Pereiti prie turinio
Naudokite savo HSA ar FSA lėšas

Genas

SPOP

speckle type BTB/POZ protein

Santrauka

Citogenetinė vieta
17q21.33
Koordinatės
Chromosoma 17: 49 598 884–49 678 097 (GRCh38)
Eksonai
10 eksonų per 79,2 kb
Baltymas
374 aminorūgščių
Taip pat žinomas kaip
TEF2, BTBD32
MANE Select transkriptas
ENST00000504102.6NM_001007228.2
Lokuso tipas
gene with protein product
  • Labai aukštas
  • Patikimas
  • Žemas
  • Labai žemas

Atskaitos genomasGRCh38

Pozicijos genų ir variantų puslapiuose rodomos pagal šį pasirinkimą šioje naršyklėje.

Kuruotos ataskaitos, susijusios su šiuo genu

Nė viena Genome Test ataskaita dar nenuskaito SPOP geno. Testas seka visą jūsų genomą, todėl jūsų duomenyse jis vis tiek yra.

Kaip išdėstytas SPOP

  • Koduojanti seka
  • Netransliuojama sritis
  • Intronas
  • Transkripcijos kryptis
  • Žinomos su liga susijusios vietos
  • Ruožai, kuriuos trumpi skaitiniai sunkiai aptinka
Chromosoma 17, su skliaustu, kur yra SPOP. SPOP ir dar 18 genų šalia jo chromosomoje 17, nuo 49 138 491 iki 50 138 490.Chromosoma 1717q21.33p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.349,2 Mb49,4 Mb49,6 Mb49,8 Mb50 MbB4GALNT2: 49 132 460–49 178 647, tiesioginė grandinėB4GALNT2GNGT2: 49 202 791–49 210 610, atvirkštinė grandinėGNGT2ABI3: 49 210 388–49 224 184, tiesioginė grandinėABI3PHOSPHO1: 49 223 346–49 230 831, atvirkštinė grandinėPHOSPHO1ZNF652: 49 289 206–49 362 473, atvirkštinė grandinėZNF652PHB1: 49 404 009–49 436 245, atvirkštinė grandinėPHB1NGFR: 49 495 286–49 515 020, tiesioginė grandinėNGFRNXPH3: 49 575 716–49 583 827, tiesioginė grandinėNXPH3SPOP: 49 598 884–49 678 097, atvirkštinė grandinėSPOPSLC35B1: 49 682 022–49 709 014, atvirkštinė grandinėSLC35B1FAM117A: 49 710 332–49 789 180, atvirkštinė grandinėFAM117AKAT7: 49 788 624–49 835 026, tiesioginė grandinėKAT7TAC4: 49 838 300–49 848 071, atvirkštinė grandinėTAC4DLX4: 49 968 588–49 974 959, tiesioginė grandinėDLX4DLX3: 49 990 005–49 995 224, atvirkštinė grandinėDLX3ITGA3: 50 055 968–50 090 933, tiesioginė grandinėITGA3PDK2: 50 094 737–50 120 276, tiesioginė grandinėPDK2SAMD14: 50 110 040–50 130 160, atvirkštinė grandinėSAMD14PPP1R9B: 50 133 732–50 151 020, atvirkštinė grandinėPPP1R9BSPOP diagrama: 10 eksonų, chromosoma 17, atvirkštinė grandisEkson 5: 5 žinomų su liga susijusių vietųEkson 4: 4 žinomų su liga susijusių vietųEkson 2: 1 žinoma su liga susijusi vietaEksonas 10: 49 598 884–49 600 522, 1 639 baziųEksonas 9: 49 601 865–49 602 007, 143 baziųEksonas 8: 49 607 250–49 607 372, 123 baziųEksonas 7: 49 607 874–49 607 929, 56 baziųEksonas 6: 49 611 280–49 611 457, 178 baziųEksonas 5: 49 618 981–49 619 108, 128 baziųEksonas 4: 49 619 234–49 619 385, 152 baziųEksonas 3: 49 621 946–49 622 067, 122 baziųEksonas 2: 49 622 733–49 622 876, 144 baziųEksonas 1: 49 677 933–49 678 097, 165 bazių10864215′3′

Geno MANE Select transkripto eksonai (išleidimas v1.5), pagal NCBI ir EMBL-EBI, GRCh38 atskaitos genome.

Chromosomų juostos pagal UCSC GRCh38 ideogramą (2022-10-29).

Netoliese esantys genai iš Ensembl leidimo 116, GRCh38.

Eksonai sudaro 2,9 kb iš 79,2 kb geno; 1 125 šių bazių koduoja baltymą.

Kaip genomo tyrimas nuskaito SPOP

10

SPOP geno pozicijų, kuriose ClinVar pakitimą klasifikuoja kaip patogeninį arba tikriausiai patogeninį

Nė viena iš jų nepatenka į sritį, kurią trumpi skaitiniai sunkiai aptinka.

Viso genomo sekvenavimas apima visus 79,2 kb SPOP geno, įskaitant intronus, o ne tik 2,9 kb eksonų.

Iš kur tai

  • HGNC: geno simbolis, pavadinimas, kiti simboliai ir vieta.
  • MANE Select v1.5, iš NCBI ir EMBL-EBI: transkriptas, jo eksonai ir koduojanti seka.
  • ClinVar ir GIAB stratifikacijos: žinomos ligas sukeliančios vietos ir sritys, kurias trumpieji skaitiniai sunkiai nustato.
  • Žmogaus fenotipų ontologija, versija 2026-09-01: su genu susijusios savybės. Daugiau informacijos rasite hpo.jax.org.
  • Duomenų išleidimas 2026.10.16-c6eea6bf.

Cituoti šį puslapį

APA

Dante Labs. (be datos). SPOP genas: speckle type BTB/POZ protein. Pasiekta 2026 m. spalio 17 d., iš https://dantelabs.com/lt/genes/spop

Vancouver

Dante Labs. SPOP genas: speckle type BTB/POZ protein [Internetas]. [cituota 2026 m. spalio 17 d.]. Prieinama: https://dantelabs.com/lt/genes/spop

Vienas testas. Atsakymai visam gyvenimui.

Nuo 449 $Nemokamas pristatymas · Rezultatai per 6–8 savaites

Įsigyti savo Genome Test