Γονίδιο
POMGNT2
protein O-linked mannose N-acetylglucosaminyltransferase 2 (beta 1,4-)
- HGNC 25902↗(ανοίγει σε νέα καρτέλα)
- Γονίδιο Ensembl ENSG00000144647↗(ανοίγει σε νέα καρτέλα)
- NCBI Gene 84892↗(ανοίγει σε νέα καρτέλα)
Σύνοψη
- Κυτογενετική θέση
- 3p22.1
- Συντεταγμένες
- Χρωμόσωμα 3: 43.079.234–43.106.079 (GRCh38)
- Εξόνια
- 2 έξώνια σε 26,8 kb
- Πρωτεΐνη
- 580 αμινοξέα
- Γνωστό επίσης ως
- FLJ14566, AGO61
- Προηγούμενα σύμβολα
- C3orf39, GTDC2
- Μεταγράφημα MANE Select
- ENST00000344697.3NM_032806.6
- Τύπος locus
- Κωδικοποιητικά πρωτεΐνες
- Πολύ υψηλή
- Υψηλή
- Χαμηλή
- Πολύ χαμηλή
Αυτή η σελίδα ως δεδομένα
Προσθέστε .json στη διεύθυνση της σελίδας ή ζητήστε application/json, για να τη διαβάσετε ως JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/pomgnt2.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameΔιαβάστε το POMGNT2, και το υπόλοιπο γονιδίωμά σας, με μία εξέταση.
Από 449 $Δωρεάν αποστολή · Αποτελέσματα σε 6–8 εβδομάδες
Αποκτήστε το Genome Test σαςΕπιμελημένες αναφορές που σχετίζονται με αυτό το γονίδιο
Συγγενείς μυϊκές δυστροφίες
- Συγγενής μυϊκή δυστροφία
Ομάδα μυϊκών δυστροφιών με έναρξη κατά τη γέννηση ή στη βρεφική ηλικία, συμπεριλαμβανομένων των διστρογλυκανοπαθειών (όπως μορφές που σχετίζονται με τα FKRP, FKTN και POMT1/2).
- 3 υποβολείς του GenCC την αξιολογούν ως οριστική ή ισχυρή
Ευρύτερες ομάδες
Συγγενείς διαταραχές της γλυκοζυλίωσης
- Συγγενείς διαταραχές της γλυκοζυλίωσης (CDG)
Ένα από τα 98 γονίδια που συνδέονται με αυτό
Μια μεγάλη ομάδα κληρονομικών παθήσεων κατά τις οποίες οι αλυσίδες σακχάρων (γλυκάνες) δεν σχηματίζονται ή δεν προσδένονται σωστά στις πρωτεΐνες και στα λιπίδια, συχνά επηρεάζοντας τον εγκέφαλο, το ήπαρ, την πήξη του αίματος, την ανάπτυξη και πολλά άλλα συστήματα του οργανισμού. Οι περισσότερες είναι αυτοσωματικές υπολειπόμενες, ενώ ορισμένες είναι συνδεδεμένες με το X ή αυτοσωματικές επικρατούσες.
- Η ClinGen αξιολογεί τη σύνδεση ως οριστική
- 5 υποβολείς του GenCC την αξιολογούν ως οριστική ή ισχυρή
Πώς είναι διαταγμένο το POMGNT2
- Κωδικοποιούσα αλληλουχία
- Μη μεταφραζόμενη περιοχή
- Ιντρόνιο
- Κατεύθυνση μεταγραφής
- Γνωστές θέσεις που προκαλούν νόσο
- Περιοχές που τα σύντομα αναγνώσματα βρίσκουν δύσκολες
Εξόνια του μεταγράφηματος MANE Select του γονιδίου (έκδοση v1.5), από τα NCBI και το EMBL-EBI, στο γονιδίωμα αναφοράς GRCh38.
Ζώνες χρωμοσωμάτων από το ιδεόγραμμα GRCh38 του UCSC (2022-10-29).
Γειτονικά γονίδια από την έκδοση 116 του Ensembl, στο GRCh38.
Τα εξόνια αποτελούν 2,5 kb από τα 26,8 kb του γονιδίου· 1.743 από αυτές τις βάσεις κωδικοποιούν την πρωτεΐνη.
Αλληλούχιση POMGNT2
4Εύκολο
Πόσο δύσκολο είναι να αλληλουχηθεί το POMGNT2 με σύντομες αναγνώσεις, σε κλίμακα από 0 έως 100
0 · Εύκολο100 · Δύσκολο
Σχεδόν όλα τα εξόνια του POMGNT2 βρίσκονται σε σημεία όπου οι σύντομες αναγνώσεις αντιστοιχίζονται καθαρά.
Με ό,τι προστίθεται: το ποσοστό των εξονίων του POMGNT2 σε κάθε είδος δύσκολης περιοχής
- Δυνατότητα τοποθέτησηςΤμήματα όπου αναγνώσεις 100 ή 250 bp δεν μπορούν να τοποθετηθούν μοναδικά, οπότε μια κλήση εκεί μπορεί να λείπει ή να είναι λανθασμένη. Βάρος 100%.0%
- ΟμολογίαΤμηματικές διπλασιάσεις: αντίγραφα αλλού στο γονιδίωμα, όπως παράλογα γονίδια και ψευδογονίδια, με ταυτότητα 90% ή μεγαλύτερη. Βάρος 60%.0%
- Shared with chrYThe pseudoautosomal regions and the X-transposed region, where chrX and chrY carry the same or nearly the same sequence, so reads from either may land on the other. Βάρος 60%.0%
- Κάλυψη αναφοράςΚενά στο κοντινό τμήμα του συναρμολογημένου γονιδιώματος αναφοράς, όπου δεν υπάρχει αλληλουχία με την οποία να ευθυγραμμίζονται οι αναγνώσεις. Βάρος 50%.0%
- ΕπαναλήψειςΔιαδοχικές επαναλήψεις και σειρές από μία βάση, πάνω στις οποίες οι αναγνώσεις γλιστρούν και ίσως δεν τις καλύπτουν πλήρως. Βάρος 30%.1,3%
- Περιεκτικότητα σε GCΠαράθυρα με λιγότερο από 25% ή περισσότερο από 65% G και C, τα οποία η προετοιμασία της βιβλιοθήκης καλύπτει ελλιπώς. Βάρος 20%.18%
Βαθμολογία της Dante Labs από δική μας έρευνα, βασισμένη στους χάρτες NIST Genome in a Bottle για δύσκολα προς αλληλούχιση περιοχές.Πώς υπολογίζεταιΚάθε μπάρα είναι το ποσοστό των βάσεων των εξονίων του POMGNT2 που βρίσκονται σε αυτό το είδος δύσκολης περιοχής. Κάθε μεμονωμένο είδος μπορεί από μόνο του να κάνει ένα γονίδιο δύσκολο, και κάθε επιπλέον είδος προσθέτει λιγότερο: 0 όταν καμία βάση δεν ανήκει σε κάποιο, 100 όταν κάθε βάση βρίσκεται σε περιοχή όπου οι αναγνώσεις δεν μπορούν να τοποθετηθούν μοναδικά.
25
θέσεις στο POMGNT2 όπου το ClinVar κατατάσσει μια μεταβολή ως παθογόνες ή πιθανώς παθογόνες
Καμία από αυτές δεν βρίσκεται σε περιοχή που οι σύντομες αναγνώσεις δυσκολεύονται να καλύψουν.
Ένα πλήρες γονιδίωμα καλύπτει και τα 26,8 kb του POMGNT2, συμπεριλαμβανομένων των ιντρονίων, και όχι μόνο τα 2,5 kb των εξονίων.
ClinVar pathogenic variants (25)
The POMGNT2 variants ClinVar classifies pathogenic or likely pathogenic for any condition, reviewed by at least one submitter with criteria, and the most reviewed of them. It is ClinVar's public record of the gene, never a result.
- Παθογόνο 19
- Παθογόνο/πιθανώς παθογόνο 2
- Πιθανώς παθογόνο 4
| Παραλλαγή | Conditions | Ταξινόμηση ClinVar | Κατάσταση αξιολόγησης |
|---|---|---|---|
| NM_032806.6(POMGNT2):c.758C>T (p.Pro253Leu) (opens in a new tab) | muscular dystrophy-dystroglycanopathy (congenital with brain and eye anomalies), type a, 8 | Παθογόνο | ★★★★2 αστέρια από 4 παρέχονται κριτήρια, πολλοί υποβολείς, χωρίς συγκρούσεις |
| NM_032806.6(POMGNT2):c.1232_1233del (p.Gln411fs) (opens in a new tab) | muscular dystrophy-dystroglycanopathy (congenital with brain and eye anomalies), type a, 8 | Παθογόνο/πιθανώς παθογόνο | ★★★★2 αστέρια από 4 παρέχονται κριτήρια, πολλοί υποβολείς, χωρίς συγκρούσεις |
| NM_032806.6(POMGNT2):c.511G>A (p.Asp171Asn) (opens in a new tab) | muscular dystrophy-dystroglycanopathy (congenital with brain and eye anomalies), type a, 8 and 1 other | Παθογόνο/πιθανώς παθογόνο | ★★★★2 αστέρια από 4 παρέχονται κριτήρια, πολλοί υποβολείς, χωρίς συγκρούσεις |
| NM_032806.6(POMGNT2):c.1510del (p.Val504fs) (opens in a new tab) | muscular dystrophy-dystroglycanopathy (congenital with brain and eye anomalies), type a, 8 | Παθογόνο | ★★★★1 αστέρι από 4 παρέχονται κριτήρια, ένας υποβολέας |
| NM_032806.6(POMGNT2):c.1333C>T (p.Arg445Ter) (opens in a new tab) | muscular dystrophy-dystroglycanopathy (congenital with brain and eye anomalies), type a, 8 | Παθογόνο | ★★★★1 αστέρι από 4 παρέχονται κριτήρια, ένας υποβολέας |
| NM_032806.6(POMGNT2):c.1326G>A (p.Trp442Ter) (opens in a new tab) | muscular dystrophy-dystroglycanopathy (congenital with brain and eye anomalies), type a, 8 | Παθογόνο | ★★★★1 αστέρι από 4 παρέχονται κριτήρια, ένας υποβολέας |
| NM_032806.6(POMGNT2):c.1258del (p.Ala420fs) (opens in a new tab) | muscular dystrophy-dystroglycanopathy (congenital with brain and eye anomalies), type a, 8 | Παθογόνο | ★★★★1 αστέρι από 4 παρέχονται κριτήρια, ένας υποβολέας |
| NM_032806.6(POMGNT2):c.1232del (p.Gln411fs) (opens in a new tab) | muscular dystrophy-dystroglycanopathy (congenital with brain and eye anomalies), type a, 8 | Παθογόνο | ★★★★1 αστέρι από 4 παρέχονται κριτήρια, ένας υποβολέας |
| NM_032806.6(POMGNT2):c.1042C>T (p.Gln348Ter) (opens in a new tab) | muscular dystrophy-dystroglycanopathy (congenital with brain and eye anomalies), type a, 8 | Παθογόνο | ★★★★1 αστέρι από 4 παρέχονται κριτήρια, ένας υποβολέας |
| NM_032806.6(POMGNT2):c.1000_1003del (p.Leu334fs) (opens in a new tab) | muscular dystrophy-dystroglycanopathy (congenital with brain and eye anomalies), type a, 8 | Παθογόνο | ★★★★1 αστέρι από 4 παρέχονται κριτήρια, ένας υποβολέας |
| NM_032806.6(POMGNT2):c.851del (p.Leu284fs) (opens in a new tab) | muscular dystrophy-dystroglycanopathy (congenital with brain and eye anomalies), type a, 8 | Παθογόνο | ★★★★1 αστέρι από 4 παρέχονται κριτήρια, ένας υποβολέας |
| NM_032806.6(POMGNT2):c.820_821del (p.Lys274fs) (opens in a new tab) | muscular dystrophy-dystroglycanopathy (congenital with brain and eye anomalies), type a, 8 | Παθογόνο | ★★★★1 αστέρι από 4 παρέχονται κριτήρια, ένας υποβολέας |
| NM_032806.6(POMGNT2):c.817_818del (p.Glu273fs) (opens in a new tab) | muscular dystrophy-dystroglycanopathy (congenital with brain and eye anomalies), type a, 8 | Παθογόνο | ★★★★1 αστέρι από 4 παρέχονται κριτήρια, ένας υποβολέας |
| NM_032806.6(POMGNT2):c.745C>T (p.Gln249Ter) (opens in a new tab) | muscular dystrophy-dystroglycanopathy (congenital with brain and eye anomalies), type a, 8 | Παθογόνο | ★★★★1 αστέρι από 4 παρέχονται κριτήρια, ένας υποβολέας |
| NM_032806.6(POMGNT2):c.740_741del (p.Phe247fs) (opens in a new tab) | muscular dystrophy-dystroglycanopathy (congenital with brain and eye anomalies), type a, 8 | Παθογόνο | ★★★★1 αστέρι από 4 παρέχονται κριτήρια, ένας υποβολέας |
| NM_032806.6(POMGNT2):c.509del (p.Asp170fs) (opens in a new tab) | muscular dystrophy-dystroglycanopathy (congenital with brain and eye anomalies), type a, 8 | Παθογόνο | ★★★★1 αστέρι από 4 παρέχονται κριτήρια, ένας υποβολέας |
| NM_032806.6(POMGNT2):c.410_411delinsG (p.Ala137fs) (opens in a new tab) | muscular dystrophy-dystroglycanopathy (congenital with brain and eye anomalies), type a, 8 | Παθογόνο | ★★★★1 αστέρι από 4 παρέχονται κριτήρια, ένας υποβολέας |
| NM_032806.6(POMGNT2):c.381_382del (p.Gln128fs) (opens in a new tab) | muscular dystrophy-dystroglycanopathy (congenital with brain and eye anomalies), type a, 8 | Παθογόνο | ★★★★1 αστέρι από 4 παρέχονται κριτήρια, ένας υποβολέας |
| NM_032806.6(POMGNT2):c.248G>A (p.Trp83Ter) (opens in a new tab) | muscular dystrophy-dystroglycanopathy (congenital with brain and eye anomalies), type a, 8 | Παθογόνο | ★★★★1 αστέρι από 4 παρέχονται κριτήρια, ένας υποβολέας |
| NM_032806.6(POMGNT2):c.118C>T (p.Arg40Ter) (opens in a new tab) | muscular dystrophy-dystroglycanopathy (congenital with brain and eye anomalies), type a, 8 | Παθογόνο | ★★★★1 αστέρι από 4 παρέχονται κριτήρια, ένας υποβολέας |
| NM_032806.6(POMGNT2):c.40del (p.Val14fs) (opens in a new tab) | muscular dystrophy-dystroglycanopathy (congenital with brain and eye anomalies), type a, 8 | Παθογόνο | ★★★★1 αστέρι από 4 παρέχονται κριτήρια, ένας υποβολέας |
| NM_032806.6(POMGNT2):c.1555G>T (p.Glu519Ter) (opens in a new tab) | muscular dystrophy-dystroglycanopathy (congenital with brain and eye anomalies), type a, 8 | Πιθανώς παθογόνο | ★★★★1 αστέρι από 4 παρέχονται κριτήρια, ένας υποβολέας |
| NM_032806.6(POMGNT2):c.1264C>T (p.Gln422Ter) (opens in a new tab) | muscular dystrophy-dystroglycanopathy (congenital with brain and eye anomalies), type a, 8 and 1 other | Πιθανώς παθογόνο | ★★★★1 αστέρι από 4 παρέχονται κριτήρια, ένας υποβολέας |
| NM_032806.6(POMGNT2):c.1170T>G (p.Tyr390Ter) (opens in a new tab) | muscular dystrophy-dystroglycanopathy (congenital with brain and eye anomalies), type a, 8 | Πιθανώς παθογόνο | ★★★★1 αστέρι από 4 παρέχονται κριτήρια, ένας υποβολέας |
| NM_032806.6(POMGNT2):c.473G>A (p.Arg158His) (opens in a new tab) | muscular dystrophy-dystroglycanopathy (limb-girdle), type C, 8 | Πιθανώς παθογόνο | ★★★★1 αστέρι από 4 παρέχονται κριτήρια, ένας υποβολέας |
Γονίδια που σχετίζονται με τις ίδιες παθήσεις
- CRPPACDP-L-ribitol pyrophosphorylase AΜοιράζεται 2 παθήσεις
- DAG1dystroglycan 1Μοιράζεται 2 παθήσεις
- DPM2dolichyl-phosphate mannosyltransferase subunit 2, regulatoryΜοιράζεται 2 παθήσεις
- DPM3dolichyl-phosphate mannosyltransferase subunit 3, regulatoryΜοιράζεται 2 παθήσεις
- FKRPfukutin related proteinΜοιράζεται 2 παθήσεις
- FKTNfukutinΜοιράζεται 2 παθήσεις
- GMPPBGDP-mannose pyrophosphorylase BΜοιράζεται 2 παθήσεις
- POMGNT1protein O-linked mannose N-acetylglucosaminyltransferase 1 (beta 1,2-)Μοιράζεται 2 παθήσεις
- POMT1protein O-mannosyltransferase 1Μοιράζεται 2 παθήσεις
- POMT2protein O-mannosyltransferase 2Μοιράζεται 2 παθήσεις
- A4GALTalpha 1,4-galactosyltransferase (P1PK blood group)Μοιράζεται 1 πάθηση
- ALG1ALG1 chitobiosyldiphosphodolichol beta-mannosyltransferaseΜοιράζεται 1 πάθηση
Χαρακτηριστικά που συνδέονται με το POMGNT2
Το Human Phenotype Ontology καταγράφει αυτά ως χαρακτηριστικά των σπάνιων παθήσεων που μπορεί να προκαλέσει το POMGNT2. Η σελίδα κάθε χαρακτηριστικού εμφανίζει τα άλλα γονίδια που συνδέονται με αυτό.
Abnormality of the nervous system
- Small cerebellum
- Type II lissencephaly
- Ventriculomegaly
- Abnormal cerebellar vermis morphology
- Abnormal cortical gyration
- Abnormality of neuronal migration
- Absent reflexes
- Decreased reflex response
Εμφάνιση 12 ακόμη χαρακτηριστικών
- Fewer and broader ridges in brain
- Fewer or absent grooves in brain
- Global developmental delay
- Intellectual disability
- More grooves in brain
- Specific learning disability
- Too much cerebrospinal fluid in the brain
- Absent septum pellucidum
- Agenesis of corpus callosum
- Delayed speech and language development
- Motor delay
- Epilepsy
Abnormality of the eye
- Breakdown of light-sensitive cells in back of eye
- Chorioretinal dysplasia
- Optic atrophy
- Optic nerve issue
- Retinal detachment
- Retinal dysplasia
- Abnormally small eyeball
- Absence of eyeballs
Εμφάνιση 5 ακόμη χαρακτηριστικών
Εξωτερικοί σύνδεσμοι
Εγγραφές γονιδίου
Μεταγράφημα
Πρωτεΐνη
Από πού προέρχονται αυτά
- HGNC: το σύμβολο, το όνομα, τα άλλα σύμβολα και η θέση του γονιδίου.
- MANE Select v1.5, από NCBI και EMBL-EBI: το μεταγράφημα, τα εξόνιά του και η κωδικοποιούσα αλληλουχία.
- GenCC και ClinGen, έκδοση 2026-10-18: ποιες παθήσεις συνδέονται με το γονίδιο και πόσο ισχυρή είναι αυτή η σύνδεση.
- Η λίστα δευτερευόντων ευρημάτων του ACMG, SF v3.2.
- ClinVar και οι στρωματοποιήσεις GIAB: γνωστές θέσεις που προκαλούν νόσο, και οι περιοχές που οι βραχείες αναγνώσεις βρίσκουν δύσκολες.
- Οι στρωματοποιήσεις γονιδιώματος Genome in a Bottle, από το NIST: η βαθμολογία δυσκολίας αλληλούχισης.
- Το Human Phenotype Ontology, έκδοση 2026-09-01: τα χαρακτηριστικά που συνδέονται με το γονίδιο. Μάθετε περισσότερα στο hpo.jax.org.
- Έκδοση δεδομένων 2026.10.18-8b139e39.
Παραπομπή σε αυτή τη σελίδα
Dante Labs. (χ.η.). Γονίδιο POMGNT2: protein O-linked mannose N-acetylglucosaminyltransferase 2 (beta 1,4-). Ανάκτηση 19 Οκτωβρίου 2026, από https://dantelabs.com/el/genes/pomgnt2
Dante Labs. Γονίδιο POMGNT2: protein O-linked mannose N-acetylglucosaminyltransferase 2 (beta 1,4-) [Internet]. [ανακτήθηκε 19 Οκτωβρίου 2026]. Διαθέσιμο από: https://dantelabs.com/el/genes/pomgnt2
Ένα τεστ. Απαντήσεις για όλη τη ζωή.
Από 449 $Δωρεάν αποστολή · Αποτελέσματα σε 6–8 εβδομάδες