Gene
FOXG1
forkhead box G1
- HGNC 3811↗(si apre in una nuova scheda)
- Gene Ensembl ENSG00000176165↗(si apre in una nuova scheda)
- NCBI Gene 2290↗(si apre in una nuova scheda)
Sintesi
- Localizzazione citogenetica
- 14q12
- Coordinate
- Cromosoma 14: 28.766.787–28.770.277 (GRCh38)
- Esoni
- 1 esone su 3,5 kb
- Proteina
- 489 amminoacidi
- Noto anche come
- HFK2, QIN, BF1, HFK1, HFK3, HBF-3
- Simboli precedenti
- FKHL2, FOXG1B, FKHL4, FKH2, FKHL1, FOXG1C, FKHL3, FOXG1A
- Trascritto MANE Select
- ENST00000313071.7NM_005249.5
- Tipo di locus
- gene with protein product
- Molto alta
- Buona
- Bassa
- Molto bassa
Genoma di riferimentoGRCh38hg38
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Epilessia (Pannello completo)
- Sindrome di Rett atipica
Un disturbo del neurosviluppo diagnosticato quando un bambino presenta manifestazioni cliniche simili alla sindrome di Rett, ma non soddisfa tutti i criteri diagnostici della forma tipica (RTT classica/tipica).
- ClinGen valuta il legame come definitivo
- 5 segnalatori GenCC lo valutano come definitivo o forte
Struttura di FOXG1
- Sequenza codificante
- Regione non tradotta
- Introne
- Direzione della trascrizione
- Siti noti causativi di malattia
- Varianti con una pagina
Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.
Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).
Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.
Gli esoni costituiscono 3,5 kb dei 3,5 kb del gene; 1470 di queste basi codificano la proteina.
Come un test genomico legge FOXG1
172
posizioni in FOXG1 in cui ClinVar classifica una variante come patogena o probabilmente patogena
Nessuna di esse si trova in una regione che le letture brevi faticano a leggere.
Un genoma intero copre tutti i 3,5 kb di FOXG1, introni inclusi, non solo i 3,5 kb di esoni.
Varianti con una pagina (14)
Le varianti FOXG1 con una pagina qui, prima quelle con più stelle di revisione. Ogni pagina descrive il registro pubblico di ClinVar sulla variante, mai un risultato.
| Variante | HGVS c. | Esone o introne | Posizione (GRCh38) | Classificazione ClinVar | Stato di revisione |
|---|---|---|---|---|---|
| E154Gfs*301 | c.460dup | Esone 1 | 28.767.732 | Patogena | ★★★★3 stelle su 4 revisionata da un panel di esperti |
| G224S | c.670G>A | Esone 1 | 28.767.949 | Probabilmente patogena | ★★★★3 stelle su 4 revisionata da un panel di esperti |
| G250S | c.748G>A | Esone 1 | 28.768.027 | Probabilmente patogena | ★★★★3 stelle su 4 revisionata da un panel di esperti |
| G267S | c.799G>A | Esone 1 | 28.768.078 | Patogena | ★★★★3 stelle su 4 revisionata da un panel di esperti |
| I207T | c.620T>C | Esone 1 | 28.767.899 | Probabilmente patogena | ★★★★3 stelle su 4 revisionata da un panel di esperti |
| I229L | c.685A>C | Esone 1 | 28.767.964 | Probabilmente patogena | ★★★★3 stelle su 4 revisionata da un panel di esperti |
| L189V | c.565C>G | Esone 1 | 28.767.844 | Probabilmente patogena | ★★★★3 stelle su 4 revisionata da un panel di esperti |
| M191I | c.573G>A | Esone 1 | 28.767.852 | Probabilmente patogena | ★★★★3 stelle su 4 revisionata da un panel di esperti |
| N187K | c.561C>A | Esone 1 | 28.767.840 | Patogena | ★★★★3 stelle su 4 revisionata da un panel di esperti |
| N236D | c.706A>G | Esone 1 | 28.767.985 | Probabilmente patogena | ★★★★3 stelle su 4 revisionata da un panel di esperti |
Geni associati alle stesse condizioni
Tratti collegati a FOXG1
L'Human Phenotype Ontology elenca questi come caratteristiche delle rare condizioni che FOXG1 può causare. La pagina di ciascun tratto elenca gli altri geni ad esso collegati.
Abnormality of the nervous system
- Absent speech development
- Delayed ability to sit
- Delayed ability to walk
- Delayed speech and language development
- Global developmental delay
- Intellectual disability, severe
- Poor social interactions
- Seizure affecting one half of brain
Mostra altri 45 tratti
- Simplified gyral pattern
- Underdeveloped frontal lobe
- Encephalopathy
- Epilepsy
- Loss of developmental milestones
- Repetitive movements
- Underdevelopment of part of brain called corpus callosum
- Abnormality of coordination
- Agenesis of corpus callosum
- Decreased reflex response
- Difficulty sleeping
- EEG abnormality
- EEG with multifocal slow activity
- Inappropriate crying
- Intellectual disability
- Irritability
- Teeth grinding
- Abnormal corpus callosum morphology
- Abnormal gait
- Abnormal myelination
- Ataxia
- Attention deficit
- Autism
- Behavioral abnormality
- Brain degeneration
- Degeneration of cerebrum
- Delayed CNS myelination
- Diminished deep tendon reflex
- Disorder of involuntary muscle movements
- Fewer and broader ridges in brain
- Hypsarrhythmia
- Impulsivity
- Involuntary movements
- Jerking
- Mental deterioration
- Tremor
- Unsteady walk
- Repeated seizures without recovery between them
- Apraxia
- Chorea
- Dystonia
- Involuntary writhing movements in fingers, hands, toes, and feet
- Motor delay
- Poor eye contact
- Tongue thrusting
Abnormality of head or neck
- Progressively abnormally small cranium
- Abnormally small head
- Bulbous nose
- Depressed nasal bridge
- Drooping lower lip
- Eye folds
- Tented mouth
- Abnormally large tongue
Mostra altri 13 tratti
- Big lower jaw
- Downward slanting of the opening between the eyelids
- Excessive salivation
- Fullness of eyelids
- Narrow opening between the eyelids
- Prominent metopic ridge
- Short nose
- Smooth philtrum
- Failure of development of between one and six teeth
- High forehead
- Drooling
- Midface retrusion
- Thin red part of the upper lip
Link esterni
Schede genetiche
Trascritto
Proteina
Da dove provengono questi dati
- HGNC: il simbolo del gene, il nome, altri simboli e la posizione.
- MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.
- GenCC e ClinGen, rilasciati 2026-10-16: a quali condizioni è associato il gene e con quale forza.
- La lista ACMG dei reperti secondari, SF v3.2.
- ClinVar e le stratificazioni GIAB: siti noti associati a malattie e le regioni che le letture corte trovano difficili da analizzare.
- The Human Phenotype Ontology, versione 2026-09-01: i tratti collegati al gene. Scopri di più su hpo.jax.org.
- Rilascio dei dati 2026.10.16-c6eea6bf.
Cita questa pagina
Dante Labs. (s.d.). Gene FOXG1: forkhead box G1. Consultato il 16 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/foxg1
Dante Labs. Gene FOXG1: forkhead box G1 [Internet]. [citato il 16 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/foxg1
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