Γονίδιο
PMS2
PMS1 homolog 2, mismatch repair system component
- HGNC 9122↗(ανοίγει σε νέα καρτέλα)
- Γονίδιο Ensembl ENSG00000122512↗(ανοίγει σε νέα καρτέλα)
- NCBI Gene 5395↗(ανοίγει σε νέα καρτέλα)
Σύνοψη
- Κυτογενετική θέση
- 7p22.1
- Συντεταγμένες
- Χρωμόσωμα 7: 5.970.925–6.009.049 (GRCh38)
- Εξόνια
- 15 έξώνια σε 38,1 kb
- Πρωτεΐνη
- 862 αμινοξέα
- Κληρονομικότητα
- Αυτοσωμικός επικρατής Αυτοσωμικός υπολειπόμενος
- Γνωστό επίσης ως
- H_DJ0042M02.9, HNPCC4, MLH4, PMS-2
- Προηγούμενα σύμβολα
- PMSL2
- Μεταγράφημα MANE Select
- ENST00000265849.12NM_000535.7
- Τύπος locus
- gene with protein product
- Πολύ υψηλή
- Υψηλή
- Χαμηλή
- Πολύ χαμηλή
Γονιδίωμα αναφοράςGRCh38hg38
Οι θέσεις στις σελίδες γονιδίων και παραλλαγών ακολουθούν αυτή την επιλογή, σε αυτό το πρόγραμμα περιήγησης.
Διαβάστε το PMS2, και το υπόλοιπο γονιδίωμά σας, με μία εξέταση.
Από 449 $Δωρεάν αποστολή · Αποτελέσματα σε 6–8 εβδομάδες
Αποκτήστε το Genome Test σαςΕπιμελημένες αναφορές που σχετίζονται με αυτό το γονίδιο
Νόσος Επιδιόρθωσης του DNA
- Αυτοσωμικός υπολειπόμενος
Νόσος που έχει ως βάση τη διαταραχή της επιδιόρθωσης του DNA.
- Το ClinGen κατατάσσει τη σύνδεση ως οριστική
- 3 υποβολείς GenCC την κατατάσσουν ως οριστική ή ισχυρή
Σύνδρομο Lynch
- Αυτοσωμικός επικρατής
Κληρονομικό σύνδρομο καρκίνου του παχέος εντέρου χωρίς πολύποδες, που οφείλεται σε γερμινικές βλάβες του μηχανισμού επιδιόρθωσης σφαλμάτων (mismatch repair), με καρκίνους του παχέος εντέρου, του ενδομητρίου και άλλων οργάνων σε πρώιμη ηλικία.
- Το ClinGen κατατάσσει τη σύνδεση ως οριστική
- 4 υποβολείς GenCC την κατατάσσουν ως οριστική ή ισχυρή
- Στη λίστα δευτερευουσών ευρημάτων του ACMG
Τι αλλάζει με τη γνώση
Ενισχυμένη παρακολούθηση με κολονοσκόπηση, χημειοπροφύλαξη με ασπιρίνη, αναστολείς ανοσολογικών σημείων ελέγχου για όγκους με MSI-high, έλεγχος συγγενών (cascade testing), γυναικολογική χειρουργική επέμβαση μείωσης κινδύνου
Κληρονομικότητα
- Αυτοσωμικός επικρατής
- Ένα μεταλλαγμένο αντίγραφο, από οποιονδήποτε γονέα, αρκεί. Ένας γονέας που το έχει το μεταβιβάζει σε κάθε παιδί με πιθανότητα ένα προς δύο.
- Αυτοσωμικός υπολειπόμενος
- Απαιτείται ένα μεταλλαγμένο αντίγραφο από κάθε γονέα. Με ένα μόνο, είστε φορέας και συνήθως δεν επηρεάζεστε· όταν και οι δύο γονείς είναι φορείς, κάθε παιδί έχει πιθανότητα ένα προς τέσσερα να κληρονομήσει δύο.
Πώς είναι διαταγμένο το PMS2
- Κωδικοποιούσα αλληλουχία
- Μη μεταφραζόμενη περιοχή
- Ιντρόνιο
- Κατεύθυνση μεταγραφής
- Γνωστές θέσεις που προκαλούν νόσο
- Περιοχές που τα σύντομα αναγνώσματα βρίσκουν δύσκολες
- Παραλλαγές με σελίδα
Εξόνια του μεταγράφηματος MANE Select του γονιδίου (έκδοση v1.5), από τα NCBI και το EMBL-EBI, στο γονιδίωμα αναφοράς GRCh38.
Ζώνες χρωμοσωμάτων από το ιδεόγραμμα GRCh38 του UCSC (2022-10-29).
Γειτονικά γονίδια από την έκδοση 116 του Ensembl, στο GRCh38.
Τα εξόνια αποτελούν 5,1 kb από τα 38,1 kb του γονιδίου· 2.589 από αυτές τις βάσεις κωδικοποιούν την πρωτεΐνη.
Πώς διαβάζει ένα τεστ γονιδιώματος το PMS2
643
θέσεις στο PMS2 όπου το ClinVar κατατάσσει μια μεταβολή ως παθογόνο ή πιθανώς παθογόνο
Από αυτές, 483 (75%) βρίσκονται σε περιοχές που τα σύντομα αναγνώσματα βρίσκουν δύσκολες.
- Low mappability (273 θέσεις)Regions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely.
- Segmental duplications (483 θέσεις)Copies of at least 1 kb sharing at least 90% identity with another part of the genome (paralogues, pseudogenes); reads may align to the wrong copy.
Η ολόκληρη γονιδιωματική ανάλυση καλύπτει και τα 38,1 kb του PMS2, συμπεριλαμβανομένων των ιντρονίων, και όχι μόνο τα 5,1 kb των εξονίων.
Παραλλαγές με σελίδα (166)
Οι παραλλαγές του PMS2 με σελίδα εδώ, με τα περισσότερα αστέρια αξιολόγησης πρώτα. Κάθε σελίδα περιγράφει το δημόσιο αρχείο της ClinVar για την παραλλαγή, ποτέ ένα αποτέλεσμα.
| Παραλλαγή | Εξόνιο ή ιντρόνιο | Θέση (GRCh38) | Ταξινόμηση ClinVar | Κατάσταση αξιολόγησης |
|---|---|---|---|---|
| c.1A>G | Εξόνιο 1 | 6.009.019 | Πιθανώς παθογόνο | ★★★★3 αστέρια από 4 ελέγχθηκε από ομάδα εμπειρογνωμόνων |
| c.24-12_107delinsAAAT | Εξόνιο 2 | 6.005.948 | Παθογόνο | ★★★★3 αστέρια από 4 ελέγχθηκε από ομάδα εμπειρογνωμόνων |
| c.163+2T>C | Ιντρόνιο 2 | 6.005.890 | Πιθανώς παθογόνο | ★★★★3 αστέρια από 4 ελέγχθηκε από ομάδα εμπειρογνωμόνων |
| c.164-2A>G | Ιντρόνιο 2 | 6.004.060 | Πιθανώς παθογόνο | ★★★★3 αστέρια από 4 ελέγχθηκε από ομάδα εμπειρογνωμόνων |
| c.164-518_803+252delinsCG | Ιντρόνιο 7 | 5.997.074 | Παθογόνο | ★★★★3 αστέρια από 4 ελέγχθηκε από ομάδα εμπειρογνωμόνων |
| c.251-2A>G | Ιντρόνιο 3 | 6.003.794 | Πιθανώς παθογόνο | ★★★★3 αστέρια από 4 ελέγχθηκε από ομάδα εμπειρογνωμόνων |
| c.538-478_705+456del | Ιντρόνιο 6 | 5.998.651 | Παθογόνο | ★★★★3 αστέρια από 4 ελέγχθηκε από ομάδα εμπειρογνωμόνων |
| c.705+1G>T | Ιντρόνιο 6 | 5.999.107 | Πιθανώς παθογόνο | ★★★★3 αστέρια από 4 ελέγχθηκε από ομάδα εμπειρογνωμόνων |
| c.989-2A>G | Ιντρόνιο 9 | 5.989.957 | Πιθανώς παθογόνο | ★★★★3 αστέρια από 4 ελέγχθηκε από ομάδα εμπειρογνωμόνων |
| c.989-296_1144+706del | Ιντρόνιο 10 | 5.989.093 | Παθογόνο | ★★★★3 αστέρια από 4 ελέγχθηκε από ομάδα εμπειρογνωμόνων |
Γονίδια που σχετίζονται με τις ίδιες παθήσεις
- MLH1mutL homolog 1Μοιράζεται 2 παθήσεις
- MSH2mutS homolog 2Μοιράζεται 2 παθήσεις
- MSH6mutS homolog 6Μοιράζεται 2 παθήσεις
- APTXaprataxinΜοιράζεται 1 πάθηση
- BRCA1BRCA1 DNA repair associatedΜοιράζεται 1 πάθηση
- BRCA2BRCA2 DNA repair associatedΜοιράζεται 1 πάθηση
- BRIP1BRCA1 interacting DNA helicase 1Μοιράζεται 1 πάθηση
- COA7cytochrome c oxidase assembly factor 7Μοιράζεται 1 πάθηση
- DCLRE1CDNA cross-link repair 1CΜοιράζεται 1 πάθηση
- DDB2damage specific DNA binding protein 2Μοιράζεται 1 πάθηση
- EPCAMepithelial cell adhesion moleculeΜοιράζεται 1 πάθηση
- ERCC1ERCC excision repair 1, endonuclease non-catalytic subunitΜοιράζεται 1 πάθηση
Χαρακτηριστικά που συνδέονται με το PMS2
Το Human Phenotype Ontology καταγράφει αυτά ως χαρακτηριστικά των σπάνιων παθήσεων που μπορεί να προκαλέσει το PMS2. Η σελίδα κάθε χαρακτηριστικού εμφανίζει τα άλλα γονίδια που συνδέονται με αυτό.
Abnormality of the nervous system
- Agenesis of corpus callosum
- Glioblastoma multiforme
- Anxiety
- Astrocytoma
- Attention deficit
- Behavioral abnormality
- Depression
- Epilepsy
Εμφάνιση 18 ακόμη χαρακτηριστικών
- Gray matter heterotopia
- Irritability
- Migraine
- Rise in pressure inside skull
- Abnormal gait
- Abnormal pyramidal sign
- Abnormal speech pattern
- Benign neoplasm of the central nervous system
- Cancer of early nerve cells
- Difficulty articulating speech
- Disorder of involuntary muscle movements
- Disturbed sensory perception
- Dysgraphia
- Hallucinations
- Loss of developmental milestones
- Memory impairment
- Paralysis or weakness of one side of body
- Pins and needles feeling
Εξωτερικοί σύνδεσμοι
Εγγραφές γονιδίου
Μεταγράφημα
Πρωτεΐνη
Από πού προέρχονται τα στοιχεία
- HGNC: το σύμβολο, το όνομα, τα άλλα σύμβολα και η θέση του γονιδίου.
- MANE Select v1.5, από το NCBI και το EMBL-EBI: το μεταγράφημα, τα εξόνια και η κωδικοποιούσα αλληλουχία.
- GenCC και ClinGen, έκδοση 2026-10-16: ποιες παθήσεις σχετίζονται με το γονίδιο και πόσο ισχυρή είναι η σχέση.
- Ο κατάλογος δευτερευόντων ευρημάτων του ACMG, SF v3.2.
- ClinVar και οι στρωματοποιήσεις GIAB: γνωστές θέσεις που προκαλούν νόσο και περιοχές που δυσκολεύουν τις αναγνώσεις μικρού μήκους.
- Το Human Phenotype Ontology, έκδοση 2026-09-01: τα χαρακτηριστικά που συνδέονται με το γονίδιο. Μάθετε περισσότερα στο hpo.jax.org.
- Έκδοση δεδομένων 2026.10.16-c6eea6bf.
Παραπομπή σε αυτή τη σελίδα
Dante Labs. (χ.η.). Γονίδιο PMS2: PMS1 homolog 2, mismatch repair system component. Ανάκτηση 17 Οκτωβρίου 2026, από https://dantelabs.com/el/genes/pms2
Dante Labs. Γονίδιο PMS2: PMS1 homolog 2, mismatch repair system component [Internet]. [ανακτήθηκε 17 Οκτωβρίου 2026]. Διαθέσιμο από: https://dantelabs.com/el/genes/pms2
Ένα τεστ. Απαντήσεις για όλη τη ζωή.
Από 449 $Δωρεάν αποστολή · Αποτελέσματα σε 6–8 εβδομάδες