Siirry sisältöön
Käytä HSA- tai FSA-varojasi

Geeni

AFF4

ALF transcription elongation factor 4

Yhteenveto

Sytogeneettinen sijainti
5q31.1
Koordinaatit
Kromosomi 5: 132 875 395–132 963 634 (GRCh38)
Eksonit
21 eksonia 88,2 kb:n alueella
Proteiini
1 163 aminohappoa
Tunnetaan myös nimellä
AF5Q31, MCEF
MANE Select -transkripti
ENST00000265343.10NM_014423.4
Lokustyyppi
gene with protein product
  • Erittäin korkea
  • Varma
  • Matala
  • Erittäin matala

ViitegenomiGRCh38

Geenien ja varianttien sivujen sijainnit noudattavat tätä valintaa tässä selaimessa.

Tähän geeniin liittyviä kuratoituja raportteja

Mikään Genome Test -raportti ei vielä lue geeniä AFF4. Testi sekvensoi koko genomisi, joten tiedoissasi on se silti.

AFF4-geenin rakenne

  • Koodaava jakso
  • Translatoimaton alue
  • Intron
  • Transkription suunta
  • Tunnetut tautia aiheuttavat kohdat
  • Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
Kromosomi 5, jossa hakasulke osoittaa AFF4-geenin sijainnin. AFF4 ja 17 geeniä sen läheisyydessä kromosomissa 5, välillä 132 419 515–133 419 514.Kromosomi 55q31.1p15.33p15.32p15.31p15.2p15.1p14.3p14.2p14.1p13.3p13.2p13.1p12p11q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q14.1q14.2q14.3q15q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q31.1q31.2q31.3q32q33.1q33.2q33.3q34q35.1q35.2q35.3132,6 Mb132,8 Mb133 Mb133,2 Mb133,4 Mb: 132 410 832–132 646 079, juoste eteenpäinIRF1: 132 440 440–132 508 719, juoste taaksepäinIRF1IL5: 132 541 444–132 556 838, juoste taaksepäinIL5RAD50: 132 556 019–132 646 349, juoste eteenpäinRAD50IL13: 132 656 263–132 661 110, juoste eteenpäinIL13IL4: 132 673 986–132 682 678, juoste eteenpäinIL4KIF3A: 132 688 806–132 737 638, juoste taaksepäinKIF3ACCNI2: 132 747 319–132 765 178, juoste eteenpäinCCNI2SEPTIN8: 132 750 138–132 807 241, juoste taaksepäinSEPTIN8SOWAHA: 132 813 302–132 816 786, juoste eteenpäinSOWAHASHROOM1: 132 821 271–132 830 924, juoste taaksepäinSHROOM1GDF9: 132 861 181–132 866 884, juoste taaksepäinGDF9UQCRQ: 132 866 623–132 868 847, juoste eteenpäinUQCRQLEAP2: 132 873 444–132 899 343, juoste eteenpäinLEAP2AFF4: 132 875 395–132 963 634, juoste taaksepäinAFF4ZCCHC10: 132 996 985–133 026 604, juoste taaksepäinZCCHC10HSPA4: 133 051 942–133 106 449, juoste eteenpäinHSPA4FSTL4: 133 193 430–133 612 688, juoste taaksepäinFSTL4AFF4-kaavio: 21 eksonia kromosomin 5 juosteella, taaksepäinEksoni 3: 5 tunnettua tautia aiheuttavaa kohtaaEksoni 2: 1 tunnettu tautia aiheuttava kohtaEkson 21: 132 875 395–132 881 186, 5 792 emästäEkson 20: 132 883 340–132 883 560, 221 emästäEkson 19: 132 885 076–132 885 119, 44 emästäEkson 18: 132 886 310–132 886 403, 94 emästäEkson 17: 132 887 521–132 887 592, 72 emästäEkson 16: 132 887 846–132 887 982, 137 emästäEkson 15: 132 888 097–132 888 160, 64 emästäEkson 14: 132 889 079–132 889 173, 95 emästäEkson 13: 132 892 164–132 892 404, 241 emästäEkson 12: 132 893 030–132 893 118, 89 emästäEkson 11: 132 896 323–132 897 240, 918 emästäEkson 10: 132 898 230–132 898 392, 163 emästäEkson 9: 132 899 104–132 899 141, 38 emästäEkson 8: 132 899 587–132 899 641, 55 emästäEkson 7: 132 902 442–132 902 487, 46 emästäEkson 6: 132 904 368–132 904 404, 37 emästäEkson 5: 132 927 121–132 927 207, 87 emästäEkson 4: 132 932 178–132 932 222, 45 emästäEkson 3: 132 934 147–132 934 941, 795 emästäEkson 2: 132 937 067–132 937 193, 127 emästäEkson 1: 132 963 259–132 963 634, 376 emästä21201510515′3′

Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.

Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).

Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.

Eksonit muodostavat 9,5 kb geenin 88,2 kb:stä; 3 492 näistä emäksistä koodaa proteiinia.

Miten genomitesti lukee geeniä AFF4

6

AFF4-geenin kohtaa, joissa ClinVar luokittelee muutoksen patogeeniseksi tai todennäköisesti patogeeniseksi

Mikään niistä ei osu alueelle, jota lyhyet lukemat löytävät vaikeasti.

Kokogenomi kattaa kaikki 88,2 kb geenistä AFF4, intronit mukaan lukien, ei pelkästään 9,5 kb eksoneja.

Mistä tieto on peräisin

  • HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
  • MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkripti, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
  • ClinVar ja GIAB-stratifikaatiot: tunnetut tautia aiheuttavat kohdat sekä alueet, joiden lukeminen lyhyillä luennoilla on vaikeaa.
  • Human Phenotype Ontology, versio 2026-09-01: geeniin liittyvät piirteet. Lue lisää osoitteesta hpo.jax.org.
  • Datajulkaisu 2026.10.16-c6eea6bf.

Viittaa tähän sivuun

APA

Dante Labs. (n.d.). AFF4-geeni: ALF transcription elongation factor 4. Haettu 17. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/aff4

Vancouver

Dante Labs. AFF4-geeni: ALF transcription elongation factor 4 [Internet]. [viitattu 17. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/aff4

Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.

Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa

Tilaa Genome Test