Geeni
SLC1A4
solute carrier family 1 member 4
- HGNC 10942↗(avautuu uuteen välilehteen)
- Ensembl-geeni ENSG00000115902↗(avautuu uuteen välilehteen)
- NCBI Gene 6509↗(avautuu uuteen välilehteen)
Yhteenveto
- Sytogeneettinen sijainti
- 2p14
- Koordinaatit
- Kromosomi 2: 64 989 399–65 023 865 (GRCh38)
- Eksonit
- 8 eksonia 34,5 kb:n alueella
- Proteiini
- 532 aminohappoa
- Periytyminen
- Autosomaalinen resessiivinen
- Tunnetaan myös nimellä
- SATT, ASCT1, ASCT-1
- MANE Select -transkripti
- ENST00000234256.4NM_003038.5
- Lokustyyppi
- gene with protein product
- Erittäin korkea
- Varma
- Matala
- Erittäin matala
ViitegenomiGRCh38hg38
Geenien ja varianttien sivujen sijainnit noudattavat tätä valintaa tässä selaimessa.
Lue SLC1A4 ja muu genomisi yhdellä testillä.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa
Tilaa Genome TestTähän geeniin liittyvä kuratoitu raportti
Glysiinin ja seriinin aineenvaihdunnan häiriöt
- Seriinin puutostauditAutosomaalinen resessiivinen
Aiheutuu PHGDH-, PSAT1- tai PSPH-geenien varianteista, jotka estävät seriinin muodostumisen. Ne voivat aiheuttaa pienen pään ympärysmitan, kohtauksia ja kehityksen viivästymistä.
- ClinGen luokittelee yhteyden: varma
- 4 GenCC-arvioijaa arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
Mitä tieto muuttaa
Tieto mahdollistaa seriini- ja glysiinilisän käytön, joka voi ehkäistä oireita tai parantaa niitä, kun hoito aloitetaan varhain, myös ennen syntymää.
Periytyminen
- Autosomaalinen resessiivinen
- Tarvitaan muuttunut kopio kummaltakin vanhemmalta. Yhdellä olet kantaja ja yleensä oireeton. Kun molemmat vanhemmat ovat kantajia, kullakin lapsella on yksi neljästä mahdollisuudesta periä kaksi muuttunutta kopiota.
SLC1A4-geenin rakenne
- Koodaava jakso
- Translatoimaton alue
- Intron
- Transkription suunta
- Tunnetut tautia aiheuttavat kohdat
- Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.
Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).
Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.
Eksonit muodostavat 4,6 kb geenin 34,5 kb:stä; 1 599 näistä emäksistä koodaa proteiinia.
Miten genomitesti lukee geeniä SLC1A4
14
SLC1A4-geenin kohtaa, joissa ClinVar luokittelee muutoksen patogeeniseksi tai todennäköisesti patogeeniseksi
Mikään niistä ei osu alueelle, jota lyhyet lukemat löytävät vaikeasti.
Kokogenomi kattaa kaikki 34,5 kb geenistä SLC1A4, intronit mukaan lukien, ei pelkästään 4,6 kb eksoneja.
Samoihin sairauksiin liittyvät geenit
Geeniin SLC1A4 liittyvät piirteet
Human Phenotype Ontology luettelee nämä piirteinä harvinaisista sairauksista, joita SLC1A4 voi aiheuttaa. Kunkin piirteen sivulla luetellaan muut siihen liittyvät geenit.
Abnormality of the nervous system
- Absent speech development
- Babinski sign
- Global developmental delay
- Thin corpus callosum
- Delayed speech and language development
- Increased reflexes
- Intellectual disability
- Abnormal cerebral white matter morphology
Näytä 19 piirrettä lisää
- Brain degeneration
- Brisk reflexes
- Delayed CNS myelination
- Generalized-onset seizure
- Motor delay
- Underdevelopment of part of brain called corpus callosum
- Cerebral hypomyelination
- Clonus
- Epilepsy
- Grand mal seizures
- Hair-pulling
- Hypsarrhythmia
- Infantile spasms
- Irritability
- More active than typical
- Myoclonic spasms
- Repetitive movements
- Degeneration of cerebrum
- Inability to walk
Abnormality of head or neck
- Abnormally small head
- Development of small head that was not present at birth
- Drooling
- Small head present at birth
- Abnormal facial shape
- Depressed nasal bridge
- Monobrow
- Wide nasal bridge
Näytä 1 piirre lisää
Ulkoiset linkit
Geenitietueet
Transkripti
Proteiini
Mistä tieto on peräisin
- HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
- MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkripti, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
- GenCC ja ClinGen, julkaisu 2026-10-16: mihin sairauksiin geeni liittyy ja kuinka vahvasti.
- ACMG:n toissijaisten löydösten luettelo, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-stratifikaatiot: tunnetut tautia aiheuttavat kohdat sekä alueet, joiden lukeminen lyhyillä luennoilla on vaikeaa.
- Human Phenotype Ontology, versio 2026-09-01: geeniin liittyvät piirteet. Lue lisää osoitteesta hpo.jax.org.
- Datajulkaisu 2026.10.16-c6eea6bf.
Viittaa tähän sivuun
Dante Labs. (n.d.). SLC1A4-geeni: solute carrier family 1 member 4. Haettu 17. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/slc1a4
Dante Labs. SLC1A4-geeni: solute carrier family 1 member 4 [Internet]. [viitattu 17. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/slc1a4
Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa