Gen
SLC1A4
solute carrier family 1 member 4
- HGNC 10942↗(otevře se na nové kartě)
- Gen v Ensembl ENSG00000115902↗(otevře se na nové kartě)
- NCBI Gene 6509↗(otevře se na nové kartě)
Shrnutí
- Cytogenetická poloha
- 2p14
- Souřadnice
- Chromozom 2: 64 989 399–65 023 865 (GRCh38)
- Exony
- 8 exonů na 34,5 kb
- Protein
- 532 aminokyselin
- Dědičnost
- Autozomálně recesivní
- Další názvy
- SATT, ASCT1, ASCT-1
- Transkript MANE Select
- ENST00000234256.4NM_003038.5
- Typ lokusu
- gene with protein product
- Velmi vysoká
- Jistá
- Nízká
- Velmi nízká
Referenční genomGRCh38hg38
Pozice na stránkách genů a variant se řídí touto volbou v tomto prohlížeči.
Přečtěte si SLC1A4 i zbytek svého genomu jediným testem.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů
Objednejte si Genome TestKurátorovaný report související s tímto genem
Disorders of Glycine & Serine Metabolism
- Serine Deficiency DisordersAutozomálně recesivní
Caused by variants in PHGDH, PSAT1 or PSPH, which block serine production and can cause small head size, seizures and developmental delay.
- Hodnocení ClinGen pro tuto vazbu: definitivní
- 4 zadavatelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
Co přináší znalost
Knowing allows serine and glycine supplementation, which can prevent or improve symptoms when started early, including before birth.
Dědičnost
- Autozomálně recesivní
- Je potřeba změněná kopie od každého z rodičů. S jednou kopií jste nositelem a obvykle nejste postiženi; pokud jsou oba rodiče nositeli, má každé dítě pravděpodobnost jedna ku čtyřem, že zdědí dvě.
Jak je SLC1A4 uspořádán
- Kódující sekvence
- Netranslatovaná oblast
- Intron
- Směr transkripce
- Známá místa způsobující onemocnění
- Úseky, které krátká čtení obtížně zachycují
Exony transkriptu MANE Select genu (verze v1.5) z databází NCBI a EMBL-EBI, na referenčním genomu GRCh38.
Pásy chromozomů z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Okolní geny z Ensembl, verze 116, na GRCh38.
Exony tvoří 4,6 kb z 34,5 kb genu; 1 599 těchto bází kódují protein.
Jak genetický test čte SLC1A4
14
pozic v genu SLC1A4, které ClinVar řadí mezi patogenní nebo pravděpodobně patogenní
Žádné z nich neleží v oblasti, kterou krátká čtení obtížně zachycují.
Celý genom pokrývá všech 34,5 kb genu SLC1A4, včetně intronů, nikoli jen 4,6 kb exonů.
Geny spojené se stejnými onemocněními
Rysy spojené s SLC1A4
Human Phenotype Ontology uvádí tyto rysy jako příznaky vzácných onemocnění, která může způsobit SLC1A4. Na stránce každého rysu najdete další geny, které jsou s ním spojené.
Abnormality of the nervous system
- Absent speech development
- Babinski sign
- Global developmental delay
- Thin corpus callosum
- Delayed speech and language development
- Increased reflexes
- Intellectual disability
- Abnormal cerebral white matter morphology
Zobrazit ještě 19 rysů
- Brain degeneration
- Brisk reflexes
- Delayed CNS myelination
- Generalized-onset seizure
- Motor delay
- Underdevelopment of part of brain called corpus callosum
- Cerebral hypomyelination
- Clonus
- Epilepsy
- Grand mal seizures
- Hair-pulling
- Hypsarrhythmia
- Infantile spasms
- Irritability
- More active than typical
- Myoclonic spasms
- Repetitive movements
- Degeneration of cerebrum
- Inability to walk
Abnormality of head or neck
- Abnormally small head
- Development of small head that was not present at birth
- Drooling
- Small head present at birth
- Abnormal facial shape
- Depressed nasal bridge
- Monobrow
- Wide nasal bridge
Zobrazit ještě 1 rys
Externí odkazy
Záznamy o genu
Transkript
Protein
Odkud údaje pocházejí
- HGNC: symbol genu, název, další symboly a umístění.
- MANE Select v1.5, z NCBI a EMBL-EBI: transkript, jeho exony a kódující sekvence.
- GenCC a ClinGen, vydání 2026-10-16: s jakými onemocněními je gen spojen a jak silná je tato souvislost.
- Seznam sekundárních nálezů ACMG, SF v3.2.
- ClinVar a stratifikace GIAB: známá místa způsobující onemocnění a oblasti, které krátká čtení obtížně zachycují.
- Human Phenotype Ontology, verze 2026-09-01: rysy spojené s tímto genem. Více informací najdete na hpo.jax.org.
- Vydání dat 2026.10.16-c6eea6bf.
Citovat tuto stránku
Dante Labs. (b.d.). Gen SLC1A4: solute carrier family 1 member 4. Staženo 16. října 2026, z https://dantelabs.com/cs/genes/slc1a4
Dante Labs. Gen SLC1A4: solute carrier family 1 member 4 [Internet]. [citováno 16. října 2026]. Dostupné z: https://dantelabs.com/cs/genes/slc1a4
Jeden test. Odpovědi na celý život.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů