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Gène

SHROOM1

shroom family member 1

Résumé

Localisation cytogénétique
5q31.1
Coordonnées
Chromosome 5 : 132 822 141–132 830 647 (GRCh38)
Exons
10 exons sur 8,5 kb
Protéine
852 acides aminés
Aussi appelé
APXL2, KIAA1960
Transcrit MANE Select
ENST00000378679.8NM_001172700.2
Type de locus
gene with protein product
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore SHROOM1. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de SHROOM1

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 5, avec un crochet à l'emplacement de SHROOM1. SHROOM1 et 19 gènes à proximité sur le chromosome 5, de 132 326 394 à 133 326 393.Chromosome 55q31.1p15.33p15.32p15.31p15.2p15.1p14.3p14.2p14.1p13.3p13.2p13.1p12p11q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q14.1q14.2q14.3q15q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q31.1q31.2q31.3q32q33.1q33.2q33.3q34q35.1q35.2q35.3132,4 Mb132,6 Mb132,8 Mb133 Mb133,2 MbSLC22A4 : 132 293 737–132 344 206, brin directSLC22A4SLC22A5 : 132 369 493–132 395 615, brin directSLC22A5 : 132 410 832–132 646 079, brin directIRF1 : 132 440 440–132 508 719, brin inverseIRF1IL5 : 132 541 444–132 556 838, brin inverseIL5RAD50 : 132 556 019–132 646 349, brin directRAD50IL13 : 132 656 263–132 661 110, brin directIL13IL4 : 132 673 986–132 682 678, brin directIL4KIF3A : 132 688 806–132 737 638, brin inverseKIF3ACCNI2 : 132 747 319–132 765 178, brin directCCNI2SEPTIN8 : 132 750 138–132 807 241, brin inverseSEPTIN8SOWAHA : 132 813 302–132 816 786, brin directSOWAHASHROOM1 : 132 822 141–132 830 647, brin inverseSHROOM1GDF9 : 132 861 181–132 866 884, brin inverseGDF9UQCRQ : 132 866 623–132 868 847, brin directUQCRQLEAP2 : 132 873 444–132 899 343, brin directLEAP2AFF4 : 132 875 395–132 963 931, brin inverseAFF4ZCCHC10 : 132 996 985–133 026 604, brin inverseZCCHC10HSPA4 : 133 051 942–133 106 449, brin directHSPA4FSTL4 : 133 193 430–133 612 688, brin inverseFSTL4Schéma de SHROOM1 : 10 exons sur le brin inverse du chromosome 5Exon 10 : 132 822 141–132 823 128, 988 basesExon 9 : 132 823 250–132 823 522, 273 basesExon 8 : 132 823 623–132 823 764, 142 basesExon 7 : 132 823 850–132 824 419, 570 basesExon 6 : 132 824 615–132 824 821, 207 basesExon 5 : 132 825 018–132 825 073, 56 basesExon 4 : 132 825 163–132 826 182, 1 020 basesExon 3 : 132 826 277–132 826 587, 311 basesExon 2 : 132 827 461–132 827 607, 147 basesExon 1 : 132 830 594–132 830 647, 54 bases109876543215′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 3,8 kb sur les 8,5 kb du gène ; 2 559 de ces bases codent pour la protéine.

Liens externes

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.

Citer cette page

APA

Dante Labs. (s.d.). Gène SHROOM1 : shroom family member 1. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/shroom1

Vancouver

Dante Labs. Gène SHROOM1 : shroom family member 1 [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/shroom1

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