Geen
GABRA1
gamma-aminobutyric acid type A receptor subunit alpha1
- HGNC 4075↗(avaneb uuel vahelehel)
- Ensembli geen ENSG00000022355↗(avaneb uuel vahelehel)
- NCBI Gene 2554↗(avaneb uuel vahelehel)
Kokkuvõte
- Tsütogeneetiline asukoht
- 5q34
- Koordinaadid
- Kromosoom 5: 161 848 120–161 899 971 (GRCh38)
- Eksonid
- 10 eksonit, ulatus 51,9 kb
- Valk
- 456 aminohapet
- Tuntud ka kui
- EJM5
- MANE Select transkript
- ENST00000393943.10NM_001127644.2
- Lookuse tüüp
- Protein-coding
- Väga kõrge
- Kindel
- Madal
- Väga madal
Selle lehe andmed
Lehe aadressile saab lisada .json või päringusse application/json, et lugeda seda JSON-vormingus.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/gabra1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLoe GABRA1 ja kogu oma genoom ühe testiga.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast
Telli oma Genome TestSelle geeniga seotud kureeritud aruanne
Epilepsia (täielik paneel)
- Epilepsia
Üks 171 sellega seotud geenist
Ajuhaigus, mida iseloomustavad ebanormaalselt suurenenud neuronite aktiivsuse episoodid, mis põhjustavad ajutisi sensoorse või motoorse neuroloogilise talitlushäire või psüühilise talitlushäire episoode. Need episoodid võivad olla seotud teadvuse kaotuse või krampidega, aga ei pruugi.
- ClinGen hindab seost tasemel kindel
- 5 GenCC esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
Kuidas GABRA1 on üles ehitatud
- Kodeeriv järjestus
- Transleerimata piirkond
- Intron
- Transkriptsiooni suund
- Teadaolevad haigust põhjustavad kohad
- Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.
Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).
Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.
Eksonid moodustavad geenist 4,2 kb kogupikkusega 51,9 kb; neist 1371 alust kodeerivad valku.
Sekveneerimine: GABRA1
58
GABRA1 positsioonid, kus ClinVar liigitab muutuse patogeenseks või tõenäoliselt patogeenseks
Neist ükski ei asu piirkonnas, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.
Terve genoom katab kogu GABRA1 geeni 51,9 kb ulatuses, sealhulgas intronid, mitte ainult 4,2 kb eksoneid.
Samade haigustega seotud geenid
- AARS1alanyl-tRNA synthetase 1Jagab 1 haigust
- ABAT4-aminobutyrate aminotransferaseJagab 1 haigust
- ACTL6Bactin like 6BJagab 1 haigust
- ADAM22ADAM metallopeptidase domain 22Jagab 1 haigust
- ALDH7A1aldehyde dehydrogenase 7 family member A1Jagab 1 haigust
- ALG13ALG13 UDP-N-acetylglucosaminyltransferase subunitJagab 1 haigust
- AP3B2adaptor related protein complex 3 subunit beta 2Jagab 1 haigust
- ARHGEF9Cdc42 guanine nucleotide exchange factor 9Jagab 1 haigust
- ARV1ARV1 fatty acid homeostasis modulatorJagab 1 haigust
- ARXaristaless related homeoboxJagab 1 haigust
- ATP1A2ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 2Jagab 1 haigust
- ATP1A3ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 3Jagab 1 haigust
Geeniga GABRA1 seotud tunnused
Human Phenotype Ontology loetleb need tunnustena harvaesinevatele haigustele, mida GABRA1 võib põhjustada. Iga tunnuse lehel on loetletud teised selle tunnusega seotud geenid.
Abnormality of the nervous system
- Bilateral tonic-clonic seizure with generalized onset
- Cerebral palsy
- Degeneration of cerebrum
- EEG with focal sharp waves
- Febrile seizure (within the age range of 3 months to 6 years)
- Focal hemiclonic seizure
- Focal impaired awareness seizure
- Global developmental delay
Näita veel 65 tunnust
- Intellectual disability
- Intellectual disability, severe
- IQ between 34 and 49
- Mild global developmental delay
- Reduced cerebral white matter volume
- Subependymal nodules
- Thin corpus callosum
- EEG with polyspike wave complexes
- EEG with spike-wave complexes (2.5-3.5 Hz)
- Generalized-onset seizure
- Loss of developmental milestones
- Morning myoclonic jerks
- Progressive gait ataxia
- Repeated seizures without recovery between them
- Seizure affecting one half of brain
- Typical absence seizure
- Anxiety
- Attention deficit
- Atypical absence seizure
- Autism spectrum disorder
- Brief seizures with staring spells
- Cognitive impairment
- Complex febrile seizure
- EEG abnormality
- EEG with photoparoxysmal response
- EEG with spike-wave complexes
- Epilepsia partialis continua
- Focal aware seizure
- Generalized clonic seizure
- Generalized myoclonic seizure
- Interictal epileptiform activity
- Jerking
- Multifocal epileptiform discharges
- Myoclonic seizure
- Obsessive-compulsive trait
- Parkinsonism
- Photosensitive myoclonic seizure
- Photosensitive tonic-clonic seizure
- Slow movements
- Sudden loss of muscle tone
- Tonic seizure
- Abnormal social behavior
- Action tremor
- Depression
- Dysgenesis of the hippocampus
- EEG with focal epileptiform discharges
- EEG with generalized epileptiform discharges
- Generalized brain degeneration
- Grand mal seizures
- Impaired visuospatial constructive cognition
- Impulsivity
- Incoordination
- Low self-esteem
- Myoclonic absence seizure
- Poor fine motor coordination
- Punding
- Reading disability
- Short attention span
- Specific learning disability
- Status epilepticus without prominent motor symptoms
- Aggressive behavior
- Generalized tonic seizure
- Head jerking
- Limb myoclonus
- Epileptic encephalopathy
Välised lingid
Geenikirjed
Transkript
Valk
Kust see pärineb
- HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
- MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI andmetel: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
- GenCC ja ClinGen, väljaanne 2026-10-17: milliste haigustega geen on seotud ja kui tugevalt.
- ACMG sekundaarsete leidude loend, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-i stratifikatsioonid: teadaolevad haigusi põhjustavad kohad ning piirkonnad, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.
- Human Phenotype Ontology, väljaanne 2026-09-01: geeniga seotud tunnused. Lisateavet leiate aadressilt hpo.jax.org.
- Andmeväljaanne 2026.10.17-8666dff2.
Viita sellele lehele
Dante Labs. (n.d.). GABRA1 geen: gamma-aminobutyric acid type A receptor subunit alpha1. Vaadatud 17. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/gabra1
Dante Labs. GABRA1 geen: gamma-aminobutyric acid type A receptor subunit alpha1 [Internet]. [viidatud 17. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/gabra1
Üks test. Vastused kogu eluks.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast