Geeni
KCNH2
potassium voltage-gated channel subfamily H member 2
- HGNC 6251↗(avautuu uuteen välilehteen)
- Ensembl-geeni ENSG00000055118↗(avautuu uuteen välilehteen)
- NCBI Gene 3757↗(avautuu uuteen välilehteen)
Yhteenveto
- Sytogeneettinen sijainti
- 7q36.1
- Koordinaatit
- Kromosomi 7: 150 944 961–150 978 321 (GRCh38)
- Eksonit
- 15 eksonia 33,4 kb:n alueella
- Proteiini
- 1 159 aminohappoa
- Periytyminen
- Autosomaalinen dominantti
- Tunnetaan myös nimellä
- Kv11.1, HERG, erg1
- Aiemmat symbolit
- LQT2
- MANE Select -transkripti
- ENST00000262186.10NM_000238.4
- Lokustyyppi
- gene with protein product
- Erittäin korkea
- Varma
- Matala
- Erittäin matala
ViitegenomiGRCh38hg38
Geenien ja varianttien sivujen sijainnit noudattavat tätä valintaa tässä selaimessa.
Lue KCNH2 ja muu genomisi yhdellä testillä.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa
Tilaa Genome TestTähän geeniin liittyviä kuratoituja raportteja
Pitkä QT-oireyhtymä
Sydämen repolarisaation häiriö, jolle on ominaista pidentynyt QT-väli ja vaarallisten kammiorytmihäiriöiden, kuten torsades de pointesin, riski.
- ClinGen luokittelee yhteyden: varma
- 4 GenCC-arvioijaa arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
- ACMG:n toissijaisten löydösten luettelossa
Mitä tieto muuttaa
Beetasalpaajat, ICD-laitteen asennus, liikunnan rajoittaminen, geneettinen neuvonta
Lyhyen QT-välin oireyhtymä
- Autosomaalinen dominantti
Sydämen sähköjärjestelmän geneettinen sairaus, johon kuuluu joukko merkkejä ja oireita: EKG:ssa lyhyt QT-väli (< 300 ms), joka ei merkittävästi muutu sykkeen mukaan, korkeat ja terävät T-aallot sekä rakenteellisesti normaali sydän. Lyhyen QT-välin oireyhtymä näyttää periytyvän autosomaalisesti dominantisti, ja muutamia sairastuneita perheitä on tunnistettu
- ClinGen luokittelee yhteyden: varma
- 3 GenCC-arvioijaa arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
Periytyminen
- Autosomaalinen dominantti
- Yksi muuttunut kopio kummalta vanhemmalta tahansa riittää. Vanhempi, jolla on yksi, siirtää sen kullekin lapselleen todennäköisyydellä yksi kahdesta.
KCNH2-geenin rakenne
- Koodaava jakso
- Translatoimaton alue
- Intron
- Transkription suunta
- Tunnetut tautia aiheuttavat kohdat
- Variantit, joilla on sivu
Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.
Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).
Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.
Eksonit muodostavat 4,3 kb geenin 33,4 kb:stä; 3 480 näistä emäksistä koodaa proteiinia.
Miten genomitesti lukee geeniä KCNH2
499
KCNH2-geenin kohtaa, joissa ClinVar luokittelee muutoksen patogeeniseksi tai todennäköisesti patogeeniseksi
Mikään niistä ei osu alueelle, jota lyhyet lukemat löytävät vaikeasti.
Kokogenomi kattaa kaikki 33,4 kb geenistä KCNH2, intronit mukaan lukien, ei pelkästään 4,3 kb eksoneja.
Variantit, joilla on sivu (54)
Tässä ovat KCNH2-variantit, joilla on sivu, eniten arvostelutähtiä saaneet ensin. Jokainen sivu kuvaa ClinVarin julkista tietuetta variantista, ei koskaan tulosta.
| Variantti | HGVS c. | Eksoni tai introni | Sijainti (GRCh38) | ClinVar-luokitus | Arvioinnin tila |
|---|---|---|---|---|---|
| A490T | c.1468G>A | Eksoni 6 | 150 952 514 | Patogeeninen/todennäköisesti patogeeninen | ★★★★2 tähteä neljästä kriteerit annettu, useita lähettäjiä, ei ristiriitoja |
| A614V | c.1841C>T | Eksoni 7 | 150 951 552 | Patogeeninen | ★★★★2 tähteä neljästä kriteerit annettu, useita lähettäjiä, ei ristiriitoja |
| A715Gfs*7 | c.2144_2145del | Introni 8 | 150 950 920 | Patogeeninen | ★★★★2 tähteä neljästä kriteerit annettu, useita lähettäjiä, ei ristiriitoja |
| c.1128G>A | Eksoni 5 | 150 957 291 | Patogeeninen/todennäköisesti patogeeninen | ★★★★2 tähteä neljästä kriteerit annettu, useita lähettäjiä, ei ristiriitoja | |
| c.2398+5G>T | Introni 9 | 150 950 163 | Patogeeninen/todennäköisesti patogeeninen | ★★★★2 tähteä neljästä kriteerit annettu, useita lähettäjiä, ei ristiriitoja | |
| c.2966-2A>G | Introni 12 | 150 947 516 | Todennäköisesti patogeeninen | ★★★★2 tähteä neljästä kriteerit annettu, useita lähettäjiä, ei ristiriitoja | |
| D509N | c.1525G>A | Eksoni 6 | 150 952 457 | Todennäköisesti patogeeninen | ★★★★2 tähteä neljästä kriteerit annettu, useita lähettäjiä, ei ristiriitoja |
| D837G | c.2510A>G | Eksoni 10 | 150 948 938 | Patogeeninen/todennäköisesti patogeeninen | ★★★★2 tähteä neljästä kriteerit annettu, useita lähettäjiä, ei ristiriitoja |
| E23X | c.66dup | Eksoni 1 | 150 977 847 | Patogeeninen/todennäköisesti patogeeninen | ★★★★2 tähteä neljästä kriteerit annettu, useita lähettäjiä, ei ristiriitoja |
| E58K | c.172G>A | Eksoni 2 | 150 974 846 | Patogeeninen/todennäköisesti patogeeninen | ★★★★2 tähteä neljästä kriteerit annettu, useita lähettäjiä, ei ristiriitoja |
Samoihin sairauksiin liittyvät geenit
- KCNJ2potassium inwardly rectifying channel subfamily J member 2Yhteisiä sairauksia: 2
- KCNQ1potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1Yhteisiä sairauksia: 2
- CACNA1Ccalcium voltage-gated channel subunit alpha1 CYhteinen sairaus: 1
- CALM1calmodulin 1Yhteinen sairaus: 1
- CALM2calmodulin 2Yhteinen sairaus: 1
- CALM3calmodulin 3Yhteinen sairaus: 1
- KCNE1potassium voltage-gated channel subfamily E regulatory subunit 1Yhteinen sairaus: 1
- SCN5Asodium voltage-gated channel alpha subunit 5Yhteinen sairaus: 1
- SLC4A3solute carrier family 4 member 3Yhteinen sairaus: 1
- TRDNtriadinYhteinen sairaus: 1
Geeniin KCNH2 liittyvät piirteet
Human Phenotype Ontology luettelee nämä piirteinä harvinaisista sairauksista, joita KCNH2 voi aiheuttaa. Kunkin piirteen sivulla luetellaan muut siihen liittyvät geenit.
Ulkoiset linkit
Geenitietueet
Transkripti
Proteiini
Mistä tieto on peräisin
- HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
- MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkripti, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
- GenCC ja ClinGen, julkaisu 2026-10-16: mihin sairauksiin geeni liittyy ja kuinka vahvasti.
- ACMG:n toissijaisten löydösten luettelo, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-stratifikaatiot: tunnetut tautia aiheuttavat kohdat sekä alueet, joiden lukeminen lyhyillä luennoilla on vaikeaa.
- Human Phenotype Ontology, versio 2026-09-01: geeniin liittyvät piirteet. Lue lisää osoitteesta hpo.jax.org.
- Datajulkaisu 2026.10.16-c6eea6bf.
Viittaa tähän sivuun
Dante Labs. (n.d.). KCNH2-geeni: potassium voltage-gated channel subfamily H member 2. Haettu 17. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/kcnh2
Dante Labs. KCNH2-geeni: potassium voltage-gated channel subfamily H member 2 [Internet]. [viitattu 17. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/kcnh2
Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa