Gen
SLC1A4
solute carrier family 1 member 4
- HGNC 10942↗(öppnas i en ny flik)
- Ensembl-gen ENSG00000115902↗(öppnas i en ny flik)
- NCBI Gene 6509↗(öppnas i en ny flik)
Sammanfattning
- Cytogenetisk position
- 2p14
- Koordinater
- Kromosom 2: 64 989 399–65 023 865 (GRCh38)
- Exoner
- 8 exoner på 34,5 kb
- Protein
- 532 aminosyror
- Arvsgång
- Autosomalt recessiv
- Även känd som
- SATT, ASCT1, ASCT-1
- MANE Select-transkript
- ENST00000234256.4NM_003038.5
- Lokustyp
- gene with protein product
- Mycket hög
- Säker
- Låg
- Mycket låg
ReferensgenomGRCh38hg38
Positioner på gen- och variantsidorna följer det här valet, i den här webbläsaren.
Läs SLC1A4, och resten av ditt genom, med ett test.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor
Beställ mitt Genome TestKuraterad rapport som är relevant för denna gen
Ärftliga störningar i glycin- och serinmetabolismen
- SerinbristsjukdomarAutosomalt recessiv
Orsakas av varianter i PHGDH, PSAT1 eller PSPH, som blockerar serinproduktionen och kan ge en liten huvudstorlek, krampanfall och försenad utveckling.
- ClinGen bedömer kopplingen som definitiv
- 4 GenCC-bedömare klassar den som definitiv eller stark
Vad kunskapen förändrar
Kunskap om detta gör det möjligt att ge serin- och glycintillskott, vilket kan förebygga eller förbättra symtomen när behandlingen startar tidigt, även före födseln.
Nedärvning
- Autosomalt recessiv
- Det krävs en förändrad kopia från vardera föräldern. Med en är du bärare och oftast opåverkad. När båda föräldrarna är bärare har varje barn en chans på en av fyra att ärva två.
Så är SLC1A4 uppbyggd
- Kodande sekvens
- Otranslaterad region
- Intron
- Transkriptionsriktning
- Kända sjukdomsorsakande ställen
- Sträckor som korta läsningar har svårt för
Exoner i genens MANE Select-transkript (version v1.5), från NCBI och EMBL-EBI, på referensgenomet GRCh38.
Kromosombanden från UCSC:s GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Närliggande gener från Ensembl-version 116, på GRCh38.
Exoner utgör 4,6 kb av genens 34,5 kb, och 1 599 av dessa baser kodar för proteinet.
Så läser ett genomtest SLC1A4
14
positioner i SLC1A4 där ClinVar klassar en förändring som patogen eller sannolikt patogen
Inget av dem ligger i ett område som korta läsningar har svårt för.
En helgenomsanalys täcker alla 34,5 kb av SLC1A4, med introner inräknade, inte bara de 4,6 kb exoner.
Gener kopplade till samma tillstånd
Egenskaper kopplade till SLC1A4
Human Phenotype Ontology listar dessa som kännetecken för de sällsynta tillstånd som SLC1A4 kan orsaka. Varje egenskaps sida visar de andra gener som är kopplade till den.
Abnormality of the nervous system
- Absent speech development
- Babinski sign
- Global developmental delay
- Thin corpus callosum
- Delayed speech and language development
- Increased reflexes
- Intellectual disability
- Abnormal cerebral white matter morphology
Visa ytterligare 19 egenskaper
- Brain degeneration
- Brisk reflexes
- Delayed CNS myelination
- Generalized-onset seizure
- Motor delay
- Underdevelopment of part of brain called corpus callosum
- Cerebral hypomyelination
- Clonus
- Epilepsy
- Grand mal seizures
- Hair-pulling
- Hypsarrhythmia
- Infantile spasms
- Irritability
- More active than typical
- Myoclonic spasms
- Repetitive movements
- Degeneration of cerebrum
- Inability to walk
Abnormality of head or neck
- Abnormally small head
- Development of small head that was not present at birth
- Drooling
- Small head present at birth
- Abnormal facial shape
- Depressed nasal bridge
- Monobrow
- Wide nasal bridge
Visa ytterligare 1 egenskap
Externa länkar
Genposter
Transkript
Protein
Varifrån detta kommer
- HGNC: genens symbol, namn, andra symboler och position.
- MANE Select v1.5, från NCBI och EMBL-EBI: transkriptet, dess exoner och kodande sekvens.
- GenCC och ClinGen, släppt 2026-10-16: vilka tillstånd genen är kopplad till och hur starkt kopplingen är.
- ACMG:s lista över sekundära fynd, SF v3.2.
- ClinVar och GIAB-stratifieringarna: kända sjukdomsorsakande positioner och de regioner där korta läsningar har svårt.
- Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: egenskaperna som är kopplade till genen. Läs mer på hpo.jax.org.
- Dataversion 2026.10.16-c6eea6bf.
Citera den här sidan
Dante Labs. (u.å.). SLC1A4-genen: solute carrier family 1 member 4. Hämtad 17 oktober 2026, från https://dantelabs.com/sv/genes/slc1a4
Dante Labs. SLC1A4-genen: solute carrier family 1 member 4 [Internet]. [citerad 17 oktober 2026]. Tillgänglig på: https://dantelabs.com/sv/genes/slc1a4
Ett test. Ett helt liv av svar.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor