Gen
PPP6R1
protein phosphatase 6 regulatory subunit 1
- HGNC 29195↗(yeni sekmede açılır)
- Ensembl gen ENSG00000105063↗(yeni sekmede açılır)
- NCBI Gene 22870↗(yeni sekmede açılır)
Özet
- Sitogenetik konum
- 19q13.42
- Koordinatlar
- Kromozom 19: 55.229.779–55.259.017 (GRCh38)
- Eksonlar
- 29,2 kb boyunca 24 ekson
- Protein
- 881 amino asit
- Diğer adları
- SAP190
- Önceki semboller
- KIAA1115, SAPS1
- MANE Select transkripti
- ENST00000412770.7NM_014931.4
- Lokus türü
- Protein kodlayan
- Çok yüksek
- Yüksek
- Düşük
- Çok düşük
Bu sayfanın veri olarak görünümü
Veriyi JSON olarak okumak için sayfa adresinin sonuna .json ekleyin veya application/json isteyin.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/ppp6r1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$namePPP6R1 ve genomunuzun geri kalanını tek bir testle okuyun.
$449'den başlayanÜcretsiz kargo · Sonuçlar 6–8 hafta içinde
Genome Test'imi alBu gen için derlenmiş ilgili raporlar
Hiçbir Genome Test raporu PPP6R1 genini henüz okumuyor. Test tüm genomunuzu dizilediği için bu gen yine de verilerinize dahildir.
PPP6R1 geninin yapısı
- Kodlayan dizi
- Çevrilmeyen bölge
- İntron
- Transkripsiyon yönü
- Kısa okumaların zorlandığı bölgeler
Genin MANE Select transkriptinin ekzonları (v1.5 sürümü), NCBI ve EMBL-EBI kaynaklı, GRCh38 referans genomu üzerinde.
Kromozom bantları, UCSC'nin GRCh38 ideogramından (2022-10-29).
Yakındaki genler, Ensembl 116 sürümünden, GRCh38 üzerinde.
Ekzonlar genin 29,2 kb uzunluğunun 4 kb'sini oluşturur; bu bazların 2.646 tanesi proteini kodlar.
PPP6R1 dizilemesi
8Düşük
100 üzerinden, PPP6R1 genini kısa okumalarla dizilemenin ne kadar zor olduğuHer çubuk, PPP6R1 geninin ekson bazlarının bu tür zorlu bölgelerdeki payını gösterir. Puan, bunları kısa okuma çağrısına maliyetlerine göre ağırlıklandırır: hiçbir baz herhangi birinde yer almadığında 0, her baz hepsinde yer aldığında 100.
- Eşlenebilirlik100 veya 250 bp'lik okumaların tek anlamlı şekilde yerleştirilemediği bölgeler; bu bölgelerdeki bir çağrı eksik ya da hatalı olabilir. Ağırlık %35.%0
- HomolojiSegmental duplikasyonlar: paralog ve psödogenler gibi genomun başka yerlerindeki, %90 ve üzeri benzerlikteki kopyalar. Ağırlık %30.%0
- TekrarlarOkumaların kaydığı ve kapsayamayabileceği tandem tekrarlar ile tek baz dizileri. Ağırlık %15.%9,8
- GC içeriği%25'in altında veya %65'in üzerinde G ve C oranına sahip pencereler; kütüphane hazırlığının yetersiz kapsadığı alanlar. Ağırlık %10.%62
- Referans kapsamıYakındaki referans dizilimindeki boşluklar; okumaların hizalanacağı bir dizinin bulunmadığı bölgeler. Ağırlık %10.%0
Dış bağlantılar
Gen kayıtları
Transkript
Protein
Bilgilerin kaynağı
- HGNC: genin sembolü, adı, diğer sembolleri ve konumu.
- NCBI ve EMBL-EBI'den MANE Select v1.5: transkript, ekson ve kodlayan dizi.
- NIST'ten Genome in a Bottle genom tabakalandırmaları: dizileme zorluk puanı.
Bu sayfayı alıntıla
Dante Labs. (t.y.). PPP6R1 geni: protein phosphatase 6 regulatory subunit 1. Erişim tarihi: 17 Ekim 2026, adres: https://dantelabs.com/tr/genes/ppp6r1
Dante Labs. PPP6R1 geni: protein phosphatase 6 regulatory subunit 1 [Internet]. [alıntı tarihi 17 Ekim 2026]. Erişilebilir adres: https://dantelabs.com/tr/genes/ppp6r1
Tek bir test. Ömür boyu yanıtlar.
$449'den başlayanÜcretsiz kargo · Sonuçlar 6–8 hafta içinde