Przejdź do treści
Skorzystaj ze środków HSA lub FSA

Gen

SPOP

speckle type BTB/POZ protein

Podsumowanie

Lokalizacja cytogenetyczna
17q21.33
Współrzędne
Chromosom 17: 49 598 884–49 678 097 (GRCh38)
Eksony
10 eksonów na odcinku 79,2 kb
Białko
374 aminokwasów
Znany również jako
TEF2, BTBD32
Transkrypt MANE Select
ENST00000504102.6NM_001007228.2
Typ locus
gene with protein product
  • Bardzo wysoka
  • Pewna
  • Niska
  • Bardzo niska

Genom referencyjnyGRCh38

Pozycje na stronach genów i wariantów zależą od tego wyboru, w tej przeglądarce.

Wyselekcjonowane raporty dotyczące tego genu

Żaden raport Genome Test jeszcze nie odczytuje genu SPOP. Test sekwencjonuje cały genom, więc dane obejmują go mimo to.

Budowa genu SPOP

  • Sekwencja kodująca
  • Region nieulegający translacji
  • Intron
  • Kierunek transkrypcji
  • Znane miejsca powodujące choroby
  • Odcinki, z którymi krótkie odczyty mają trudność
Chromosom 17, z nawiasem wskazującym położenie SPOP. SPOP i 18 genów w pobliżu na chromosomie 17, od 49 138 491 do 50 138 490.Chromosom 1717q21.33p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.349,2 Mb49,4 Mb49,6 Mb49,8 Mb50 MbB4GALNT2: 49 132 460–49 178 647, nić dodatniejB4GALNT2GNGT2: 49 202 791–49 210 610, nić ujemnejGNGT2ABI3: 49 210 388–49 224 184, nić dodatniejABI3PHOSPHO1: 49 223 346–49 230 831, nić ujemnejPHOSPHO1ZNF652: 49 289 206–49 362 473, nić ujemnejZNF652PHB1: 49 404 009–49 436 245, nić ujemnejPHB1NGFR: 49 495 286–49 515 020, nić dodatniejNGFRNXPH3: 49 575 716–49 583 827, nić dodatniejNXPH3SPOP: 49 598 884–49 678 097, nić ujemnejSPOPSLC35B1: 49 682 022–49 709 014, nić ujemnejSLC35B1FAM117A: 49 710 332–49 789 180, nić ujemnejFAM117AKAT7: 49 788 624–49 835 026, nić dodatniejKAT7TAC4: 49 838 300–49 848 071, nić ujemnejTAC4DLX4: 49 968 588–49 974 959, nić dodatniejDLX4DLX3: 49 990 005–49 995 224, nić ujemnejDLX3ITGA3: 50 055 968–50 090 933, nić dodatniejITGA3PDK2: 50 094 737–50 120 276, nić dodatniejPDK2SAMD14: 50 110 040–50 130 160, nić ujemnejSAMD14PPP1R9B: 50 133 732–50 151 020, nić ujemnejPPP1R9BSchemat SPOP: 10 eksonów na nici ujemnej chromosomu 17Ekson 5: 5 znanych miejsc powodujących chorobęEkson 4: 4 znanych miejsc powodujących chorobęEkson 2: 1 znane miejsce powodujące chorobęEkson 10: 49 598 884–49 600 522, 1639 zasadEkson 9: 49 601 865–49 602 007, 143 zasadEkson 8: 49 607 250–49 607 372, 123 zasadEkson 7: 49 607 874–49 607 929, 56 zasadEkson 6: 49 611 280–49 611 457, 178 zasadEkson 5: 49 618 981–49 619 108, 128 zasadEkson 4: 49 619 234–49 619 385, 152 zasadEkson 3: 49 621 946–49 622 067, 122 zasadEkson 2: 49 622 733–49 622 876, 144 zasadEkson 1: 49 677 933–49 678 097, 165 zasad10864215′3′

Eksony transkryptu MANE Select genu (wydanie v1.5) z NCBI i EMBL-EBI, na referencyjnym genomie GRCh38.

Prążki chromosomowe z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Pobliskie geny z wydania Ensembl 116, na GRCh38.

Eksony stanowią 2,9 kb z 79,2 kb genu; 1125 z tych zasad kodują białko.

Jak test genomu odczytuje SPOP

10

pozycje w SPOP, w których ClinVar klasyfikuje zmianę jako patogenną lub prawdopodobnie patogenną

Żadne z nich nie przypada na region, który krótkie odczyty trudno odczytać.

Pełne sekwencjonowanie genomu obejmuje wszystkie 79,2 kb genu SPOP, łącznie z intronami, a nie tylko 2,9 kb eksonów.

Skąd pochodzą te dane

  • HGNC: symbol genu, jego nazwa, inne symbole i położenie.
  • MANE Select v1.5, z NCBI i EMBL-EBI: transkrypt, jego eksony i sekwencja kodująca.
  • ClinVar i stratyfikacje GIAB: znane miejsca powodujące choroby oraz regiony, które krótkie odczyty trudno odczytać.
  • Human Phenotype Ontology, wersja 2026-09-01: cechy powiązane z genem. Więcej informacji znajdą Państwo na hpo.jax.org.
  • Wydanie danych 2026.10.16-c6eea6bf.

Cytuj tę stronę

APA

Dante Labs. (b.d.). Gen SPOP: speckle type BTB/POZ protein. Pobrano 17 października 2026, z https://dantelabs.com/pl/genes/spop

Vancouver

Dante Labs. Gen SPOP: speckle type BTB/POZ protein [Internet]. [cytowano 17 października 2026]. Dostępne w: https://dantelabs.com/pl/genes/spop

Jeden test. Odpowiedzi na całe życie.

Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni

Zamawiam Genome Test