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Gène

AFF4

ALF transcription elongation factor 4

Résumé

Localisation cytogénétique
5q31.1
Coordonnées
Chromosome 5 : 132 875 395–132 963 634 (GRCh38)
Exons
21 exons sur 88,2 kb
Protéine
1 163 acides aminés
Aussi appelé
AF5Q31, MCEF
Transcrit MANE Select
ENST00000265343.10NM_014423.4
Type de locus
gene with protein product
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Génome de référenceGRCh38

Les positions sur les pages de gènes et de variants suivent ce choix, dans ce navigateur.

Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore AFF4. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de AFF4

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Sites connus associés à une maladie
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 5, avec un crochet à l'emplacement de AFF4. AFF4 et 17 gènes à proximité sur le chromosome 5, de 132 419 515 à 133 419 514.Chromosome 55q31.1p15.33p15.32p15.31p15.2p15.1p14.3p14.2p14.1p13.3p13.2p13.1p12p11q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q14.1q14.2q14.3q15q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q31.1q31.2q31.3q32q33.1q33.2q33.3q34q35.1q35.2q35.3132,6 Mb132,8 Mb133 Mb133,2 Mb133,4 Mb : 132 410 832–132 646 079, brin directIRF1 : 132 440 440–132 508 719, brin inverseIRF1IL5 : 132 541 444–132 556 838, brin inverseIL5RAD50 : 132 556 019–132 646 349, brin directRAD50IL13 : 132 656 263–132 661 110, brin directIL13IL4 : 132 673 986–132 682 678, brin directIL4KIF3A : 132 688 806–132 737 638, brin inverseKIF3ACCNI2 : 132 747 319–132 765 178, brin directCCNI2SEPTIN8 : 132 750 138–132 807 241, brin inverseSEPTIN8SOWAHA : 132 813 302–132 816 786, brin directSOWAHASHROOM1 : 132 821 271–132 830 924, brin inverseSHROOM1GDF9 : 132 861 181–132 866 884, brin inverseGDF9UQCRQ : 132 866 623–132 868 847, brin directUQCRQLEAP2 : 132 873 444–132 899 343, brin directLEAP2AFF4 : 132 875 395–132 963 634, brin inverseAFF4ZCCHC10 : 132 996 985–133 026 604, brin inverseZCCHC10HSPA4 : 133 051 942–133 106 449, brin directHSPA4FSTL4 : 133 193 430–133 612 688, brin inverseFSTL4Schéma de AFF4 : 21 exons sur le brin inverse du chromosome 5Exon 3 : 5 sites connus associés à une maladieExon 2 : 1 site connu associé à une maladieExon 21 : 132 875 395–132 881 186, 5 792 basesExon 20 : 132 883 340–132 883 560, 221 basesExon 19 : 132 885 076–132 885 119, 44 basesExon 18 : 132 886 310–132 886 403, 94 basesExon 17 : 132 887 521–132 887 592, 72 basesExon 16 : 132 887 846–132 887 982, 137 basesExon 15 : 132 888 097–132 888 160, 64 basesExon 14 : 132 889 079–132 889 173, 95 basesExon 13 : 132 892 164–132 892 404, 241 basesExon 12 : 132 893 030–132 893 118, 89 basesExon 11 : 132 896 323–132 897 240, 918 basesExon 10 : 132 898 230–132 898 392, 163 basesExon 9 : 132 899 104–132 899 141, 38 basesExon 8 : 132 899 587–132 899 641, 55 basesExon 7 : 132 902 442–132 902 487, 46 basesExon 6 : 132 904 368–132 904 404, 37 basesExon 5 : 132 927 121–132 927 207, 87 basesExon 4 : 132 932 178–132 932 222, 45 basesExon 3 : 132 934 147–132 934 941, 795 basesExon 2 : 132 937 067–132 937 193, 127 basesExon 1 : 132 963 259–132 963 634, 376 bases21201510515′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 9,5 kb sur les 88,2 kb du gène ; 3 492 de ces bases codent pour la protéine.

Comment un test génomique lit AFF4

6

positions dans AFF4 où ClinVar classe une modification comme pathogène ou probablement pathogène

Aucune d'entre elles ne se situe dans une région que les lectures courtes peinent à analyser.

Un génome entier couvre les 88,2 kb de AFF4, introns compris, et pas seulement les 9,5 kb d'exons.

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
  • ClinVar et les stratifications GIAB : les sites connus responsables de maladies, et les régions que les lectures courtes peinent à analyser.
  • L'Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01 : les traits associés au gène. Pour en savoir plus, rendez-vous sur hpo.jax.org.
  • Version des données 2026.10.16-c6eea6bf.

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Dante Labs. (s.d.). Gène AFF4 : ALF transcription elongation factor 4. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/aff4

Vancouver

Dante Labs. Gène AFF4 : ALF transcription elongation factor 4 [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/aff4

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