Gén
DHX37
DEAH-box helicase 37
- HGNC 17210↗(új lapon nyílik meg)
- Ensembl gén ENSG00000150990↗(új lapon nyílik meg)
- NCBI Gene 57647↗(új lapon nyílik meg)
Összefoglalás
- Citogenetikai elhelyezkedés
- 12q24.31
- Koordináták
- 12. kromoszóma: 124 946 826–124 989 131 (GRCh38)
- Exonok
- 27 exon, összesen 42,3 kb
- Fehérje
- 1157 aminosav
- Más néven ismert
- KIAA1517, MGC4322, MGC2695, Dhr1
- Korábbi jelölések
- DDX37
- MANE Select transzkriptum
- ENST00000308736.7NM_032656.4
- Lokusz típusa
- Fehérjét kódoló
- Nagyon magas
- Megbízható
- Alacsony
- Nagyon alacsony
Ez az oldal adatként
Adja hozzá a .json végződést az oldal címéhez, vagy kérjen application/json típust, hogy JSON-ként olvassa be.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/dhx37.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameOlvassa el a DHX37-t és genomja többi részét egyetlen teszttel.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt
Kérem a Genome TestemetEhhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések
46,XY Differences of Sex Development and Gonadal Dysgenesis
- 46,XY complete gonadal dysgenesis (Swyer syndrome)
A condition in which people with XY chromosomes have undeveloped streak gonads and a female appearance, caused by variants in SRY, NR5A1, MAP3K1, DHH and other genes.
- 2 GenCC-beküldő szerint bizonyított vagy erős
▶Beavatkozhatóság
Streak gonads carry a high risk of gonadoblastoma, so removal is usually recommended, and hormone replacement is needed for puberty.
Átfogóbb csoportosítások
Hypertrophic Cardiomyopathy
- Autoszomális domináns
A 62 hozzá kapcsolódó gén egyike
A condition in which the myocardium is hypertrophied without an obvious cause. The hypertrophy is generally asymmetric and may be associated with obstruction of the ventricular outflow tract.
- 2 GenCC-beküldő szerint bizonyított vagy erős
▶Beavatkozhatóság
Beta-blockers, non-dihydropyridine calcium channel blockers, activity restriction, genetic counseling
A DHX37 felépítése
- Kódoló szekvencia
- Transzlálatlan régió
- Intron
- A transzkripció iránya
- Ismert betegségokozó helyek
- Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.
Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).
Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.
Az exonok a gén 42,3 kb-jából 4,6 kb-ot tesznek ki; ezek közül 3474 bázis kódolja a fehérjét.
DHX37 szekvenálása
8Könnyű
Mennyire nehéz a DHX37 szekvenálása rövid olvasatokkal, 100-ból
0 · Könnyű100 · Nehéz
A DHX37 exonjainak szinte mindegyike olyan helyen van, ahol a rövid olvasatok tisztán leképezhetők.
Ami tovább nehezíti: a DHX37 exonjainak aránya az egyes típusú nehéz régiókban
- LeképezhetőségOlyan szakaszok, ahol a 100 vagy 250 bp-os olvasatok nem helyezhetők el egyértelműen, így a hívás ott hiányozhat vagy hibás lehet. Súly: 100%.0%
- HomológiaSzegmentális duplikációk: a genom más helyein lévő másolatok, például paralógok és pszeudogének, legalább 90%-os azonossággal. Súly: 60%.0%
- Shared with chrYThe pseudoautosomal regions and the X-transposed region, where chrX and chrY carry the same or nearly the same sequence, so reads from either may land on the other. Súly: 60%.0%
- Referencia-lefedettségA közeli referencia-összeszerelés hiányai, ahol nincs olyan szekvencia, amelyhez az olvasatok igazodhatnának. Súly: 50%.0%
- IsmétlődésekTandem ismétlődések és egyetlen bázisból álló ismétlések, amelyeken az olvasatok megcsúsznak, és amelyeket esetleg nem fognak át. Súly: 30%.5,7%
- GC-tartalomOlyan szakaszok, ahol a G és C bázisok aránya 25% alatti vagy 65% feletti, és amelyeket a könyvtárkészítés gyengén fed le. Súly: 20%.34%
A Dante Labs saját kutatásán alapuló pontszám, amely a NIST Genome in a Bottle térképein nyugszik, a nehezen szekvenálható régiókat mutatja be.Így számítjuk kiMinden oszlop a DHX37 exonbázisainak azon arányát mutatja, amely az adott típusú nehéz régióban van. Bármelyik típus önmagában is nehézzé teheti a gént, a további típusok azonban egyre kevesebbet adnak hozzá: 0, ha egy bázis sem esik egyik típusba sem, 100, ha minden bázis olyan helyen van, ahol az olvasatok nem helyezhetők el egyértelműen.
5
a DHX37 génben azok a pozíciók, ahol a ClinVar kórokozónak vagy valószínűleg kórokozónak minősít egy változást
Ezek közül egy sem esik olyan régióba, amelyet a rövid olvasatok nehezen kezelnek.
A teljes genomszekvenálás a DHX37 mind a 42,3 kb-os hosszát lefedi, beleértve az intronokat is, nem csak az exonok 4,6 kb-át.
ClinVar pathogenic variants (5)
The DHX37 variants ClinVar classifies pathogenic or likely pathogenic for any condition, reviewed by at least one submitter with criteria, and the most reviewed of them. It is ClinVar's public record of the gene, never a result.
- Patogén 1
- Valószínűleg patogén 4
| Variáns | Conditions | ClinVar-besorolás | Felülvizsgálati állapot |
|---|---|---|---|
| NM_032656.4(DHX37):c.923G>A (p.Arg308Gln) (opens in a new tab) | 46,XY sex reversal 11 | Patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_032656.4(DHX37):c.3217-1G>T (opens in a new tab) | neurodevelopmental disorder with brain anomalies and with or without vertebral or cardiac anomalies | Valószínűleg patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_032656.4(DHX37):c.2374C>T (p.Arg792Ter) (opens in a new tab) | neurodevelopmental disorder with brain anomalies and with or without vertebral or cardiac anomalies | Valószínűleg patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_032656.4(DHX37):c.2020C>T (p.Arg674Trp) (opens in a new tab) | 46,XY sex reversal 11 | Valószínűleg patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_032656.4(DHX37):c.1877C>T (p.Ser626Leu) (opens in a new tab) | 46,XY sex reversal 11 | Valószínűleg patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
Ugyanazokhoz a betegségekhez kapcsolódó gének
- DHHdesert hedgehog signaling molecule2 betegséget oszt meg
- MAP3K1mitogen-activated protein kinase kinase kinase 12 betegséget oszt meg
- NR5A1nuclear receptor subfamily 5 group A member 12 betegséget oszt meg
- SRYsex determining region Y2 betegséget oszt meg
- ZFPM2zinc finger protein, FOG family member 22 betegséget oszt meg
- ACADVLacyl-CoA dehydrogenase very long chain1 betegséget oszt meg
- ACTC1actin alpha cardiac muscle 11 betegséget oszt meg
- ALPK3alpha kinase 31 betegséget oszt meg
- BRAFB-Raf proto-oncogene, serine/threonine kinase1 betegséget oszt meg
- CDKN1Ccyclin dependent kinase inhibitor 1C1 betegséget oszt meg
- CSRP3cysteine and glycine rich protein 31 betegséget oszt meg
- DMPKDM1 protein kinase1 betegséget oszt meg
A(z) DHX37 génhez kapcsolódó tulajdonságok
Az Emberi Fenotípus Ontológia ezeket a ritka betegségek jellemzőiként sorolja fel, amelyeket a(z) DHX37 gén okozhat. Az egyes tulajdonságok oldalán fel vannak tüntetve a hozzájuk kapcsolódó további gének.
Abnormality of the genitourinary system
- Abnormal internal genitalia
- Abnormal labia morphology
- Abnormal male internal genitalia morphology
- Abnormal morphology of female internal genitalia
- Abnormal scrotum morphology
- Abnormal sex determination
- Abnormal vagina morphology
- Absent sperm in semen
Még 30 tulajdonság megjelenítése
- Absent testes
- Absent/small testes
- Agonadism
- Ambiguous external genitalia
- Decreased fertility
- Decreased fertility in females
- Decreased testicular size
- Dysplastic testis
- Enlarged clitoris
- Female external genitalia in individual with 46,XY karyotype
- Gonadal dysgenesis
- Hypospadias
- Male infertility
- Male pseudohermaphroditism
- Polycystic ovaries
- Primary amenorrhea
- Short penis
- Streak ovary
- Underdeveloped penis
- Underdeveloped vagina
- Urogenital sinus anomaly
- Vanishing testis
- Gonadal dysgenesis with female appearance, male
- Gonadoblastoma
- Undescended testes
- Ovarian gonadoblastoma
- Testicular gonadoblastoma
- Nephroblastoma
- Nephrotic syndrome
- Absent uterus
Abnormality of head or neck
- Asymmetry of the posterior head
- Abnormality of the face
- Abnormally small head
- Broad neck
- Decreased number of teeth
- Downturned corners of mouth
- Facial asymmetry
- Increased size of tooth
Még 4 tulajdonság megjelenítése
Külső hivatkozások
Génadatok
Átirat
Fehérje
Az adatok forrásai
- HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
- MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
- GenCC és ClinGen, 2026-10-19 kiadás: mely állapotokhoz kapcsolódik a gén, és milyen erős a kapcsolat.
- Az ACMG másodlagos leletek listája, SF v3.2.
- ClinVar és a GIAB-stratifikációk: ismert betegséget okozó helyek és azok a régiók, amelyeket a rövid olvasatok nehezen kezelnek.
- A Genome in a Bottle genomstratifikációi a NIST-től: a szekvenálási nehézségi pontszám.
- Az Emberi Fenotípus Ontológia, 2026-09-01. kiadás: a génhez kapcsolódó tulajdonságok. További információ: hpo.jax.org.
- Adatkiadás: 2026.10.19-9814e911.
Az oldal idézése
Dante Labs. (n.d.). DHX37 gén: DEAH-box helicase 37. Lekérve: 2026. október 19., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/dhx37
Dante Labs. DHX37 gén: DEAH-box helicase 37 [Internet]. [idézve: 2026. október 19.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/dhx37
Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt