Geeni
SPART
spartin
- HGNC 18514↗(avautuu uuteen välilehteen)
- Ensembl-geeni ENSG00000133104↗(avautuu uuteen välilehteen)
- NCBI Gene 23111↗(avautuu uuteen välilehteen)
Yhteenveto
- Sytogeneettinen sijainti
- 13q13.3
- Koordinaatit
- Kromosomi 13: 36 301 638–36 346 394 (GRCh38)
- Eksonit
- 9 eksonia 44,8 kb:n alueella
- Proteiini
- 666 aminohappoa
- Tunnetaan myös nimellä
- KIAA0610, TAHCCP1
- Aiemmat symbolit
- SPG20
- MANE Select -transkripti
- ENST00000438666.7NM_015087.5
- Lokustyyppi
- gene with protein product
- Erittäin korkea
- Varma
- Matala
- Erittäin matala
ViitegenomiGRCh38hg38
Geenien ja varianttien sivujen sijainnit noudattavat tätä valintaa tässä selaimessa.
Lue SPART ja muu genomisi yhdellä testillä.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa
Tilaa Genome TestTähän geeniin liittyvä kuratoitu raportti
Perinnöllinen spastinen paraplegia
- Perinnöllinen spastinen paraplegia (kaikki tyypit)
Yksi 66 siihen liittyvästä geenistä
Yhteisnimitys kaikille perinnöllisille spastisille paraplegioille, mukaan lukien SPG4 (SPAST), yleisin dominantti muoto, sekä SPG5A, SPG6, SPG10, SPG18, SPG30 ja SPG31.
- ClinGen luokittelee yhteyden: varma
- 1 GenCC-arvioija arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
SPART-geenin rakenne
- Koodaava jakso
- Translatoimaton alue
- Intron
- Transkription suunta
- Tunnetut tautia aiheuttavat kohdat
- Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.
Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).
Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.
Eksonit muodostavat 4,9 kb geenin 44,8 kb:stä; 2 001 näistä emäksistä koodaa proteiinia.
Miten genomitesti lukee geeniä SPART
14
SPART-geenin kohtaa, joissa ClinVar luokittelee muutoksen patogeeniseksi tai todennäköisesti patogeeniseksi
Mikään niistä ei osu alueelle, jota lyhyet lukemat löytävät vaikeasti.
Kokogenomi kattaa kaikki 44,8 kb geenistä SPART, intronit mukaan lukien, ei pelkästään 4,9 kb eksoneja.
Samoihin sairauksiin liittyvät geenit
- ABCD1ATP binding cassette subfamily D member 1Yhteinen sairaus: 1
- ABHD16Aabhydrolase domain containing 16A, phospholipaseYhteinen sairaus: 1
- ALDH18A1aldehyde dehydrogenase 18 family member A1Yhteinen sairaus: 1
- AMFRautocrine motility factor receptorYhteinen sairaus: 1
- AP4B1adaptor related protein complex 4 subunit beta 1Yhteinen sairaus: 1
- AP4E1adaptor related protein complex 4 subunit epsilon 1Yhteinen sairaus: 1
- AP4M1adaptor related protein complex 4 subunit mu 1Yhteinen sairaus: 1
- AP4S1adaptor related protein complex 4 subunit sigma 1Yhteinen sairaus: 1
- AP5Z1adaptor related protein complex 5 subunit zeta 1Yhteinen sairaus: 1
- ARL6IP1ARL6 interacting reticulophagy regulator 1Yhteinen sairaus: 1
- ATL1atlastin GTPase 1Yhteinen sairaus: 1
- ATP13A2ATPase cation transporting 13A2Yhteinen sairaus: 1
Geeniin SPART liittyvät piirteet
Human Phenotype Ontology luettelee nämä piirteinä harvinaisista sairauksista, joita SPART voi aiheuttaa. Kunkin piirteen sivulla luetellaan muut siihen liittyvät geenit.
Abnormality of the nervous system
- Babinski sign
- Difficulty articulating speech
- Impaired vibration sensation at ankles
- Increased reflexes
- Intellectual disability, mild
- Lack of coordination of movement
- Motor delay
- Abnormal shape of brain
Näytä 17 piirrettä lisää
- Abnormality of the cerebellum
- Cognitive impairment
- Delayed speech and language development
- Global developmental delay
- Impaired vibratory sensation
- Slurred speech
- Specific learning disability
- Anxiety
- Can't control feelings
- Difficulty sleeping
- Hallucinations
- Panic attack
- Psychosis
- Speech apraxia
- Abnormal gait
- Degeneration of cerebellum
- Knee clonus
Ulkoiset linkit
Geenitietueet
Transkripti
Proteiini
Mistä tieto on peräisin
- HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
- MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkripti, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
- GenCC ja ClinGen, julkaisu 2026-10-16: mihin sairauksiin geeni liittyy ja kuinka vahvasti.
- ACMG:n toissijaisten löydösten luettelo, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-stratifikaatiot: tunnetut tautia aiheuttavat kohdat sekä alueet, joiden lukeminen lyhyillä luennoilla on vaikeaa.
- Human Phenotype Ontology, versio 2026-09-01: geeniin liittyvät piirteet. Lue lisää osoitteesta hpo.jax.org.
- Datajulkaisu 2026.10.16-c6eea6bf.
Viittaa tähän sivuun
Dante Labs. (n.d.). SPART-geeni: spartin. Haettu 17. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/spart
Dante Labs. SPART-geeni: spartin [Internet]. [viitattu 17. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/spart
Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa