Gen
KCNH2
potassium voltage-gated channel subfamily H member 2
- HGNC 6251↗(opent in een nieuw tabblad)
- Ensembl-gen ENSG00000055118↗(opent in een nieuw tabblad)
- NCBI Gene 3757↗(opent in een nieuw tabblad)
Samenvatting
- Cytogenetische locatie
- 7q36.1
- Coördinaten
- Chromosoom 7: 150.944.961–150.978.321 (GRCh38)
- Exons
- 15 exons over 33,4 kb
- Eiwit
- 1.159 aminozuren
- Ook bekend als
- Kv11.1, HERG, erg1
- Eerdere symbolen
- LQT2
- MANE Select-transcript
- ENST00000262186.10NM_000238.4
- Type locus
- Eiwitcoderend
- Zeer hoog
- Betrouwbaar
- Laag
- Zeer laag
Deze pagina als gegevens
Voeg .json toe aan het adres van de pagina, of vraag application/json aan, om haar als JSON te lezen.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/kcnh2.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLees KCNH2 en de rest van uw genoom met één test.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken
Mijn Genome Test bestellenGecureerde rapporten over dit gen
Long-QT-syndroom
Een stoornis in de hartrepolarisatie, gekenmerkt door een verlengd QT-interval en een risico op gevaarlijke ventriculaire ritmestoornissen zoals torsades de pointes.
- ClinGen beoordeelt het verband als definitief
- 4 GenCC-indieners beoordelen het als definitief of sterk
- Op de ACMG-lijst met secundaire bevindingen
▶Actionability
Bètablokkers, plaatsing van een ICD, beperking van lichamelijke activiteit, erfelijkheidsadvies
Short-QT-syndroom
- Autosomaal dominant
Een erfelijke aandoening van het elektrische geleidingssysteem van het hart, die bestaat uit een combinatie van kenmerken en symptomen: een kort QT-interval op een ECG (< 300 ms) dat niet significant verandert met de hartfrequentie, hoge en gepunte T-golven, en een structureel normaal hart. Het short-QT-syndroom lijkt autosomaal dominant overgeërfd te worden; er zijn al enkele getroffen families vastgesteld.
- ClinGen beoordeelt het verband als definitief
- 3 GenCC-indieners beoordelen het als definitief of sterk
Opbouw van KCNH2
- Coderende sequentie
- Niet-vertaald gebied
- Intron
- Richting van transcriptie
- Bekende ziekteveroorzakende posities
- Varianten met een pagina
Exonen van het MANE Select-transcript van het gen (release v1.5), afkomstig van NCBI en EMBL-EBI, op het GRCh38-referentiegenoom.
Chromosoombanden uit het ideogram van UCSC's GRCh38 (2022-10-29).
Genen in de buurt uit Ensembl-release 116, op GRCh38.
Exonen vormen 4,3 kb van de 33,4 kb van het gen; 3.480 van die basen coderen voor het eiwit.
Sequencing KCNH2
14Makkelijk
Hoe moeilijk KCNH2 is om met korte reads te sequencen, op een schaal van 100
0 · Makkelijk100 · Moeilijk
Bijna alle exonen van KCNH2 liggen op plaatsen waar korte reads schoon in kaart worden gebracht.
Wat er nog bij komt: het aandeel van de exonen van KCNH2 in elk soort moeilijke regio
- MappabilityStukken waar reads van 100 of 250 bp niet uniek kunnen worden geplaatst, zodat een call daar mogelijk ontbreekt of fout is. Gewicht 100%.0%
- HomologieSegmentale duplicaties: kopieën elders in het genoom, zoals paralogen en pseudogenen, bij 90% identiteit of meer. Gewicht 60%.0%
- Shared with chrYThe pseudoautosomal regions and the X-transposed region, where chrX and chrY carry the same or nearly the same sequence, so reads from either may land on the other. Gewicht 60%.0%
- ReferentiedekkingGaten in de nabijgelegen referentie-assemblage, waar geen sequentie is waarop reads kunnen uitlijnen. Gewicht 50%.0%
- HerhalingenTandemherhalingen en reeksen van één base, waarop reads kunnen verschuiven en die mogelijk niet volledig worden overspannen. Gewicht 30%.7,6%
- GC-gehalteVensters met minder dan 25% of meer dan 65% G en C, die de bibliotheekbereiding dun dekt. Gewicht 20%.62%
Een score van Dante Labs op basis van ons eigen onderzoek, gebouwd op de Genome in a Bottle-kaarten van NIST met moeilijk te sequencen regio's.Hoe de score wordt berekendElke balk is het aandeel van de exonbasen van KCNH2 in dat soort moeilijke regio. Elk soort kan op zichzelf een gen moeilijk maken, en elk extra soort voegt steeds minder toe: 0 als geen enkele base in een regio ligt, 100 als elke base op een plek ligt waar reads niet uniek kunnen worden geplaatst.
499
posities in KCNH2 waar ClinVar een wijziging als pathogeen of waarschijnlijk pathogeen indeelt
Geen daarvan valt in een regio die korte reads moeilijk vinden.
Een volledig genoom dekt alle 33,4 kb van KCNH2, inclusief intronen, en niet alleen de 4,3 kb aan exonen.
Varianten met een pagina (54)
De KCNH2-varianten met een pagina hier, eerst die met de meeste reviewsterren. Elke pagina beschrijft het openbare ClinVar-dossier van de variant, nooit een uitslag.
| Variant | HGVS c. | Exon of intron | Positie (GRCh38) | ClinVar-classificatie | Reviewstatus |
|---|---|---|---|---|---|
| A490T | c.1468G>A | Exon 6 | 150.952.514 | Pathogeen/waarschijnlijk pathogeen | ★★★★2 sterren van de 4 criteria opgegeven, meerdere indieners, geen conflicten |
| A614V | c.1841C>T | Exon 7 | 150.951.552 | Pathogeen | ★★★★2 sterren van de 4 criteria opgegeven, meerdere indieners, geen conflicten |
| A715Gfs*7 | c.2144_2145del | Intron 8 | 150.950.920 | Pathogeen | ★★★★2 sterren van de 4 criteria opgegeven, meerdere indieners, geen conflicten |
| c.1128G>A | Exon 5 | 150.957.291 | Pathogeen/waarschijnlijk pathogeen | ★★★★2 sterren van de 4 criteria opgegeven, meerdere indieners, geen conflicten | |
| c.2398+5G>T | Intron 9 | 150.950.163 | Pathogeen/waarschijnlijk pathogeen | ★★★★2 sterren van de 4 criteria opgegeven, meerdere indieners, geen conflicten | |
| c.2966-2A>G | Intron 12 | 150.947.516 | Waarschijnlijk pathogeen | ★★★★2 sterren van de 4 criteria opgegeven, meerdere indieners, geen conflicten | |
| D509N | c.1525G>A | Exon 6 | 150.952.457 | Waarschijnlijk pathogeen | ★★★★2 sterren van de 4 criteria opgegeven, meerdere indieners, geen conflicten |
| D837G | c.2510A>G | Exon 10 | 150.948.938 | Pathogeen/waarschijnlijk pathogeen | ★★★★2 sterren van de 4 criteria opgegeven, meerdere indieners, geen conflicten |
| E23X | c.66dup | Exon 1 | 150.977.847 | Pathogeen/waarschijnlijk pathogeen | ★★★★2 sterren van de 4 criteria opgegeven, meerdere indieners, geen conflicten |
| E58K | c.172G>A | Exon 2 | 150.974.846 | Pathogeen/waarschijnlijk pathogeen | ★★★★2 sterren van de 4 criteria opgegeven, meerdere indieners, geen conflicten |
ClinVar pathogenic variants (590)
The KCNH2 variants ClinVar classifies pathogenic or likely pathogenic for any condition, reviewed by at least one submitter with criteria, and the most reviewed of them. It is ClinVar's public record of the gene, never a result.
- Pathogeen 428
- Pathogeen/waarschijnlijk pathogeen 14
- Waarschijnlijk pathogeen 148
| Variant | Conditions | ClinVar-classificatie | Reviewstatus |
|---|---|---|---|
| NM_000238.4(KCNH2):c.3096_3099del (p.Arg1033fs) | long QT syndrome | Pathogeen | ★★★★2 sterren van de 4 criteria opgegeven, meerdere indieners, geen conflicten |
| NM_000238.4(KCNH2):c.3096_3099dup (p.Pro1034fs) (opens in a new tab) | cardiac rhythm disease and 2 others | Pathogeen | ★★★★2 sterren van de 4 criteria opgegeven, meerdere indieners, geen conflicten |
| NM_000238.4(KCNH2):c.3092_3096dup (p.Arg1033fs) | long QT syndrome | Pathogeen | ★★★★2 sterren van de 4 criteria opgegeven, meerdere indieners, geen conflicten |
| NM_000238.4(KCNH2):c.3040C>T (p.Arg1014Ter) | familial long QT syndrome and 2 others | Pathogeen | ★★★★2 sterren van de 4 criteria opgegeven, meerdere indieners, geen conflicten |
| NM_000238.4(KCNH2):c.3017del (p.Gly1006fs) | long QT syndrome and 2 others | Pathogeen | ★★★★2 sterren van de 4 criteria opgegeven, meerdere indieners, geen conflicten |
| NM_000238.4(KCNH2):c.3002G>A (p.Trp1001Ter) | cardiac rhythm disease and 1 other | Pathogeen | ★★★★2 sterren van de 4 criteria opgegeven, meerdere indieners, geen conflicten |
| NM_000238.4(KCNH2):c.2959_2960del (p.Leu987fs) | cardiac rhythm disease and 3 others | Pathogeen | ★★★★2 sterren van de 4 criteria opgegeven, meerdere indieners, geen conflicten |
| NM_000238.4(KCNH2):c.2780G>A (p.Trp927Ter) | long QT syndrome | Pathogeen | ★★★★2 sterren van de 4 criteria opgegeven, meerdere indieners, geen conflicten |
| NM_000238.4(KCNH2):c.2775dup (p.Pro926fs) | cardiac rhythm disease and 1 other | Pathogeen | ★★★★2 sterren van de 4 criteria opgegeven, meerdere indieners, geen conflicten |
| NM_000238.4(KCNH2):c.2775del (p.Pro926fs) | cardiac rhythm disease and 1 other | Pathogeen | ★★★★2 sterren van de 4 criteria opgegeven, meerdere indieners, geen conflicten |
| NM_000238.4(KCNH2):c.2587C>T (p.Arg863Ter) | familial long QT syndrome and 1 other | Pathogeen | ★★★★2 sterren van de 4 criteria opgegeven, meerdere indieners, geen conflicten |
| NM_000238.4(KCNH2):c.2467C>T (p.Arg823Trp) | familial long QT syndrome and 1 other | Pathogeen | ★★★★2 sterren van de 4 criteria opgegeven, meerdere indieners, geen conflicten |
| NM_000238.4(KCNH2):c.2464G>A (p.Val822Met) | long QT syndrome | Pathogeen | ★★★★2 sterren van de 4 criteria opgegeven, meerdere indieners, geen conflicten |
| NM_000238.4(KCNH2):c.2453C>T (p.Ser818Leu) | cardiac rhythm disease and 2 others | Pathogeen | ★★★★2 sterren van de 4 criteria opgegeven, meerdere indieners, geen conflicten |
| NM_000238.4(KCNH2):c.2254C>T (p.Arg752Trp) | cardiac rhythm disease and 3 others | Pathogeen | ★★★★2 sterren van de 4 criteria opgegeven, meerdere indieners, geen conflicten |
| NM_000238.4(KCNH2):c.2230C>T (p.Arg744Ter) | familial long QT syndrome and 2 others | Pathogeen | ★★★★2 sterren van de 4 criteria opgegeven, meerdere indieners, geen conflicten |
| NM_000238.4(KCNH2):c.2144_2145del (p.Ala715fs) | long QT syndrome | Pathogeen | ★★★★2 sterren van de 4 criteria opgegeven, meerdere indieners, geen conflicten |
| NM_000238.4(KCNH2):c.2104C>T (p.Gln702Ter) | cardiac rhythm disease and 3 others | Pathogeen | ★★★★2 sterren van de 4 criteria opgegeven, meerdere indieners, geen conflicten |
| NM_000238.4(KCNH2):c.1990C>T (p.Gln664Ter) | long QT syndrome | Pathogeen | ★★★★2 sterren van de 4 criteria opgegeven, meerdere indieners, geen conflicten |
| NM_000238.4(KCNH2):c.1886A>G (p.Asn629Ser) | long QT syndrome and 2 others | Pathogeen | ★★★★2 sterren van de 4 criteria opgegeven, meerdere indieners, geen conflicten |
| NM_000238.4(KCNH2):c.1882G>A (p.Gly628Ser) | long QT syndrome and 2 others | Pathogeen | ★★★★2 sterren van de 4 criteria opgegeven, meerdere indieners, geen conflicten |
| NM_000238.4(KCNH2):c.1868C>T (p.Thr623Ile) | long QT syndrome and 1 other | Pathogeen | ★★★★2 sterren van de 4 criteria opgegeven, meerdere indieners, geen conflicten |
| NM_000238.4(KCNH2):c.1841C>T (p.Ala614Val) | long QT syndrome and 1 other | Pathogeen | ★★★★2 sterren van de 4 criteria opgegeven, meerdere indieners, geen conflicten |
| NM_000238.4(KCNH2):c.1810G>A (p.Gly604Ser) | long QT syndrome | Pathogeen | ★★★★2 sterren van de 4 criteria opgegeven, meerdere indieners, geen conflicten |
| NM_000238.4(KCNH2):c.1714G>A (p.Gly572Ser) | long QT syndrome and 1 other | Pathogeen | ★★★★2 sterren van de 4 criteria opgegeven, meerdere indieners, geen conflicten |
See all 590 with every other KCNH2 variant in ClinVar → (opens in a new tab)
Genen die aan dezelfde aandoeningen zijn gekoppeld
- KCNJ2potassium inwardly rectifying channel subfamily J member 2Deelt 2 aandoeningen
- KCNQ1potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1Deelt 2 aandoeningen
- CACNA1Ccalcium voltage-gated channel subunit alpha1 CDeelt 1 aandoening
- CALM1calmodulin 1Deelt 1 aandoening
- CALM2calmodulin 2Deelt 1 aandoening
- CALM3calmodulin 3Deelt 1 aandoening
- KCNE1potassium voltage-gated channel subfamily E regulatory subunit 1Deelt 1 aandoening
- SCN5Asodium voltage-gated channel alpha subunit 5Deelt 1 aandoening
- SLC4A3solute carrier family 4 member 3Deelt 1 aandoening
- TRDNtriadinDeelt 1 aandoening
Kenmerken gekoppeld aan KCNH2
De Human Phenotype Ontology vermeldt deze als kenmerken van de zeldzame aandoeningen die KCNH2 kan veroorzaken. Op de pagina van elk kenmerk staan de andere genen die ermee verband houden.
Externe links
Genrecords
Transcript
Eiwit
Waar dit vandaan komt
- HGNC: het symbool, de naam, andere symbolen en de locatie van het gen.
- MANE Select v1.5, van NCBI en EMBL-EBI: het transcript, de exonen en de coderende sequentie.
- GenCC en ClinGen, uitgebracht in 2026-10-19: welke aandoeningen aan het gen zijn gekoppeld en hoe sterk die koppeling is.
- De ACMG-lijst met secundaire bevindingen, SF v3.2.
- ClinVar en de GIAB-stratificaties: bekende ziekteveroorzakende posities en de regio's die short reads moeilijk vinden.
- De genoomstratificaties van Genome in a Bottle, van NIST: de score voor de moeilijkheid van sequencing.
- De Human Phenotype Ontology, versie 2026-09-01: de kenmerken die aan het gen zijn gekoppeld. Meer informatie vindt u op hpo.jax.org.
- Gegevensrelease 2026.10.19-9814e911.
Deze pagina citeren
Dante Labs. (z.d.). KCNH2-gen: potassium voltage-gated channel subfamily H member 2. Geraadpleegd op 19 oktober 2026, van https://dantelabs.com/nl/genes/kcnh2
Dante Labs. KCNH2-gen: potassium voltage-gated channel subfamily H member 2 [Internet]. [geraadpleegd 19 oktober 2026]. Beschikbaar op: https://dantelabs.com/nl/genes/kcnh2
Eén test. Een leven lang antwoorden.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken