Hopp til innhold
Bruk midlene fra HSA eller FSA
Sekvenser genomet ditt (åpnes i en ny fane)

Gen

AFF4

ALF transcription elongation factor 4

Sammendrag

Cytogenetisk plassering
5q31.1
Koordinater
Kromosom 5: 132 875 395–132 963 634 (GRCh38)
Eksoner
21 eksoner over 88,2 kb
Protein
1 163 aminosyrer
Også kjent som
AF5Q31, MCEF
MANE Select-transkripsjon
ENST00000265343.10NM_014423.4
Lokustype
Protein-coding
  • Svært høy
  • Sikker
  • Lav
  • Svært lav

Kuraterte rapporter som er relevante for dette genet

Ingen Genome Test-rapport leser AFF4 ennå. Testen sekvenserer hele genomet ditt, så dataene dine inkluderer det likevel.

Slik er AFF4 bygget opp

  • Kodende sekvens
  • Utranslatert region
  • Intron
  • Transkripsjonsretning
  • Kjente sykdomsfremkallende posisjoner
  • Områder som korte avlesninger sliter med
Kromosom 5, med en parentes der AFF4 står. AFF4 og 17 gener i nærheten på kromosom 5, fra 132 419 515 til 133 419 514.Kromosom 55q31.1p15.33p15.32p15.31p15.2p15.1p14.3p14.2p14.1p13.3p13.2p13.1p12p11q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q14.1q14.2q14.3q15q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q31.1q31.2q31.3q32q33.1q33.2q33.3q34q35.1q35.2q35.3132,6 Mb132,8 Mb133 Mb133,2 Mb133,4 Mb: 132 410 832–132 646 079, fremover-strengIRF1: 132 440 440–132 508 719, bakover-strengIRF1IL5: 132 541 444–132 556 838, bakover-strengIL5RAD50: 132 556 019–132 646 349, fremover-strengRAD50IL13: 132 656 263–132 661 110, fremover-strengIL13IL4: 132 673 986–132 682 678, fremover-strengIL4KIF3A: 132 688 806–132 737 638, bakover-strengKIF3ACCNI2: 132 747 319–132 765 178, fremover-strengCCNI2SEPTIN8: 132 750 138–132 807 241, bakover-strengSEPTIN8SOWAHA: 132 813 302–132 816 786, fremover-strengSOWAHASHROOM1: 132 821 271–132 830 924, bakover-strengSHROOM1GDF9: 132 861 181–132 866 884, bakover-strengGDF9UQCRQ: 132 866 623–132 868 847, fremover-strengUQCRQLEAP2: 132 873 444–132 899 343, fremover-strengLEAP2AFF4: 132 875 395–132 963 634, bakover-strengAFF4ZCCHC10: 132 996 985–133 026 604, bakover-strengZCCHC10HSPA4: 133 051 942–133 106 449, fremover-strengHSPA4FSTL4: 133 193 430–133 612 688, bakover-strengFSTL4Diagram av AFF4: 21 eksoner på bakover-strengen til kromosom 5Ekson 3: 5 kjente sykdomsfremkallende posisjonerEkson 2: 1 kjent sykdomsfremkallende posisjonEkson 21: 132 875 395–132 881 186, 5 792 baserEkson 20: 132 883 340–132 883 560, 221 baserEkson 19: 132 885 076–132 885 119, 44 baserEkson 18: 132 886 310–132 886 403, 94 baserEkson 17: 132 887 521–132 887 592, 72 baserEkson 16: 132 887 846–132 887 982, 137 baserEkson 15: 132 888 097–132 888 160, 64 baserEkson 14: 132 889 079–132 889 173, 95 baserEkson 13: 132 892 164–132 892 404, 241 baserEkson 12: 132 893 030–132 893 118, 89 baserEkson 11: 132 896 323–132 897 240, 918 baserEkson 10: 132 898 230–132 898 392, 163 baserEkson 9: 132 899 104–132 899 141, 38 baserEkson 8: 132 899 587–132 899 641, 55 baserEkson 7: 132 902 442–132 902 487, 46 baserEkson 6: 132 904 368–132 904 404, 37 baserEkson 5: 132 927 121–132 927 207, 87 baserEkson 4: 132 932 178–132 932 222, 45 baserEkson 3: 132 934 147–132 934 941, 795 baserEkson 2: 132 937 067–132 937 193, 127 baserEkson 1: 132 963 259–132 963 634, 376 baser21201510515′3′

Eksoner i genets MANE Select-transkripsjon (utgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referansegenomet GRCh38.

Kromosombånd fra UCSCs GRCh38-ideogram (2022-10-29).

Gener i nærheten fra Ensembl-utgave 116, på GRCh38.

Eksonene utgjør 9,5 kb av genets 88,2 kb, og 3 492 av disse basene koder for proteinet.

Sekvensering av AFF4

6

posisjoner i AFF4 der ClinVar klassifiserer en endring som patogen eller sannsynligvis patogen

Ingen av dem ligger i en region som korte leseavlesninger har vanskelig for å dekke.

En helgenomsekvensering dekker alle 88,2 kb av AFF4, inkludert introner, ikke bare de 9,5 kb med eksoner.

Egenskaper knyttet til AFF4

The Human Phenotype Ontology lister disse som kjennetegn ved de sjeldne tilstandene AFF4 kan forårsake. Hver egenskaps side viser de andre genene som er knyttet til den.

Eksterne lenker

Hvor dette kommer fra

  • HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og plassering.
  • MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, dets eksoner og kodingssekvens.
  • ClinVar og GIAB-stratifiseringene: kjente sykdomsfremkallende posisjoner, og regionene som korte avlesninger har vanskelig for å dekke.
  • The Human Phenotype Ontology, versjon 2026-09-01: egenskapene knyttet til genet. Les mer på hpo.jax.org.
  • Datautgave 2026.10.17-8666dff2.

Siter denne siden

APA

Dante Labs. (u.d.). AFF4-genet: ALF transcription elongation factor 4. Hentet 17. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/no/genes/aff4

Vancouver

Dante Labs. AFF4-genet: ALF transcription elongation factor 4 [Internett]. [sitert 17. oktober 2026]. Tilgjengelig fra: https://dantelabs.com/no/genes/aff4

Én test. En livstid med svar.

Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker

Få mitt Genome Test