Geeni
CDH1
cadherin 1
- HGNC 1748↗(avautuu uuteen välilehteen)
- Ensembl-geeni ENSG00000039068↗(avautuu uuteen välilehteen)
- NCBI Gene 999↗(avautuu uuteen välilehteen)
Yhteenveto
- Sytogeneettinen sijainti
- 16q22.1
- Koordinaatit
- Kromosomi 16: 68 737 292–68 835 537 (GRCh38)
- Eksonit
- 16 eksonia 98,2 kb:n alueella
- Proteiini
- 882 aminohappoa
- Periytyminen
- Autosomaalinen dominantti
- Tunnetaan myös nimellä
- uvomorulin, CD324
- Aiemmat symbolit
- UVO
- MANE Select -transkripti
- ENST00000261769.10NM_004360.5
- Lokustyyppi
- gene with protein product
- Erittäin korkea
- Varma
- Matala
- Erittäin matala
ViitegenomiGRCh38hg38
Geenien ja varianttien sivujen sijainnit noudattavat tätä valintaa tässä selaimessa.
Lue CDH1 ja muu genomisi yhdellä testillä.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa
Tilaa Genome TestTähän geeniin liittyviä kuratoituja raportteja
Perinnöllinen diffuusi mahasyöpä
- CDH1-geeniin liittyvä diffuusi mahasyöpä ja lobulaarinen rintasyöpä -oireyhtymäAutosomaalinen dominantti
CDH1-geenin variantit, jotka lisäävät elinaikaista riskiä sairastua diffuusiin mahasyöpään ja lobulaariseen rintasyöpään.
- ClinGen luokittelee yhteyden: varma
- 3 GenCC-arvioijaa arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
Mitä tieto muuttaa
Ennaltaehkäisevää mahalaukun poistoa harkitaan usein. Vaihtoehtona on tehostettu endoskooppinen seuranta. Naisille tehdään rintojen MRI-tutkimus.
- Autosomaalinen dominantti
Diffuusityyppisen mahasyövän suvussa esiintyvä kasautuma, joka aiheutuu usein CDH1-geenin varianteista.
- 1 GenCC-arvioija arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
Mitä tieto muuttaa
Erikoislääkärin arvio mahalaukun leikkauksesta tai endoskooppisesta seurannasta.
Rintasyöpägeenit BRCA1/2:n lisäksi
- Perinnöllinen rintasyöpäAutosomaalinen dominantti
Perinnöllinen alttius rintasyöpään, jonka aiheuttavat variantit yhdessä useista geeneistä.
- 1 GenCC-arvioija arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
Mitä tieto muuttaa
Geenistä riippuen voidaan suositella aiempaa ja tiiviimpää rintojen seulontaa, mukaan lukien MRI-tutkimus.
Periytyminen
- Autosomaalinen dominantti
- Yksi muuttunut kopio kummalta vanhemmalta tahansa riittää. Vanhempi, jolla on yksi, siirtää sen kullekin lapselleen todennäköisyydellä yksi kahdesta.
CDH1-geenin rakenne
- Koodaava jakso
- Translatoimaton alue
- Intron
- Transkription suunta
- Tunnetut tautia aiheuttavat kohdat
- Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
- Variantit, joilla on sivu
Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.
Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).
Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.
Eksonit muodostavat 4,8 kb geenin 98,2 kb:stä; 2 649 näistä emäksistä koodaa proteiinia.
Miten genomitesti lukee geeniä CDH1
517
CDH1-geenin kohtaa, joissa ClinVar luokittelee muutoksen patogeeniseksi tai todennäköisesti patogeeniseksi
Mikään niistä ei osu alueelle, jota lyhyet lukemat löytävät vaikeasti.
Kokogenomi kattaa kaikki 98,2 kb geenistä CDH1, intronit mukaan lukien, ei pelkästään 4,8 kb eksoneja.
Variantit, joilla on sivu (228)
Tässä ovat CDH1-variantit, joilla on sivu, eniten arvostelutähtiä saaneet ensin. Jokainen sivu kuvaa ClinVarin julkista tietuetta variantista, ei koskaan tulosta.
| Variantti | HGVS c. | Eksoni tai introni | Sijainti (GRCh38) | ClinVar-luokitus | Arvioinnin tila |
|---|---|---|---|---|---|
| A530Cfs*7 | c.1587dup | Eksoni 11 | 68 819 300 | Patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima |
| A546Lfs*11 | c.1636del | Eksoni 11 | 68 819 347 | Patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima |
| c.1A>G | Eksoni 1 | 68 737 416 | Patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima | |
| c.2T>A | Eksoni 1 | 68 737 417 | Patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima | |
| c.2T>C | Eksoni 1 | 68 737 417 | Patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima | |
| c.2T>G | Eksoni 1 | 68 737 417 | Patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima | |
| c.3G>A | Eksoni 1 | 68 737 418 | Patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima | |
| c.11G>A | Eksoni 1 | 68 737 426 | Patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima | |
| c.48+1G>A | Introni 1 | 68 737 464 | Patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima | |
| c.49-2A>G | Introni 1 | 68 738 295 | Patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima |
Samoihin sairauksiin liittyvät geenit
Geeniin CDH1 liittyvät piirteet
Human Phenotype Ontology luettelee nämä piirteinä harvinaisista sairauksista, joita CDH1 voi aiheuttaa. Kunkin piirteen sivulla luetellaan muut siihen liittyvät geenit.
Abnormality of head or neck
- Distichiasis
- Euryblepharon
- Eyelids stay open
- Flat face
- High forehead
- Lower eyelid folded out
- Abnormality of the eyelid
- Abnormality of tooth eruption
Näytä 18 piirrettä lisää
- Cleft upper lip
- Cleft of the mouth
- Cleft palate
- Cone shaped tooth
- Dental cavities
- One sided cleft palate
- Velopharyngeal incompetence
- Abnormal number of permanent teeth
- Bad bite
- Blockage of the rear opening of the nasal cavity
- Hole in roof of mouth
- Missing lateral incisor
- Peg-shaped maxillary lateral incisors
- Right and left cleft palate
- Decreased size of maxilla
- High frontal hairline
- Both sided cleft lip
- Failure of development of between one and six teeth
Ulkoiset linkit
Geenitietueet
Transkripti
Proteiini
Mistä tieto on peräisin
- HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
- MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkripti, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
- GenCC ja ClinGen, julkaisu 2026-10-16: mihin sairauksiin geeni liittyy ja kuinka vahvasti.
- ACMG:n toissijaisten löydösten luettelo, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-stratifikaatiot: tunnetut tautia aiheuttavat kohdat sekä alueet, joiden lukeminen lyhyillä luennoilla on vaikeaa.
- Human Phenotype Ontology, versio 2026-09-01: geeniin liittyvät piirteet. Lue lisää osoitteesta hpo.jax.org.
- Datajulkaisu 2026.10.16-c6eea6bf.
Viittaa tähän sivuun
Dante Labs. (n.d.). CDH1-geeni: cadherin 1. Haettu 17. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/cdh1
Dante Labs. CDH1-geeni: cadherin 1 [Internet]. [viitattu 17. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/cdh1
Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa