Gen
SPATA7
spermatogenesis associated 7
- HGNC 20423↗(öppnas i en ny flik)
- Ensembl-gen ENSG00000042317↗(öppnas i en ny flik)
- NCBI Gene 55812↗(öppnas i en ny flik)
Sammanfattning
- Cytogenetisk position
- 14q31.3
- Koordinater
- Kromosom 14: 88 385 657–88 438 460 (GRCh38)
- Exoner
- 12 exoner på 52,8 kb
- Protein
- 599 aminosyror
- Arvsgång
- Autosomalt recessiv
- Även känd som
- HSD3
- Tidigare symboler
- LCA3
- MANE Select-transkript
- ENST00000393545.9NM_018418.5
- Lokustyp
- gene with protein product
- Mycket hög
- Säker
- Låg
- Mycket låg
ReferensgenomGRCh38hg38
Positioner på gen- och variantsidorna följer det här valet, i den här webbläsaren.
Läs SPATA7, och resten av ditt genom, med ett test.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor
Beställ mitt Genome TestKuraterade rapporter som är relevanta för denna gen
Leber kongenital amauros och RPE65-relaterad retinopati
- Leber kongenital amaurosAutosomalt recessiv
En grupp ärftliga retinala dystrofier, orsakade av förändringar i gener såsom CEP290, GUCY2D, CRB1, RPE65 och AIPL1, som orsakar allvarlig synnedsättning, nystagmus och svaga pupillreaktioner under spädbarnsåldern.
- 4 GenCC-bedömare klassar den som definitiv eller stark
Vad kunskapen förändrar
Att bekräfta genen kan avgöra behörighet till genspecifika behandlingar och kliniska studier, och ger underlag för familjerådgivning.
Bredare grupperingar
Retinitis pigmentosa
En av 77 gener kopplade till den
En grupp ärftliga retinala dystrofier med progressiv förlust av först stavar och sedan tappar (fotoreceptorer), vilket orsakar nattblindhet och gradvis förlust av perifer syn.
- 4 GenCC-bedömare klassar den som definitiv eller stark
Nedärvning
- Autosomalt recessiv
- Det krävs en förändrad kopia från vardera föräldern. Med en är du bärare och oftast opåverkad. När båda föräldrarna är bärare har varje barn en chans på en av fyra att ärva två.
Så är SPATA7 uppbyggd
- Kodande sekvens
- Otranslaterad region
- Intron
- Transkriptionsriktning
- Kända sjukdomsorsakande ställen
- Sträckor som korta läsningar har svårt för
Exoner i genens MANE Select-transkript (version v1.5), från NCBI och EMBL-EBI, på referensgenomet GRCh38.
Kromosombanden från UCSC:s GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Närliggande gener från Ensembl-version 116, på GRCh38.
Exoner utgör 2 kb av genens 52,8 kb, och 1 800 av dessa baser kodar för proteinet.
Så läser ett genomtest SPATA7
56
positioner i SPATA7 där ClinVar klassar en förändring som patogen eller sannolikt patogen
Inget av dem ligger i ett område som korta läsningar har svårt för.
En helgenomsanalys täcker alla 52,8 kb av SPATA7, med introner inräknade, inte bara de 2 kb exoner.
Gener kopplade till samma tillstånd
- CRB1crumbs cell polarity complex component 1Delar 2 tillstånd
- CRXcone-rod homeoboxDelar 2 tillstånd
- IMPDH1inosine monophosphate dehydrogenase 1Delar 2 tillstånd
- PRPH2peripherin 2Delar 2 tillstånd
- RDH12retinol dehydrogenase 12Delar 2 tillstånd
- ROM1retinal outer segment membrane protein 1Delar 2 tillstånd
- RPE65retinoid isomerohydrolase RPE65Delar 2 tillstånd
- TULP1TUB like protein 1Delar 2 tillstånd
- ABCA4ATP binding cassette subfamily A member 4Delar 1 tillstånd
- AGBL5AGBL carboxypeptidase 5Delar 1 tillstånd
- AHRaryl hydrocarbon receptorDelar 1 tillstånd
- AIPL1AIP like 1 HSP90 co-chaperoneDelar 1 tillstånd
Egenskaper kopplade till SPATA7
Human Phenotype Ontology listar dessa som kännetecken för de sällsynta tillstånd som SPATA7 kan orsaka. Varje egenskaps sida visar de andra gener som är kopplade till den.
Abnormality of the eye
- Involuntary, rapid, rhythmic eye movements
- Visual loss
- Abnormal electroretinogram
- Abnormal optic disc morphology
- Abnormal retinal pigmentation
- Blindness
- Extreme sensitivity of the eyes to light
- Marked vision impairment
Visa ytterligare 40 egenskaper
- Optic atrophy
- Progressive night blindness
- Retina degeneration
- Spicular pigmentation of the retina
- Visual impairment
- Abnormal central response of multifocal electroretinogram
- Abnormal color vision
- Abnormal full-field electroretinogram
- Abnormal macular morphology
- Abnormal pupillary light reflex
- Bulging cornea
- Clouding of the lens of the eye
- Cystoid macular edema
- Decreased clarity of vision
- Difficulties with night vision
- Eye muscle paralysis
- Farsightedness
- Glaucoma
- Loss of peripheral vision
- Optic disc drusen
- Optic disc pallor
- Photoreceptor outer segment loss on macular OCT
- Posterior subcapsular cataract
- Retinal atrophy
- Retinal pigment epithelial mottling
- Slow pupillary light response
- Undetectable electroretinogram
- Abnormal corneal endothelium morphology
- Blurred vision
- Chorioretinal atrophy
- Close sighted
- Granular macular appearance
- Macular pseudocoloboma
- Outward facing eye ball
- Photopsia
- Posterior synechiae of the anterior chamber
- Retinal detachment
- Retinal pigment epithelial atrophy
- Rhegmatogenous retinal detachment
- Limited peripheral vision
Abnormality of the nervous system
- Abnormality of neuronal migration
- Aplasia/Hypoplasia of the cerebellar vermis
- Epilepsy
- Eye poking
- Paralysis or weakness of one side of body
- Autism spectrum disorder
- Balance impairment
- Delayed social development
Visa ytterligare 5 egenskaper
Externa länkar
Genposter
Transkript
Protein
Varifrån detta kommer
- HGNC: genens symbol, namn, andra symboler och position.
- MANE Select v1.5, från NCBI och EMBL-EBI: transkriptet, dess exoner och kodande sekvens.
- GenCC och ClinGen, släppt 2026-10-16: vilka tillstånd genen är kopplad till och hur starkt kopplingen är.
- ACMG:s lista över sekundära fynd, SF v3.2.
- ClinVar och GIAB-stratifieringarna: kända sjukdomsorsakande positioner och de regioner där korta läsningar har svårt.
- Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: egenskaperna som är kopplade till genen. Läs mer på hpo.jax.org.
- Dataversion 2026.10.16-c6eea6bf.
Citera den här sidan
Dante Labs. (u.å.). SPATA7-genen: spermatogenesis associated 7. Hämtad 17 oktober 2026, från https://dantelabs.com/sv/genes/spata7
Dante Labs. SPATA7-genen: spermatogenesis associated 7 [Internet]. [citerad 17 oktober 2026]. Tillgänglig på: https://dantelabs.com/sv/genes/spata7
Ett test. Ett helt liv av svar.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor