Genas
POMGNT2
protein O-linked mannose N-acetylglucosaminyltransferase 2 (beta 1,4-)
- HGNC 25902↗(atsidaro naujame skirtuke)
- Ensembl genas ENSG00000144647↗(atsidaro naujame skirtuke)
- NCBI Gene 84892↗(atsidaro naujame skirtuke)
Santrauka
- Citogenetinė vieta
- 3p22.1
- Koordinatės
- Chromosoma 3: 43 079 234–43 106 079 (GRCh38)
- Eksonai
- 2 eksonų per 26,8 kb
- Baltymas
- 580 aminorūgščių
- Taip pat žinomas kaip
- FLJ14566, AGO61
- Ankstesni simboliai
- C3orf39, GTDC2
- MANE Select transkriptas
- ENST00000344697.3NM_032806.6
- Lokuso tipas
- Protein-coding
- Labai aukštas
- Patikimas
- Žemas
- Labai žemas
Ši puslapis kaip duomenys
Norėdami perskaityti jį kaip JSON, pridėkite .json prie puslapio adreso arba nurodykite application/json.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/pomgnt2.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$namePerskaitykite POMGNT2 ir likusį savo genomą su vienu tyrimu.
Nuo 449 $Nemokamas pristatymas · Rezultatai per 6–8 savaites
Įsigyti savo Genome TestKuruotos ataskaitos, susijusios su šiuo genu
Įgimtos raumenų distrofijos
- Įgimta raumenų distrofija
Raumenų distrofijų grupė, pasireiškianti gimus arba kūdikystėje, įskaitant distroglikanopatijas (pvz., su FKRP, FKTN ir POMT1/2 susijusias formas).
- 3 GenCC pateikėjų vertina jį kaip definityvų arba stiprų
Platesnės grupės
Kongenitalinės glikozilinimo sutrikimai
- Kongenitalinės glikozilinimo sutrikimai (CDG)
Vienas iš 98 su juo susijusių genų
Didelė paveldimų ligų grupė, kai cukraus grandinės (glikanai) netinkamai susidaro arba netinkamai prisijungia prie baltymų ir lipidų, dažnai pažeidžiančios smegenis, kepenis, kraujo krešėjimą, augimą ir daugelį kitų organų sistemų. Dauguma yra autosominiu recesyviniu būdu paveldimi, tačiau kai kurios yra X chromosomos susietos arba autosominiu dominantiniu būdu paveldimos.
- ClinGen vertina ryšį kaip definityvų
- 5 GenCC pateikėjų vertina jį kaip definityvų arba stiprų
Kaip išdėstytas POMGNT2
- Koduojanti seka
- Netransliuojama sritis
- Intronas
- Transkripcijos kryptis
- Žinomos su liga susijusios vietos
- Ruožai, kuriuos trumpi skaitiniai sunkiai aptinka
Geno MANE Select transkripto eksonai (išleidimas v1.5), pagal NCBI ir EMBL-EBI, GRCh38 atskaitos genome.
Chromosomų juostos pagal UCSC GRCh38 ideogramą (2022-10-29).
Netoliese esantys genai iš Ensembl leidimo 116, GRCh38.
Eksonai sudaro 2,5 kb iš 26,8 kb geno; 1 743 šių bazių koduoja baltymą.
Sekvenavimas: POMGNT2
25
vietos geno POMGNT2 sekoje, kuriose ClinVar pakitimus klasifikuoja kaip patogeninius arba tikriausiai patogeninius
Nė viena iš jų nepatenka į sritį, kurioje trumpais skaitiniais sunku nustatyti.
Viso genomo sekvenavimas apima visus 26,8 kb geno POMGNT2, įskaitant intronus, o ne tik 2,5 kb eksonų.
Genai, susieti su tomis pačiomis būklėmis
- CRPPACDP-L-ribitol pyrophosphorylase ATuri 2 bendrų būklių
- DAG1dystroglycan 1Turi 2 bendrų būklių
- DPM2dolichyl-phosphate mannosyltransferase subunit 2, regulatoryTuri 2 bendrų būklių
- DPM3dolichyl-phosphate mannosyltransferase subunit 3, regulatoryTuri 2 bendrų būklių
- FKRPfukutin related proteinTuri 2 bendrų būklių
- FKTNfukutinTuri 2 bendrų būklių
- GMPPBGDP-mannose pyrophosphorylase BTuri 2 bendrų būklių
- POMGNT1protein O-linked mannose N-acetylglucosaminyltransferase 1 (beta 1,2-)Turi 2 bendrų būklių
- POMT1protein O-mannosyltransferase 1Turi 2 bendrų būklių
- POMT2protein O-mannosyltransferase 2Turi 2 bendrų būklių
- A4GALTalpha 1,4-galactosyltransferase (P1PK blood group)Turi 1 bendrą būklę
- ALG1ALG1 chitobiosyldiphosphodolichol beta-mannosyltransferaseTuri 1 bendrą būklę
Savybės, susijusios su POMGNT2
Žmogaus fenotipų ontologija šias savybes nurodo kaip retų ligų, kurias gali sukelti POMGNT2, požymius. Kiekvienos savybės puslapyje nurodyti kiti su ja susiję genai.
Abnormality of the nervous system
- Small cerebellum
- Type II lissencephaly
- Ventriculomegaly
- Abnormal cerebellar vermis morphology
- Abnormal cortical gyration
- Abnormality of neuronal migration
- Absent reflexes
- Decreased reflex response
Rodyti dar 12 savybių
- Fewer and broader ridges in brain
- Fewer or absent grooves in brain
- Global developmental delay
- Intellectual disability
- More grooves in brain
- Specific learning disability
- Too much cerebrospinal fluid in the brain
- Absent septum pellucidum
- Agenesis of corpus callosum
- Delayed speech and language development
- Motor delay
- Epilepsy
Išorinės nuorodos
Geno įrašai
Transkriptas
Baltymas
Iš kur tai
- HGNC: geno simbolis, pavadinimas, kiti simboliai ir vieta.
- MANE Select v1.5, iš NCBI ir EMBL-EBI: transkriptas, jo eksonai ir koduojanti seka.
- GenCC ir ClinGen, išleista 2026-10-17: kokioms būklėms genas susijęs ir kaip stipriai.
- ACMG antrinių radinių sąrašas, SF v3.2.
- ClinVar ir GIAB stratifikacijos: žinomos ligas sukeliančios vietos ir sritys, kurias trumpieji skaitiniai sunkiai nustato.
- Žmogaus fenotipų ontologija, versija 2026-09-01: su genu susijusios savybės. Daugiau informacijos rasite hpo.jax.org.
- Duomenų išleidimas 2026.10.17-8666dff2.
Cituoti šį puslapį
Dante Labs. (be datos). POMGNT2 genas: protein O-linked mannose N-acetylglucosaminyltransferase 2 (beta 1,4-). Pasiekta 2026 m. spalio 17 d., iš https://dantelabs.com/lt/genes/pomgnt2
Dante Labs. POMGNT2 genas: protein O-linked mannose N-acetylglucosaminyltransferase 2 (beta 1,4-) [Internetas]. [cituota 2026 m. spalio 17 d.]. Prieinama: https://dantelabs.com/lt/genes/pomgnt2
Vienas testas. Atsakymai visam gyvenimui.
Nuo 449 $Nemokamas pristatymas · Rezultatai per 6–8 savaites