Gå til indhold
Brug dine HSA- eller FSA-midler

Gen

SPOP

speckle type BTB/POZ protein

Oversigt

Cytogenetisk placering
17q21.33
Koordinater
Kromosom 17: 49.598.884–49.678.097 (GRCh38)
Exoner
10 exoner fordelt over 79,2 kb
Protein
374 aminosyrer
Også kendt som
TEF2, BTBD32
MANE Select-transkript
ENST00000504102.6NM_001007228.2
Lokustype
gene with protein product
  • Meget høj
  • Sikker
  • Lav
  • Meget lav

ReferencegenomGRCh38

Positioner på gen- og variantsider følger dette valg i denne browser.

Kurerede rapporter relevant for dette gen

Ingen Genome Test-rapport læser SPOP endnu. Testen sekventerer hele dit genom, så dine data omfatter det alligevel.

Sådan er SPOP opbygget

  • Kodende sekvens
  • Utranslateret region
  • Intron
  • Transkriptionsretning
  • Kendte sygdomsfremkaldende steder
  • Regioner, som korte læsninger har svært ved
Kromosom 17, med en klamme ved SPOP. SPOP og 18 gener i nærheden på kromosom 17, fra 49.138.491 til 50.138.490.Kromosom 1717q21.33p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.349,2 Mb49,4 Mb49,6 Mb49,8 Mb50 MbB4GALNT2: 49.132.460–49.178.647, fremadrettet-strengB4GALNT2GNGT2: 49.202.791–49.210.610, omvendt-strengGNGT2ABI3: 49.210.388–49.224.184, fremadrettet-strengABI3PHOSPHO1: 49.223.346–49.230.831, omvendt-strengPHOSPHO1ZNF652: 49.289.206–49.362.473, omvendt-strengZNF652PHB1: 49.404.009–49.436.245, omvendt-strengPHB1NGFR: 49.495.286–49.515.020, fremadrettet-strengNGFRNXPH3: 49.575.716–49.583.827, fremadrettet-strengNXPH3SPOP: 49.598.884–49.678.097, omvendt-strengSPOPSLC35B1: 49.682.022–49.709.014, omvendt-strengSLC35B1FAM117A: 49.710.332–49.789.180, omvendt-strengFAM117AKAT7: 49.788.624–49.835.026, fremadrettet-strengKAT7TAC4: 49.838.300–49.848.071, omvendt-strengTAC4DLX4: 49.968.588–49.974.959, fremadrettet-strengDLX4DLX3: 49.990.005–49.995.224, omvendt-strengDLX3ITGA3: 50.055.968–50.090.933, fremadrettet-strengITGA3PDK2: 50.094.737–50.120.276, fremadrettet-strengPDK2SAMD14: 50.110.040–50.130.160, omvendt-strengSAMD14PPP1R9B: 50.133.732–50.151.020, omvendt-strengPPP1R9BDiagram af SPOP: 10 exoner på omvendt-strengen af kromosom 17Exon 5: 5 kendte sygdomsfremkaldende stederExon 4: 4 kendte sygdomsfremkaldende stederExon 2: 1 kendt sygdomsfremkaldende stedExon 10: 49.598.884–49.600.522, 1.639 baserExon 9: 49.601.865–49.602.007, 143 baserExon 8: 49.607.250–49.607.372, 123 baserExon 7: 49.607.874–49.607.929, 56 baserExon 6: 49.611.280–49.611.457, 178 baserExon 5: 49.618.981–49.619.108, 128 baserExon 4: 49.619.234–49.619.385, 152 baserExon 3: 49.621.946–49.622.067, 122 baserExon 2: 49.622.733–49.622.876, 144 baserExon 1: 49.677.933–49.678.097, 165 baser10864215′3′

Eksoner i genets MANE Select-transkript (udgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referencegenomet GRCh38.

Kromosombånd fra UCSC's GRCh38-ideogram (2022-10-29).

Gener i nærheden fra Ensembl-udgivelse 116, på GRCh38.

Eksoner udgør 2,9 kb af genets 79,2 kb; 1.125 af disse baser koder for proteinet.

Sådan læser en genomtest SPOP

10

positioner i SPOP, hvor ClinVar klassificerer en ændring som patogen eller sandsynligvis patogen

Ingen af dem ligger i en region, som korte læsninger har svært ved.

En helgenomsanalyse dækker alle 79,2 kb af SPOP, inklusive introner, og ikke kun de 2,9 kb eksoner.

Hvor oplysningerne kommer fra

  • HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og placering.
  • MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, dets exoner og kodende sekvens.
  • ClinVar og GIAB-stratifikationerne: kendte sygdomsfremkaldende positioner og de regioner, som korte læsninger har svært ved at aflæse.
  • Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: de træk, der er knyttet til genet. Læs mere på hpo.jax.org.
  • Dataudgivelse 2026.10.16-c6eea6bf.

Citér denne side

APA

Dante Labs. (u.d.). SPOP-genet: speckle type BTB/POZ protein. Hentet 16. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/da/genes/spop

Vancouver

Dante Labs. SPOP-genet: speckle type BTB/POZ protein [Internet]. [citeret 16. oktober 2026]. Tilgængelig fra: https://dantelabs.com/da/genes/spop

Én test. Svar for hele livet.

Fra 449 $Gratis forsendelse · Resultater på 6–8 uger

Bestil min Genome Test