Genas
KCNH2
potassium voltage-gated channel subfamily H member 2
- HGNC 6251↗(atsidaro naujame skirtuke)
- Ensembl genas ENSG00000055118↗(atsidaro naujame skirtuke)
- NCBI Gene 3757↗(atsidaro naujame skirtuke)
Santrauka
- Citogenetinė vieta
- 7q36.1
- Koordinatės
- Chromosoma 7: 150 944 961–150 978 321 (GRCh38)
- Eksonai
- 15 eksonų per 33,4 kb
- Baltymas
- 1 159 aminorūgščių
- Taip pat žinomas kaip
- Kv11.1, HERG, erg1
- Ankstesni simboliai
- LQT2
- MANE Select transkriptas
- ENST00000262186.10NM_000238.4
- Lokuso tipas
- Baltymus koduojantys
- Labai aukštas
- Patikimas
- Žemas
- Labai žemas
Ši puslapis kaip duomenys
Norėdami perskaityti jį kaip JSON, pridėkite .json prie puslapio adreso arba nurodykite application/json.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/kcnh2.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$namePerskaitykite KCNH2 ir likusį savo genomą su vienu tyrimu.
Nuo 449 $Nemokamas pristatymas · Rezultatai per 6–8 savaites
Įsigyti savo Genome TestKuruotos ataskaitos, susijusios su šiuo genu
Long QT sindromas
Širdies repoliarizacijos sutrikimas, pasireiškiantis pailgėjusiu QT intervalu ir pavojingų skilvelių aritmijų, tokių kaip torsades de pointes, rizika.
- ClinGen vertina ryšį kaip definityvų
- 4 GenCC pateikėjų vertina jį kaip definityvų arba stiprų
- Įtrauktas į ACMG antrinių radinių sąrašą
▶Veiksmingumas
Beta blokatoriai, ICD implantavimas, fizinio aktyvumo apribojimas, genetinis konsultavimas
Trumpojo QT intervalo sindromas
- Autosominis dominantinis
Genetinė širdies elektrinės sistemos liga, pasireiškianti tam tikru požymių ir simptomų deriniu: elektrokardiogramoje trumpas QT intervalas (< 300 ms), kuris reikšmingai nesikeičia keičiantis širdies ritmui, aukšti ir smailūs T bangos dantys ir struktūriškai normali širdis. Manoma, kad trumpojo QT intervalo sindromas paveldimas autosominiu dominantiniu būdu, ir nustatyta keletas šią ligą turinčių šeimų
- ClinGen vertina ryšį kaip definityvų
- 3 GenCC pateikėjų vertina jį kaip definityvų arba stiprų
Kaip išdėstytas KCNH2
- Koduojanti seka
- Netransliuojama sritis
- Intronas
- Transkripcijos kryptis
- Žinomos su liga susijusios vietos
- Variantai su puslapiu
Geno MANE Select transkripto eksonai (išleidimas v1.5), pagal NCBI ir EMBL-EBI, GRCh38 atskaitos genome.
Chromosomų juostos pagal UCSC GRCh38 ideogramą (2022-10-29).
Netoliese esantys genai iš Ensembl leidimo 116, GRCh38.
Eksonai sudaro 4,3 kb iš 33,4 kb geno; 3 480 šių bazių koduoja baltymą.
Sekoskaita: KCNH2
7Maža
Kiek sunku sekti KCNH2 trumpaisiais skaitiniais, iš 100Kiekvienas stulpelis rodo KCNH2 egzonų bazių dalį tokio tipo sunkiuose regionuose. Balas juos sveria pagal tai, kiek kiekvienas iš jų apsunkina trumpųjų skaitinių iškvietimą: 0, kai nė viena bazė nepatenka į jokį regioną, 100, kai kiekviena bazė patenka į visus jų.
- Atvaizdavimas į genomąRuožai, kuriuose 100 arba 250 bp skaitinių negali būti vienareikšmiškai įtvirtinti, todėl ten esantis rezultatas gali būti nerastas arba klaidingas. Svoris: 35 %.0 %
- HomologijaSegmentinės dublikacijos: kopijos kituose genomo vietose, pavyzdžiui paralogai ir pseudogenai, kai tapatumas 90 % ar didesnis. Svoris: 30 %.0 %
- PasikartojimaiTandeminiai pasikartojimai ir vieno nukleotido serijos, kuriose skaitiniai slysta ir gali neapimti. Svoris: 15 %.7,6 %
- GC kiekisLangai, kurių GC kiekis yra mažesnis nei 25 % arba didesnis nei 65 %, ir kuriuos bibliotekos paruošimas apima silpnai. Svoris: 10 %.62 %
- Nuorodinio genomo aprėptisSpragos nuorodinėje sekoje šalia, kur nėra sekos, prie kurios trumpieji skaitiniai galėtų prisijungti. Svoris: 10 %.0 %
499
KCNH2 pozicijos, kuriose ClinVar pakitimą klasifikuoja kaip patogeninį arba greičiausiai patogeninį
Nė viena iš jų nepatenka į sritį, kurią trumpieji skaitiniai sunkiai aptinka.
Visas genomo sekoskaita apima visus 33,4 kb geno KCNH2, įskaitant intronus, o ne tik 4,3 kb eksonų.
Variantų su puslapiais (54)
Čia pateikiami KCNH2 variantai su puslapiais, pirma – su daugiausia apžvalgos žvaigždučių. Kiekviename puslapyje aprašomas viešas ClinVar įrašas apie variantą, niekada ne rezultatas.
| Variantas | HGVS c. | Eksonas ar intronas | Pozicija (GRCh38) | ClinVar klasifikacija | Apžvalgos būsena |
|---|---|---|---|---|---|
| A490T | c.1468G>A | Eksonas 6 | 150 952 514 | Patogeninis / tikriausiai patogeninis | ★★★★2 žvaigždučių iš 4 kriterijai pateikti, keli pateikėjai, prieštaravimų nėra |
| A614V | c.1841C>T | Eksonas 7 | 150 951 552 | Patogeninis | ★★★★2 žvaigždučių iš 4 kriterijai pateikti, keli pateikėjai, prieštaravimų nėra |
| A715Gfs*7 | c.2144_2145del | Intronas 8 | 150 950 920 | Patogeninis | ★★★★2 žvaigždučių iš 4 kriterijai pateikti, keli pateikėjai, prieštaravimų nėra |
| c.1128G>A | Eksonas 5 | 150 957 291 | Patogeninis / tikriausiai patogeninis | ★★★★2 žvaigždučių iš 4 kriterijai pateikti, keli pateikėjai, prieštaravimų nėra | |
| c.2398+5G>T | Intronas 9 | 150 950 163 | Patogeninis / tikriausiai patogeninis | ★★★★2 žvaigždučių iš 4 kriterijai pateikti, keli pateikėjai, prieštaravimų nėra | |
| c.2966-2A>G | Intronas 12 | 150 947 516 | Tikriausiai patogeninis | ★★★★2 žvaigždučių iš 4 kriterijai pateikti, keli pateikėjai, prieštaravimų nėra | |
| D509N | c.1525G>A | Eksonas 6 | 150 952 457 | Tikriausiai patogeninis | ★★★★2 žvaigždučių iš 4 kriterijai pateikti, keli pateikėjai, prieštaravimų nėra |
| D837G | c.2510A>G | Eksonas 10 | 150 948 938 | Patogeninis / tikriausiai patogeninis | ★★★★2 žvaigždučių iš 4 kriterijai pateikti, keli pateikėjai, prieštaravimų nėra |
| E23X | c.66dup | Eksonas 1 | 150 977 847 | Patogeninis / tikriausiai patogeninis | ★★★★2 žvaigždučių iš 4 kriterijai pateikti, keli pateikėjai, prieštaravimų nėra |
| E58K | c.172G>A | Eksonas 2 | 150 974 846 | Patogeninis / tikriausiai patogeninis | ★★★★2 žvaigždučių iš 4 kriterijai pateikti, keli pateikėjai, prieštaravimų nėra |
Genai, susieti su tomis pačiomis būklėmis
- KCNJ2potassium inwardly rectifying channel subfamily J member 2Turi 2 bendrų būklių
- KCNQ1potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1Turi 2 bendrų būklių
- CACNA1Ccalcium voltage-gated channel subunit alpha1 CTuri 1 bendrą būklę
- CALM1calmodulin 1Turi 1 bendrą būklę
- CALM2calmodulin 2Turi 1 bendrą būklę
- CALM3calmodulin 3Turi 1 bendrą būklę
- KCNE1potassium voltage-gated channel subfamily E regulatory subunit 1Turi 1 bendrą būklę
- SCN5Asodium voltage-gated channel alpha subunit 5Turi 1 bendrą būklę
- SLC4A3solute carrier family 4 member 3Turi 1 bendrą būklę
- TRDNtriadinTuri 1 bendrą būklę
Savybės, susijusios su KCNH2
Žmogaus fenotipų ontologija šias savybes nurodo kaip retų ligų, kurias gali sukelti KCNH2, požymius. Kiekvienos savybės puslapyje nurodyti kiti su ja susiję genai.
Išorinės nuorodos
Geno įrašai
Transkriptas
Baltymas
Iš kur tai paimta
- HGNC: geno simbolis, pavadinimas, kiti simboliai ir vieta.
- MANE Select v1.5, iš NCBI ir EMBL-EBI: transkriptas, jo egzonai ir koduojanti seka.
- GenCC ir ClinGen, išleista 2026-10-17: su kokiomis ligomis genas siejamas ir kaip stipriai.
- ACMG antrinių radinių sąrašas, SF v3.2.
- ClinVar ir GIAB stratifikacijos: žinomos ligas sukeliančios vietos ir regionai, kuriuos trumpieji skaitiniai sunkiai nustato.
- Genome in a Bottle genomo stratifikacijos iš NIST: sekoskaitos sunkumo balas.
- Žmogaus fenotipų ontologija, versija 2026-09-01: su genu susijusios savybės. Daugiau informacijos rasite hpo.jax.org.
- Duomenų išleidimas 2026.10.17-8666dff2.
Cituoti šį puslapį
Dante Labs. (be datos). KCNH2 genas: potassium voltage-gated channel subfamily H member 2. Pasiekta 2026 m. spalio 18 d., iš https://dantelabs.com/lt/genes/kcnh2
Dante Labs. KCNH2 genas: potassium voltage-gated channel subfamily H member 2 [Internetas]. [cituota 2026 m. spalio 18 d.]. Prieinama: https://dantelabs.com/lt/genes/kcnh2
Vienas testas. Atsakymai visam gyvenimui.
Nuo 449 $Nemokamas pristatymas · Rezultatai per 6–8 savaites