Gén
SPATA7
spermatogenesis associated 7
- HGNC 20423↗(új lapon nyílik meg)
- Ensembl gén ENSG00000042317↗(új lapon nyílik meg)
- NCBI Gene 55812↗(új lapon nyílik meg)
Összefoglalás
- Citogenetikai elhelyezkedés
- 14q31.3
- Koordináták
- 14. kromoszóma: 88 385 657–88 438 460 (GRCh38)
- Exonok
- 12 exon, összesen 52,8 kb
- Fehérje
- 599 aminosav
- Öröklődés
- Autoszomális recesszív
- Más néven ismert
- HSD3
- Korábbi jelölések
- LCA3
- MANE Select transzkriptum
- ENST00000393545.9NM_018418.5
- Lokusz típusa
- gene with protein product
- Nagyon magas
- Megbízható
- Alacsony
- Nagyon alacsony
Referencia genomGRCh38hg38
A gén- és variánsoldalakon a pozíciók ennek a választásnak megfelelően jelennek meg, ebben a böngészőben.
Olvassa el a SPATA7-t és genomja többi részét egyetlen teszttel.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt
Kérem a Genome TestemetEhhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések
Leber Congenital Amaurosis & RPE65-Related Retinopathy
- Leber Congenital AmaurosisAutoszomális recesszív
A group of inherited retinal dystrophies, caused by changes in genes such as CEP290, GUCY2D, CRB1, RPE65 and AIPL1, that cause severe vision loss, nystagmus and poor pupil responses in infancy.
- 4 GenCC-beküldő definitívnek vagy erősnek minősíti
Mit változtat az ismeret
Confirming the gene can determine eligibility for gene-specific treatments and clinical trials, and informs family counselling.
Átfogóbb csoportosítások
Retinitis Pigmentosa
A 77 hozzá kapcsolódó gén egyike
A group of inherited retinal dystrophies with progressive loss of rod and then cone photoreceptors, causing night blindness and gradual loss of peripheral vision.
- 4 GenCC-beküldő definitívnek vagy erősnek minősíti
Öröklődési mód
- Autoszomális recesszív
- Mindkét szülőtől egy-egy megváltozott másolat szükséges. Egy megváltozott másolattal hordozó lesz, és általában nem érintett; ha mindkét szülő hordozó, minden gyermeknek 25%-os eséllyel öröklődik mindkét másolat.
A SPATA7 felépítése
- Kódoló szekvencia
- Transzlálatlan régió
- Intron
- A transzkripció iránya
- Ismert betegségokozó helyek
- Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.
Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).
Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.
Az exonok a gén 52,8 kb-jából 2 kb-ot tesznek ki; ezek közül 1800 bázis kódolja a fehérjét.
Hogyan olvassa a genomteszt a(z) SPATA7 gént
56
pozíció a(z) SPATA7 génben, ahol a ClinVar a változást kórokozónak vagy valószínűleg kórokozónak minősíti
Ezek közül egyik sem esik olyan régióba, amelyet a rövid olvasatok nehezen értelmeznek.
A teljes genom a SPATA7 gén mind a 52,8 kb-ját lefedi, az intronokat is beleértve, nem csak az 2 kb exonját.
Ugyanazokhoz a betegségekhez kapcsolódó gének
- CRB1crumbs cell polarity complex component 12 betegséget oszt meg
- CRXcone-rod homeobox2 betegséget oszt meg
- IMPDH1inosine monophosphate dehydrogenase 12 betegséget oszt meg
- PRPH2peripherin 22 betegséget oszt meg
- RDH12retinol dehydrogenase 122 betegséget oszt meg
- ROM1retinal outer segment membrane protein 12 betegséget oszt meg
- RPE65retinoid isomerohydrolase RPE652 betegséget oszt meg
- TULP1TUB like protein 12 betegséget oszt meg
- ABCA4ATP binding cassette subfamily A member 41 betegséget oszt meg
- AGBL5AGBL carboxypeptidase 51 betegséget oszt meg
- AHRaryl hydrocarbon receptor1 betegséget oszt meg
- AIPL1AIP like 1 HSP90 co-chaperone1 betegséget oszt meg
A(z) SPATA7 génhez kapcsolódó tulajdonságok
Az Emberi Fenotípus Ontológia ezeket a ritka betegségek jellemzőiként sorolja fel, amelyeket a(z) SPATA7 gén okozhat. Az egyes tulajdonságok oldalán fel vannak tüntetve a hozzájuk kapcsolódó további gének.
Abnormality of the eye
- Involuntary, rapid, rhythmic eye movements
- Visual loss
- Abnormal electroretinogram
- Abnormal optic disc morphology
- Abnormal retinal pigmentation
- Blindness
- Extreme sensitivity of the eyes to light
- Marked vision impairment
Még 40 tulajdonság megjelenítése
- Optic atrophy
- Progressive night blindness
- Retina degeneration
- Spicular pigmentation of the retina
- Visual impairment
- Abnormal central response of multifocal electroretinogram
- Abnormal color vision
- Abnormal full-field electroretinogram
- Abnormal macular morphology
- Abnormal pupillary light reflex
- Bulging cornea
- Clouding of the lens of the eye
- Cystoid macular edema
- Decreased clarity of vision
- Difficulties with night vision
- Eye muscle paralysis
- Farsightedness
- Glaucoma
- Loss of peripheral vision
- Optic disc drusen
- Optic disc pallor
- Photoreceptor outer segment loss on macular OCT
- Posterior subcapsular cataract
- Retinal atrophy
- Retinal pigment epithelial mottling
- Slow pupillary light response
- Undetectable electroretinogram
- Abnormal corneal endothelium morphology
- Blurred vision
- Chorioretinal atrophy
- Close sighted
- Granular macular appearance
- Macular pseudocoloboma
- Outward facing eye ball
- Photopsia
- Posterior synechiae of the anterior chamber
- Retinal detachment
- Retinal pigment epithelial atrophy
- Rhegmatogenous retinal detachment
- Limited peripheral vision
Abnormality of the nervous system
- Abnormality of neuronal migration
- Aplasia/Hypoplasia of the cerebellar vermis
- Epilepsy
- Eye poking
- Paralysis or weakness of one side of body
- Autism spectrum disorder
- Balance impairment
- Delayed social development
Még 5 tulajdonság megjelenítése
Külső hivatkozások
Génadatok
Átirat
Fehérje
Honnan származnak az adatok
- HGNC: a gén szimbóluma, neve, egyéb szimbólumai és elhelyezkedése.
- MANE Select v1.5, az NCBI-tól és az EMBL-EBI-tól: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
- GenCC és ClinGen, 2026-10-16 kiadás: mely betegségekkel kapcsolódik a gén, és milyen erősen.
- Az ACMG másodlagos leletek listája, SF v3.2.
- ClinVar és a GIAB-rétegződések: ismert, betegséget okozó helyek, valamint azok a régiók, amelyeket a rövid leolvasások nehezen térképeznek fel.
- Az Emberi Fenotípus Ontológia, 2026-09-01. kiadás: a génhez kapcsolódó tulajdonságok. További információ: hpo.jax.org.
- Adatkiadás: 2026.10.16-c6eea6bf.
Az oldal idézése
Dante Labs. (n.d.). SPATA7 gén: spermatogenesis associated 7. Lekérve: 2026. október 17., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/spata7
Dante Labs. SPATA7 gén: spermatogenesis associated 7 [Internet]. [idézve: 2026. október 17.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/spata7
Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt