Gen
THOC2
THO complex subunit 2
- HGNC 19073↗(otevře se na nové kartě)
- Gen v Ensembl ENSG00000125676↗(otevře se na nové kartě)
- NCBI Gene 57187↗(otevře se na nové kartě)
Shrnutí
- Cytogenetická poloha
- Xq25
- Souřadnice
- Chromozom X: 123 600 569–123 733 052 (GRCh38)
- Exony
- 39 exonů na 132,5 kb
- Protein
- 1 593 aminokyselin
- Další názvy
- THO2, dJ506G2.1
- Předchozí symboly
- CXorf3, MRX12, MRX35
- Transkript MANE Select
- ENST00000245838.13NM_001081550.2
- Typ lokusu
- Kódující proteiny
- Velmi vysoká
- Jistá
- Nízká
- Velmi nízká
Tato stránka jako data
Chcete-li ji číst jako JSON, připojte k adrese stránky .json nebo požádejte o application/json.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/thoc2.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$namePřečtěte si THOC2 i zbytek svého genomu jediným testem.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů
Objednejte si Genome TestKurátorované reporty související s tímto genem
Epilepsy (Full Panel)
- X-Linked Complex Neurodevelopmental Disorder
A complex neurodevelopmental disorder that is transmitted via X-linked inheritance, and is characterized by intellectual disability, autism and epilepsy.
- ClinGen hodnotí souvislost jako definitivní
- 1 hodnotitel GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
Širší skupiny
Intellectual Disability
Jeden z 233 genů spojených s touto vazbou
- 3 hodnotitelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
Jak je THOC2 uspořádán
- Kódující sekvence
- Netranslatovaná oblast
- Intron
- Směr transkripce
- Známá místa způsobující onemocnění
- Úseky, které krátká čtení obtížně zachycují
Exony transkriptu MANE Select genu (verze v1.5) z databází NCBI a EMBL-EBI, na referenčním genomu GRCh38.
Pásy chromozomů z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Okolní geny z Ensembl, verze 116, na GRCh38.
Exony tvoří 5,6 kb z 132,5 kb genu; 4 782 těchto bází kódují protein.
Sekvenování THOC2
1Nízká
Jak obtížně se THOC2 sekvenuje krátkými čteními, ze 100Každý sloupec udává podíl exonových bází THOC2 v dané obtížné oblasti. Skóre je váží podle toho, jak moc každá z nich ztěžuje volání krátkými čteními: 0, pokud žádná báze není v žádné takové oblasti, 100, pokud je každá báze ve všech těchto oblastech.
- MapovatelnostÚseky, kde nelze čtení o délce 100 nebo 250 bp jednoznačně umístit, takže volání v nich může chybět nebo být chybné. Váha 35 %.0 %
- HomologieSegmentální duplikace: kopie jinde v genomu, například paralogy a pseudogeny, s identitou 90 % nebo vyšší. Váha 30 %.0 %
- RepeticeTandemové repetice a řetězce jedné báze, na kterých čtení sklouzávají a které nemusí přesahovat. Váha 15 %.4,1 %
- Obsah GCÚseky s obsahem G a C pod 25 % nebo nad 65 %, které příprava knihovny pokrývá jen slabě. Váha 10 %.5,3 %
- Pokrytí referenceMezery v okolní referenční sestavě, kam se krátké čtené úseky nemají kam zarovnat. Váha 10 %.0 %
7
pozic v THOC2, kde ClinVar zařazuje změnu jako patogenní nebo pravděpodobně patogenní
Žádná z nich neleží v oblasti, kterou krátká čtení obtížně zachycují.
Celé genomové sekvenování pokrývá všech 132,5 kb genu THOC2, včetně intronů, nejen 5,6 kb exonů.
Geny spojené se stejnými onemocněními
- ARHGEF9Cdc42 guanine nucleotide exchange factor 9Sdílí 2 onemocnění
- CLCN4Cl-/H+ antiporter 4Sdílí 2 onemocnění
- CNKSR2connector enhancer of kinase suppressor of Ras 2Sdílí 2 onemocnění
- FRMPD4FERM and PDZ domain containing 4Sdílí 2 onemocnění
- FTSJ1FtsJ RNA 2'-O-methyltransferase 1Sdílí 2 onemocnění
- GRIA3glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 3Sdílí 2 onemocnění
- HNRNPH2heterogeneous nuclear ribonucleoprotein H2Sdílí 2 onemocnění
- IL1RAPL1interleukin 1 receptor accessory protein like 1Sdílí 2 onemocnění
- IQSEC2IQ motif and Sec7 domain ArfGEF 2Sdílí 2 onemocnění
- KDM5Clysine demethylase 5CSdílí 2 onemocnění
- NEXMIFneurite extension and migration factorSdílí 2 onemocnění
- PAK3p21 (RAC1) activated kinase 3Sdílí 2 onemocnění
Rysy spojené s THOC2
Human Phenotype Ontology uvádí tyto rysy jako příznaky vzácných onemocnění, která může způsobit THOC2. Na stránce každého rysu najdete další geny, které jsou s ním spojené.
Abnormality of the nervous system
- Delayed speech and language development
- Intellectual disability
- Abnormal cerebral white matter morphology
- Abnormal gait
- Behavioral abnormality
- Intellectual disability, mild
- IQ between 34 and 49
- Tremor
Zobrazit ještě 15 rysů
Abnormality of head or neck
- Big calvaria
- Depressed nasal bridge
- Little lower jaw
- Nasal tip, upturned
- Short columella
- Abnormally small head
- High palate
- Broad forehead
Zobrazit ještě 2 rysů
Externí odkazy
Záznamy o genu
Transkript
Protein
Odkud to pochází
- HGNC: symbol genu, jeho název, další symboly a umístění.
- MANE Select v1.5 od NCBI a EMBL-EBI: transkript, jeho exony a kódující sekvence.
- GenCC a ClinGen, vydání 2026-10-17: se kterými stavy je gen spojen a jak silně.
- Seznam ACMG pro sekundární nálezy, SF v3.2.
- ClinVar a stratifikace GIAB: známá místa způsobující onemocnění a oblasti, které krátká čtení obtížně zvládají.
- Stratifikace genomu Genome in a Bottle od NIST: skóre obtížnosti sekvenování.
- Human Phenotype Ontology, verze 2026-09-01: rysy spojené s tímto genem. Více informací najdete na hpo.jax.org.
- Vydání dat 2026.10.18-e609d43e.
Citovat tuto stránku
Dante Labs. (b.d.). Gen THOC2: THO complex subunit 2. Staženo 18. října 2026, z https://dantelabs.com/cs/genes/thoc2
Dante Labs. Gen THOC2: THO complex subunit 2 [Internet]. [citováno 18. října 2026]. Dostupné z: https://dantelabs.com/cs/genes/thoc2
Jeden test. Odpovědi na celý život.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů