 tillstånd
Egenskaper kopplade till SEC61A1
Human Phenotype Ontology listar dessa som kännetecken för de sällsynta tillstånd som SEC61A1 kan orsaka. Varje egenskaps sida visar de andra gener som är kopplade till den.
Abnormality of the genitourinary system
- Chronic kidney disease
- Decreased glomerular filtration rate
- Focal segmental glomerulosclerosis
- Hyperechogenic kidneys
- Impaired renal concentrating ability
- Kidney damage
- Renal dysplasia
- Small kidneys
Visa ytterligare 4 egenskaper
Abnormality of the immune system
- Decreased specific antibody response to unconjugated polysaccharide vaccine
- Infection in blood stream
- Pneumonia
- Recurrent chest infections
- Recurrent cutaneous abscess formation
- Decreased specific antibody response to protein-conjugated polysaccharide vaccine
- Partial absence of specific antibody response to tetanus vaccine
- Recurrent infections
Visa ytterligare 2 egenskaper
Externa länkar
Genposter
Transkript
Protein
Varifrån detta kommer
- HGNC: genens symbol, namn, andra symboler och position.
- MANE Select v1.5, från NCBI och EMBL-EBI: transkriptet, dess exoner och kodande sekvens.
- GenCC och ClinGen, släppt 2026-10-17: vilka tillstånd genen är kopplad till och hur starkt kopplingen är.
- ACMG:s lista över sekundära fynd, SF v3.2.
- ClinVar och GIAB-stratifieringarna: kända sjukdomsorsakande positioner och de regioner där korta läsningar har svårt.
- Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: egenskaperna som är kopplade till genen. Läs mer på hpo.jax.org.
- Dataversion 2026.10.17-8666dff2.
Citera den här sidan
Dante Labs. (u.å.). SEC61A1-genen: SEC61 translocon subunit alpha 1. Hämtad 17 oktober 2026, från https://dantelabs.com/sv/genes/sec61a1
Dante Labs. SEC61A1-genen: SEC61 translocon subunit alpha 1 [Internet]. [citerad 17 oktober 2026]. Tillgänglig på: https://dantelabs.com/sv/genes/sec61a1
Ett test. Ett helt liv av svar.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor