Gen
CDH1
cadherin 1
- HGNC 1748↗(öppnas i en ny flik)
- Ensembl-gen ENSG00000039068↗(öppnas i en ny flik)
- NCBI Gene 999↗(öppnas i en ny flik)
Sammanfattning
- Cytogenetisk position
- 16q22.1
- Koordinater
- Kromosom 16: 68 737 292–68 835 537 (GRCh38)
- Exoner
- 16 exoner på 98,2 kb
- Protein
- 882 aminosyror
- Arvsgång
- Autosomalt dominant
- Även känd som
- uvomorulin, CD324
- Tidigare symboler
- UVO
- MANE Select-transkript
- ENST00000261769.10NM_004360.5
- Lokustyp
- gene with protein product
- Mycket hög
- Säker
- Låg
- Mycket låg
ReferensgenomGRCh38hg38
Positioner på gen- och variantsidorna följer det här valet, i den här webbläsaren.
Läs CDH1, och resten av ditt genom, med ett test.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor
Beställ mitt Genome TestKuraterade rapporter som är relevanta för denna gen
Ärftlig diffus magcancer
- CDH1-relaterat syndrom med diffus magcancer och lobulär bröstcancerAutosomalt dominant
Varianter i CDH1 som ökar livstidsrisken för diffus magcancer och lobulär bröstcancer.
- ClinGen bedömer kopplingen som definitiv
- 3 GenCC-bedömare klassar den som definitiv eller stark
Vad kunskapen förändrar
Förebyggande borttagning av magsäcken övervägs ofta, alternativt intensiv endoskopisk uppföljning, och för kvinnor bröst-MR.
- Ärftligt diffust adenokarcinom i magsäckenAutosomalt dominant
Familjär samling av diffus magcancer, ofta orsakad av varianter i CDH1.
- 1 GenCC-bedömare klassar den som definitiv eller stark
Vad kunskapen förändrar
Specialistbedömning av kirurgi av magsäcken eller endoskopisk uppföljning.
Gener för bröst- och äggstockscancer utöver BRCA1/2
- Ärftlig bröstcancerAutosomalt dominant
Ärftlig känslighet för bröstcancer orsakad av varianter i någon av flera gener.
- 1 GenCC-bedömare klassar den som definitiv eller stark
Vad kunskapen förändrar
Tidigare och mer intensiv mammografiundersökning, inklusive MRT, kan rekommenderas beroende på gen.
Nedärvning
- Autosomalt dominant
- En förändrad kopia, från någon av föräldrarna, räcker. En förälder som har en sådan för den vidare till varje barn med en chans på en av två.
Så är CDH1 uppbyggd
- Kodande sekvens
- Otranslaterad region
- Intron
- Transkriptionsriktning
- Kända sjukdomsorsakande ställen
- Sträckor som korta läsningar har svårt för
- Varianter med egen sida
Exoner i genens MANE Select-transkript (version v1.5), från NCBI och EMBL-EBI, på referensgenomet GRCh38.
Kromosombanden från UCSC:s GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Närliggande gener från Ensembl-version 116, på GRCh38.
Exoner utgör 4,8 kb av genens 98,2 kb, och 2 649 av dessa baser kodar för proteinet.
Så läser ett genomtest CDH1
517
positioner i CDH1 där ClinVar klassar en förändring som patogen eller sannolikt patogen
Inget av dem ligger i ett område som korta läsningar har svårt för.
En helgenomsanalys täcker alla 98,2 kb av CDH1, med introner inräknade, inte bara de 4,8 kb exoner.
Varianter med egen sida (228)
De CDH1-varianter som har en egen sida här, med flest recensionsstjärnor först. Varje sida beskriver ClinVars offentliga register över varianten, aldrig ett resultat.
| Variant | HGVS c. | Exon eller intron | Position (GRCh38) | ClinVar-klassificering | Granskningsstatus |
|---|---|---|---|---|---|
| A530Cfs*7 | c.1587dup | Exon 11 | 68 819 300 | Patogen | ★★★★3 stjärnor av 4 granskad av expertpanel |
| A546Lfs*11 | c.1636del | Exon 11 | 68 819 347 | Patogen | ★★★★3 stjärnor av 4 granskad av expertpanel |
| c.1A>G | Exon 1 | 68 737 416 | Patogen | ★★★★3 stjärnor av 4 granskad av expertpanel | |
| c.2T>A | Exon 1 | 68 737 417 | Patogen | ★★★★3 stjärnor av 4 granskad av expertpanel | |
| c.2T>C | Exon 1 | 68 737 417 | Patogen | ★★★★3 stjärnor av 4 granskad av expertpanel | |
| c.2T>G | Exon 1 | 68 737 417 | Patogen | ★★★★3 stjärnor av 4 granskad av expertpanel | |
| c.3G>A | Exon 1 | 68 737 418 | Patogen | ★★★★3 stjärnor av 4 granskad av expertpanel | |
| c.11G>A | Exon 1 | 68 737 426 | Patogen | ★★★★3 stjärnor av 4 granskad av expertpanel | |
| c.48+1G>A | Intron 1 | 68 737 464 | Patogen | ★★★★3 stjärnor av 4 granskad av expertpanel | |
| c.49-2A>G | Intron 1 | 68 738 295 | Patogen | ★★★★3 stjärnor av 4 granskad av expertpanel |
Gener kopplade till samma tillstånd
Egenskaper kopplade till CDH1
Human Phenotype Ontology listar dessa som kännetecken för de sällsynta tillstånd som CDH1 kan orsaka. Varje egenskaps sida visar de andra gener som är kopplade till den.
Abnormality of head or neck
- Distichiasis
- Euryblepharon
- Eyelids stay open
- Flat face
- High forehead
- Lower eyelid folded out
- Abnormality of the eyelid
- Abnormality of tooth eruption
Visa ytterligare 18 egenskaper
- Cleft upper lip
- Cleft of the mouth
- Cleft palate
- Cone shaped tooth
- Dental cavities
- One sided cleft palate
- Velopharyngeal incompetence
- Abnormal number of permanent teeth
- Bad bite
- Blockage of the rear opening of the nasal cavity
- Hole in roof of mouth
- Missing lateral incisor
- Peg-shaped maxillary lateral incisors
- Right and left cleft palate
- Decreased size of maxilla
- High frontal hairline
- Both sided cleft lip
- Failure of development of between one and six teeth
Externa länkar
Genposter
Transkript
Protein
Varifrån detta kommer
- HGNC: genens symbol, namn, andra symboler och position.
- MANE Select v1.5, från NCBI och EMBL-EBI: transkriptet, dess exoner och kodande sekvens.
- GenCC och ClinGen, släppt 2026-10-16: vilka tillstånd genen är kopplad till och hur starkt kopplingen är.
- ACMG:s lista över sekundära fynd, SF v3.2.
- ClinVar och GIAB-stratifieringarna: kända sjukdomsorsakande positioner och de regioner där korta läsningar har svårt.
- Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: egenskaperna som är kopplade till genen. Läs mer på hpo.jax.org.
- Dataversion 2026.10.16-c6eea6bf.
Citera den här sidan
Dante Labs. (u.å.). CDH1-genen: cadherin 1. Hämtad 16 oktober 2026, från https://dantelabs.com/sv/genes/cdh1
Dante Labs. CDH1-genen: cadherin 1 [Internet]. [citerad 16 oktober 2026]. Tillgänglig på: https://dantelabs.com/sv/genes/cdh1
Ett test. Ett helt liv av svar.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor