Liigu sisu juurde
Kasuta oma HSA- või FSA-vahendeid

Geen

AFF4

ALF transcription elongation factor 4

Kokkuvõte

Tsütogeneetiline asukoht
5q31.1
Koordinaadid
Kromosoom 5: 132 875 395–132 963 634 (GRCh38)
Eksonid
21 eksonit, ulatus 88,2 kb
Valk
1163 aminohapet
Tuntud ka kui
AF5Q31, MCEF
MANE Select transkript
ENST00000265343.10NM_014423.4
Lookuse tüüp
gene with protein product
  • Väga kõrge
  • Kindel
  • Madal
  • Väga madal

VõrdlusgenoomGRCh38

Geeni- ja variandilehtede positsioonid järgivad seda valikut selles brauseris.

Selle geeniga seotud kureeritud aruanded

Ükski Genome Testi aruanne ei loe geeni AFF4 veel. Test sekveneerib sinu kogu genoomi, seega hõlmavad sinu andmed seda sellegipoolest.

Kuidas AFF4 on üles ehitatud

  • Kodeeriv järjestus
  • Transleerimata piirkond
  • Intron
  • Transkriptsiooni suund
  • Teadaolevad haigust põhjustavad kohad
  • Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
Kromosoom 5, millel on sulg kohal, kus asub AFF4. AFF4 ja sellele lähedal asuvad 17 geeni kromosoomil 5, vahemikus 132 419 515 kuni 133 419 514.Kromosoom 55q31.1p15.33p15.32p15.31p15.2p15.1p14.3p14.2p14.1p13.3p13.2p13.1p12p11q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q14.1q14.2q14.3q15q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q31.1q31.2q31.3q32q33.1q33.2q33.3q34q35.1q35.2q35.3132,6 Mb132,8 Mb133 Mb133,2 Mb133,4 Mb: 132 410 832–132 646 079, otsene ahelIRF1: 132 440 440–132 508 719, pöördne ahelIRF1IL5: 132 541 444–132 556 838, pöördne ahelIL5RAD50: 132 556 019–132 646 349, otsene ahelRAD50IL13: 132 656 263–132 661 110, otsene ahelIL13IL4: 132 673 986–132 682 678, otsene ahelIL4KIF3A: 132 688 806–132 737 638, pöördne ahelKIF3ACCNI2: 132 747 319–132 765 178, otsene ahelCCNI2SEPTIN8: 132 750 138–132 807 241, pöördne ahelSEPTIN8SOWAHA: 132 813 302–132 816 786, otsene ahelSOWAHASHROOM1: 132 821 271–132 830 924, pöördne ahelSHROOM1GDF9: 132 861 181–132 866 884, pöördne ahelGDF9UQCRQ: 132 866 623–132 868 847, otsene ahelUQCRQLEAP2: 132 873 444–132 899 343, otsene ahelLEAP2AFF4: 132 875 395–132 963 634, pöördne ahelAFF4ZCCHC10: 132 996 985–133 026 604, pöördne ahelZCCHC10HSPA4: 133 051 942–133 106 449, otsene ahelHSPA4FSTL4: 133 193 430–133 612 688, pöördne ahelFSTL4AFF4 skeem: 21 eksonit kromosoomi 5 pöördne ahelalEkson 3: 5 teadaolevat haigust põhjustavat kohtaEkson 2: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 21: 132 875 395–132 881 186, 5792 alustEkson 20: 132 883 340–132 883 560, 221 alustEkson 19: 132 885 076–132 885 119, 44 alustEkson 18: 132 886 310–132 886 403, 94 alustEkson 17: 132 887 521–132 887 592, 72 alustEkson 16: 132 887 846–132 887 982, 137 alustEkson 15: 132 888 097–132 888 160, 64 alustEkson 14: 132 889 079–132 889 173, 95 alustEkson 13: 132 892 164–132 892 404, 241 alustEkson 12: 132 893 030–132 893 118, 89 alustEkson 11: 132 896 323–132 897 240, 918 alustEkson 10: 132 898 230–132 898 392, 163 alustEkson 9: 132 899 104–132 899 141, 38 alustEkson 8: 132 899 587–132 899 641, 55 alustEkson 7: 132 902 442–132 902 487, 46 alustEkson 6: 132 904 368–132 904 404, 37 alustEkson 5: 132 927 121–132 927 207, 87 alustEkson 4: 132 932 178–132 932 222, 45 alustEkson 3: 132 934 147–132 934 941, 795 alustEkson 2: 132 937 067–132 937 193, 127 alustEkson 1: 132 963 259–132 963 634, 376 alust21201510515′3′

Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.

Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).

Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.

Eksonid moodustavad geenist 9,5 kb kogupikkusega 88,2 kb; neist 3492 alust kodeerivad valku.

Kuidas genoomitest loetakse AFF4

6

kohad geenis AFF4, kus ClinVar liigitab muutuse patogeenseks või tõenäoliselt patogeenseks

Neist ükski ei asu lõigul, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab.

Täisgenoomi analüüs hõlmab kogu geeni AFF4 88,2 kb, sealhulgas introne, mitte ainult eksoneid (9,5 kb).

Kust see pärineb

  • HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
  • MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI andmetel: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
  • ClinVar ja GIAB-i stratifikatsioonid: teadaolevad haigusi põhjustavad kohad ning piirkonnad, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.
  • Human Phenotype Ontology, väljaanne 2026-09-01: geeniga seotud tunnused. Lisateavet leiate aadressilt hpo.jax.org.
  • Andmeväljaanne 2026.10.16-c6eea6bf.

Viita sellele lehele

APA

Dante Labs. (n.d.). AFF4 geen: ALF transcription elongation factor 4. Vaadatud 16. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/aff4

Vancouver

Dante Labs. AFF4 geen: ALF transcription elongation factor 4 [Internet]. [viidatud 16. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/aff4

Üks test. Vastused kogu eluks.

Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast

Telli oma Genome Test