Přejít na obsah
Použijte své prostředky HSA nebo FSA
Zosekvenujte si svůj genom (otevře se na nové kartě)

Gen

SPOP

speckle type BTB/POZ protein

Shrnutí

Cytogenetická poloha
17q21.33
Souřadnice
Chromozom 17: 49 598 884–49 678 097 (GRCh38)
Exony
10 exonů na 79,2 kb
Protein
374 aminokyselin
Další názvy
TEF2, BTBD32
Transkript MANE Select
ENST00000504102.6NM_001007228.2
Typ lokusu
Protein-coding
  • Velmi vysoká
  • Jistá
  • Nízká
  • Velmi nízká

Kurátorované reporty související s tímto genem

Zatím žádná zpráva Genome Test nečte gen SPOP. Test sekvenuje celý váš genom, takže jsou vaše data přesto obsahují.

Jak je SPOP uspořádán

  • Kódující sekvence
  • Netranslatovaná oblast
  • Intron
  • Směr transkripce
  • Známá místa způsobující onemocnění
  • Úseky, které krátká čtení obtížně zachycují
Chromozom 17, se závorkou u SPOP. SPOP a 18 genů poblíž na chromozomu 17, od 49 138 491 do 50 138 490.Chromozom 1717q21.33p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.349,2 Mb49,4 Mb49,6 Mb49,8 Mb50 MbB4GALNT2: 49 132 460–49 178 647, řetězec dopřednémB4GALNT2GNGT2: 49 202 791–49 210 610, řetězec zpětnémGNGT2ABI3: 49 210 388–49 224 184, řetězec dopřednémABI3PHOSPHO1: 49 223 346–49 230 831, řetězec zpětnémPHOSPHO1ZNF652: 49 289 206–49 362 473, řetězec zpětnémZNF652PHB1: 49 404 009–49 436 245, řetězec zpětnémPHB1NGFR: 49 495 286–49 515 020, řetězec dopřednémNGFRNXPH3: 49 575 716–49 583 827, řetězec dopřednémNXPH3SPOP: 49 598 884–49 678 097, řetězec zpětnémSPOPSLC35B1: 49 682 022–49 709 014, řetězec zpětnémSLC35B1FAM117A: 49 710 332–49 789 180, řetězec zpětnémFAM117AKAT7: 49 788 624–49 835 026, řetězec dopřednémKAT7TAC4: 49 838 300–49 848 071, řetězec zpětnémTAC4DLX4: 49 968 588–49 974 959, řetězec dopřednémDLX4DLX3: 49 990 005–49 995 224, řetězec zpětnémDLX3ITGA3: 50 055 968–50 090 933, řetězec dopřednémITGA3PDK2: 50 094 737–50 120 276, řetězec dopřednémPDK2SAMD14: 50 110 040–50 130 160, řetězec zpětnémSAMD14PPP1R9B: 50 133 732–50 151 020, řetězec zpětnémPPP1R9BSchéma SPOP: 10 exonů na zpětném řetězci chromozomu 17Exon 5: 5 známých míst způsobujících onemocněníExon 4: 4 známých míst způsobujících onemocněníExon 2: 1 známé místo způsobující onemocněníExon 10: 49 598 884–49 600 522, 1 639 bázíExon 9: 49 601 865–49 602 007, 143 bázíExon 8: 49 607 250–49 607 372, 123 bázíExon 7: 49 607 874–49 607 929, 56 bázíExon 6: 49 611 280–49 611 457, 178 bázíExon 5: 49 618 981–49 619 108, 128 bázíExon 4: 49 619 234–49 619 385, 152 bázíExon 3: 49 621 946–49 622 067, 122 bázíExon 2: 49 622 733–49 622 876, 144 bázíExon 1: 49 677 933–49 678 097, 165 bází10864215′3′

Exony transkriptu MANE Select genu (verze v1.5) z databází NCBI a EMBL-EBI, na referenčním genomu GRCh38.

Pásy chromozomů z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Okolní geny z Ensembl, verze 116, na GRCh38.

Exony tvoří 2,9 kb z 79,2 kb genu; 1 125 těchto bází kódují protein.

Sekvenování SPOP

10

pozic v SPOP, kde ClinVar zařazuje změnu jako patogenní nebo pravděpodobně patogenní

Žádná z nich nespadá do oblasti, kterou krátká čtení těžko zachytí.

Sekvenování celého genomu pokrývá všech 79,2 kb genu SPOP, včetně intronů, nikoli jen 2,9 kb exonů.

Rysy spojené s SPOP

Human Phenotype Ontology uvádí tyto rysy jako příznaky vzácných onemocnění, která může způsobit SPOP. Na stránce každého rysu najdete další geny, které jsou s ním spojené.

Externí odkazy

Odkud údaje pocházejí

  • HGNC: symbol genu, název, další symboly a umístění.
  • MANE Select v1.5, z NCBI a EMBL-EBI: transkript, jeho exony a kódující sekvence.
  • ClinVar a stratifikace GIAB: známá místa způsobující onemocnění a oblasti, které krátká čtení obtížně zachycují.
  • Human Phenotype Ontology, verze 2026-09-01: rysy spojené s tímto genem. Více informací najdete na hpo.jax.org.
  • Vydání dat 2026.10.17-8666dff2.

Citovat tuto stránku

APA

Dante Labs. (b.d.). Gen SPOP: speckle type BTB/POZ protein. Staženo 17. října 2026, z https://dantelabs.com/cs/genes/spop

Vancouver

Dante Labs. Gen SPOP: speckle type BTB/POZ protein [Internet]. [citováno 17. října 2026]. Dostupné z: https://dantelabs.com/cs/genes/spop

Jeden test. Odpovědi na celý život.

Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů

Objednejte si Genome Test